La bacteria llega al estomago, se va hacia la pared, genera una gran cantidad de ureasa, produce amonio y bicarbonato, y neutraliza el pH ácido, produce un ambiente de amoniaco, secreta peptidasa, lipasa y fosforilasa A, penetra la capa protectora, atraviesa la mucosa por acción de la mucinasa, se adhiere a la pared del estomago, se multiplica, libera factor estimulador de gastrina y citotoxinas, vacuoliza las células del epitelio, se genera un proceso inflamatorio.