O vírus da hepatite B age se misturando ao DNA de celulas hepaticas, em composição estão as proteínas e glicoproteinas HBsAg, HBcAg e HBeAg, estes são os principais antígenos dessa forma de vírus, e que induzem a formação de seus respectivos anticorpos dentro do corpo humano sendo estes os Anti - HBsAg, Anti - HBcAg e Anti - HBeAg, que são muito importantes no diagnostico sorologico de indentificação dos vírus da hepatite. Após a mistura do vírus com o DNA uma resposta imunologica vai ser iniciada com o intuito de destruir essas células infectadas, mas consequentemente vai destruir as células do fígado também o que leva a uma inflamação, que dependendo do seu período de permanencia pode levar a diferentes complicações
A sua fase aguda geralmente se cura sozinha e apenas de 5 a 10% dos casos chegam a fase crônica após 6 meses
As maiores complicações da fase crônica são o desenvolvimento de cirrose e neoplasias de fígado, além da formação de fibroses pela excessiva cicatrização do fígado