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Metodologia para estudo da microbiota - Coggle Diagram
Metodologia para estudo da microbiota
Medição de processos microbianos específicos
Biomassa microbiana:
indica o funcionamento dos ecossistema e constituinte da parte da fração da matéria orgânica ativa do solo.
Uso de quocientes
quociente microbiano (qMIC):
Densidade populacional microbiana
quociente metabólico (qCO2):
Avalia a eficiência da biomassa e o estresse dos ecossistemas.
Análise de constituintes celulares
Métodos
Fumigação-extração:
Mais rápido (acelera em 10 dias a análise).
Fumigação-incubação
Análises de componentes celulares específicos
Atividade enzimática:
Relação com a presença de microrganismos; serviços ecossistêmicos; permite a correlação entre variáveis ambientais e indicadores
biológicos (Ex: beta glicosidase e carbono da biomassa)
Medida de ATP:
Pode ser levado a campo; reação com enzima luciferina; a proporção da luz é direta com a medida de ATP; processo rápido e é um processo caro.
Medição da taxa de respiração:
Avaliada a partir do consumo de O2 e/ou liberação de CO2; reflete a atividade microbiana total e representa a oxidação da matéria orgânica por organismos aeróbios
do solo.
Técnicas
Respirômetria:
Análise de várias amostras ao mesmo tempo e leitura contínua.
Titulação simples:
Liberação de CO2 (titulação NaOH + HCl)
Contagem de células microbianas (limitações):
Alguns microrganismos são incapazes de crescerem em meio
de cultura; os números obtidos podem estar superestimados; microrganismos de crescimento lento ou de colônias
microscópicas são ignorados e as populações microbianas mantém relações de interdependências impossíveis de serem mantidas em laboratórios.
Isolamento microbiano:
Técnica de plaqueamento:
Diferentes condições físico-químicas
Utiliza várias repetições
Trabalhoso
Enriquecimento quando desejado
Tempo de incubação diferentes
Contagem de células
Técnica de Conn:
Separa o material orgânico do inorgânico pela coloração
Lâmina enterrada:
Método qualitativo e permite a observações de interações microbianas
Técnica da microgota:
Acompanhamento com auxílio de lupa; meio semi-sólido e menos trabalhoso que a técnica seriada seguida de plaqueamento.
Corante fluorescente:
Permite observar determinadas estruturas celulares ou grupos
microbianos e pode diferenciar as células vivas das mortas.
Método do número mais provável:
Estima a população total ou específica; avalia estatisticamente a quantidade de microrganismos e necessita da presença de alguma característica metabólica.
Método de enriquecimento:
Isola grupos específicos de microrganismos
e necessita do conhecimento prévio das necessidades e
metabolismos básicos deste grupo