Na microscopia observam-se depleção de muco,
edema de mucosa e congestão vascular com hemorragia focal; como manifestações agudas, infiltrados de neutrófilos na mucosa, submucosa e no lúmen das criptas, denominados
abscessos de cripta, e também linfócitos, eosinófilos, plasmócitos e macrófagos como
resposta crônica na lâmina própria