歐盟面對三主要恐怖組織：蓋達（Al-Qaeda）、地方性的民族主義團體、孤狼

以孤狼說明，其潛在危險性最高，與傳統聖戰團體未必有連結，亦無可辨別的特徵

如何使Muslims成功融入歐盟社會之中減少對立，是重要課題

在國際化之下，恐怖組織的發展與成員的吸收已突破領域的限制

恐怖主義的實踐，成本越來越低廉，如利用電腦、網路散播病毒等資訊攻擊

歐盟各國面臨恐怖主義之威脅，但各國政府對於起訴恐怖分子之態度與方式卻不盡相同

德國與比利時由於反恐法律尚未成熟完整，故難以拘留恐怖活動之相關份子

歐盟各成員國在調查、起訴、審判恐怖分子之制度與執法上均存有相當大的差異

歐盟警察組織難以發揮功能。成員國執法單位及安全情報機構並未提供相關情報

做為指導原則之「歐盟反恐戰略」支柱內容詳盡，卻面臨主權及人權的挑戰

歐盟雖然致力於建立成員國之反恐政策，架構水平、垂直、制度面的合作網絡，惟受限於國家間的主權因素，導致政策難以推行

進行跨國界調查行動時，成員國政府較常以雙邊協定進行合作，而非透過歐盟

反恐議題是跨部會、跨國界的，急需多國政府及諸多部門共同行動，導致反恐工作困難度及複雜度提高

當議題涉及安全政策或有關保護本國公民權益者，經常引發國家主權流失的爭議

防堵恐怖分子利用網路進行人才的招募及對激進份子、團體洗腦的行為

以「歐盟外部邊境安全署Frontex」建立對歐盟外部的危機分析

充分利用歐盟警察組織、歐盟司法合作組織加強執法及司法互助合作

奠基於相互承認的基礎上，採用「歐盟刑事偵查令狀指令」及「歐盟逮捕令」

防止恐怖分子取得武器及爆裂物，並切斷恐怖份子資金之來源，對於不明之洗錢行為應追捕