En contraste, las Salas Regionales operan de forma temporal, en periodos de elecciones federales. Sus cinco sedes corresponden a las cinco circunscripciones electorales: Xalapa, Toluca, Ciudad de México, Monterrey y Guadalajara. Resuelven las controversias electorales federales en su respectiva circunscripción: juicios de inconformidad, recursos de apelación y juicios de protección de derechos político-electorales de los ciudadanos.