El quiste hidatídico se clasifica en cinco tipos:
Las características generales de qh1 y qh2 es que son activos, por contener los protoescólices viables; qh3 es de transición por dar inicio a una degeneración, y qh4 y qh5 son inactivos, ya que en ellos se presenta muy poca viabilidad. Puede haber estados intermedios en esta clasificación, ya que qh2 y qh3 presentan hidátides hijas, pero en este último ya existen señales de colapso y destrucción de la pared germinativa. Para que esto no se preste a confusión, muchos clínicos en sus informes sólo utilizan qh2 para aquellos que tienen hidátides hijas.