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Marcador Molecular, Evolución Ecología Bio-medicina Ciencias…

- - - - "Son características del ADN que
        pueden diferenciar a dos o más individuos, y son heredables de generación en generación" (Ríos, et al. 2009).
- - - - Es un punto de referencia en un cromosoma que puede o no corresponder a un gen
        
        Pueden detectarse en cualquier tipo de tejido
        
        Generalmente carecen de pleiotropía y y efectos epistáticos
        
        La variación genética detectada por estos marcadores puede
        usarse para:
        
        Realizar mapas genómicos
        
        Manipular rasgos
        
        Aislar loci genéticos
        
        Evaluar la diversidad genética de
        poblaciones.
        
        Aquellos basados en ácidos nucleicos tienen un alcance más poderoso
      - Se generan mediante técnicas de impresión única, capaces
        de muestrear las moléculas de ácidos nucleicos ricas en informacón
        
        Clasificación
        
        Microsatelites o secuencias simples repetidas (ssr)
        
        Son secuencias de ADN formadas de 1 a 4 pares de bases que presentan un elevado grado de polimorfismo en función del número de repeticiones
        
        La base genética del polimorfismo detectado en microsatélites se basa en la variabilidad del número de repeticiones en tandem y consecuentemente del tamaño del microsatélite amplificado en individuos de una especie.
        
        Por el alto polimorfismo que presentan por locus (multialelismo) se los considera los marcadores ideales para el mejoramiento en especies autógamas.
        
        Son marcadores
        son codominantes, genoma-específicos
        
        Aplicaciones
        
        Estudios de variación genética
        
        Análisis de linajes
        
        Análisis de sistemas reproductivos
        
        Estudios evolutivos: monitoreo de flujo genético, análisis de paternidad, introgresión, entre otros.
        
        Ventajas
        
        Tienen el más alto grado
        de polimorfismo
        
        segregan de manera mendeliana y son codominantes
        
        la presencia de un solo locus genético por microsatélite hace que la lectura de las bandas sea clara y fácil de interpretar
        
        son selectivamente
        neutros
        
        AFLP: polimorfismo en la longitud de fragmentos amplificados de DN
        
        Ventajas
        
        Presentan un alto poder de detección de la variabilidad genética. 2. El número de fragmentos (marcadores) resueltos por electroforesis que oscila entre 30 - 50 contra los 4 – 10 de RAPDs. 3. No requieren ninguna información previa de la secuencia para su análisis.
        
        Desventajas
        
        No es posible distinguir individuos heterocigotas por lo que se trata de un marcador dominante.
        
        requiere gran número
        de pasos para producir resultados.
        
        Aplicaciones
        
        1, Detecta múltiples loci polimórficos y es útil para generar huellas genéticas y mapeo
        
        Se ha utilizado para la caracterización
        de germoplasma
        
        Puede considerarse como una
        combinación de RFLP y RAPDs
        
        Consiste en la amplificación de fragmentos genómicos digeridos con enzimas de restricción, recurriendo al uso de cebadores de diseño aleatorio
        
        Consiste en 4 etapas (Picca et al. 2004):
        
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        Son marcadores que detectan dominancia
        
        SNP: polimorfismo de nucleótido simple
        
        Consiste en el análisis comparativo de un mismo fragmento de ADN en varios individuos, de modo que los marcadores SNP se identifican al localizar las sustituciones de bases dentro de la secuencia (Rios, et al. 2009)
        
        Aplicaciones
        
        Análisis de genes de herencia biparental.
        
        Análisis de diferencias genéticas entre subespecies.
        
        RAPD: polimorfismos de ADN amplificados al azar
        
        Son marcadores
        que amplifican aleatoriamente segmentos de ADN
        
        Se basan en la probabilidad estadística presentando sitios complementarios al oligonucleótido de 10 pares de bases (pb) a lo largo del genoma.
        
        Son dominantes,no pueden discernir los homócigos dominantes de los heterócigos para un segmento particular (Whitkus et al., 1994; Backeljau et al., 1995)
        
        Para su análisis se debe tener en cuenta que;
        
        Cada uno de los marcadores representa un locus mendeliano en el cual el marcador visible, el alelo dominante, está en equilibrio de HardyWeinberg con un alelo recesivo.
        
        2) los alelos marcados para diferentes loci
        no migran a la misma posición en el gel (Lynch y Milligan, 1994).
        
        Aplicaciones
        
        Elaboración de mapas genéticos
        
        Estudio de parentesco
        
        Análisis de estudio poblacional
        
        Ventajas
        
        Amplifican regiones tanto codificantes del ADN como las no codificantes
        
        Revelan niveles de variación más altos que los RFLPs e isoenzimas.
        
        Desventajas
        
        Presencia de bandas “erróneas” (artefactos)
        
        Reproducibilidad de los resultados.
        
        Comigración de bandas.
        
        Alelos errados o malinterpretados
        -Menos información genética por Locus