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MÉTODOS MOLECULARES PARA O ESTUDO DE MICRORGANISMOS DE SOLO, Os métodos de…
MÉTODOS MOLECULARES PARA O ESTUDO DE MICRORGANISMOS DE SOLO
Métodos baseados na análise de toda a comunidade
Metagenómico :heavy_check_mark:
Geralmente é usado quando estamos estudando
comunidades microbianas
nas quais um microrganismo não pode ser separado de outro. Por exemplo: pode haver duas bactérias crescendo juntas, então quando você pega a sequência de DNA, está obtendo a sequência de DNA de ambas ao mesmo tempo.
Metaproteômica
Metabolômica
Metatranscriptômica
Métodos baseados em análise de organismo representativo
Microarrays de DNA
PCR :check:
16S rDNA baseado em técnicas de PCR pode fornecer informações detalhadas sobre a
estrutura da comunidade de um ecossistema
em termos de riqueza, uniformidade e composição e pode ser usado para comparar diferentes espécies presentes em uma amostra, como composto.
Análisis de restricción de ADN ribosómico amplificado (ARDRA),
Amplificação aleatória de DNA polimórfico (RAPD)
REP-PCR (elemento BOX)
Análise de espaçador intergênico ribossomal (RISA)
Microarrays de proteína
FISH
Técnicas Fingerprinting
Biblioteca gênicas
Abordagens com base fenotípica
Contagem em placas
É uma forma tradicional de avaliar a diversidade microbiana junto com memórias viáveis. Atualmente, o trabalho está sendo feito com microscopia fluorescente, que conta entre 100 e 1000 vezes mais que a contagem do que na placa. Os resultados que eles nos fornecem são sobre o componente heterotrófico ativo da população.
Análise de éster metílico de ácido graxo (FAME) :heavy_check_mark:
A análise de ácidos graxos fosfolipídicos tem sido usada para avaliar a estrutura da comunidade microbiana, a determinação dos perfis de ácidos graxos fosfolipídicos nos fornece uma ampla medição da diversidade da comunidade microbiana em nível fenotípico. Os ácidos graxos constituem uma proporção constante da biomassa celular e podem diferenciar os principais grupos taxonômicos dentro da comunidade. A mudança no perfil de ácidos graxos pode representar uma mudança na população microbiana em uma amostra ambiental.
Os métodos de fingerprinting da comunidade microbiana baseados em PCR consistem em:
Primeiro, extração de ácido nucleico,
Segundo, amplificação de rRNA / rDNA
Terceiro, análise de produtos de PCR usando técnicas de impressão digital.
