Cerca de 95% dos casos de gastrite crônica são causados pela infecção por H. pylori, sendo uma das infecções mais comuns em seres humanos. A evolução clínica depende de aspectos do hospedeiro e da própria bactéria, em interação. A lesão do epitélio pode ocorrer diretamente, através da liberação de enzimas e toxinas, ou por meio da indução de resposta inflamatória do hospedeiro. Apesar da indução dessa resposta imune local, uma vez adquirida, a infecção persiste para sempre e raramente regride naturalmente. Depois da fase aguda, o padrão da gastrite vai depender do curso da infecção.