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PLASTICIDADE GENÔMICA E VARIAÇÃO DE FASE - Coggle Diagram
PLASTICIDADE GENÔMICA E VARIAÇÃO DE FASE
Variação de fase
Conceito
Mecanismo de regulação da expressão gênica
Mecanismo de resposta à mudança ambiental
Em procariotos gera um população diversificada
Característica reversível
Variação de fase x mutação
Variação reversível
Característica da população de células
A célula sofre variação e resiste a resposta imunológica
Há preservação de parte da população
Pode haver um retorno à fase inicial com o tempo
Mutação
Parte das células são mutadas e morrem devido a resposta imunológica
Parte das células não serão mutadas mas sobrevive à resposta imunológica
Há a eliminação do patógeno
Tipos
Mediada por inversão
Sistema liga/desliga
Garante a sobrevivência de algumas células
Mal pareamento devido a repetições
Sequência inalterada após replicação
Expressão gênica afetada
Erros durante replicação
Ganhos ou perdas unidade repetidas em sequências longas
Controle na expressão de genes associados a virulência
Metilação diferenciada
Gera fenótipos alterados sem alteração da sequência do DNA
EPIGENÉTICA
Mecanismos de transposição
Transposição replicativa
Uma cópia do transposon é transferida para o alvo
Transposon permanece intacto
Formação de co-integrado
Resolução do co-integrado
pode ocorre via recombinação
Alguns transposons codifica seu sistema de resolução
Resolvase
Transposição conservativa
Transposon enviado para o alvo
Deletado de sua origem
Ctrl X/ Ctrl V
Sequências móveis
Elementos transponíveis
Elementos genéticos com capacidade de se mover de um local para outro no genoma
Ubíquos
Ocorre em todas espécies
Procariotos
Cromossomo da célula
PlasmídeoC
Cromossomo do fago
Eucariotos
Mesmo ou diferentes cromossomos
Função
Sequências que atua na regulaçao da expressão gênica
Causa mutação
Molda principais mudanças do genoma
importante papel na evolução
Procariotos
Sequência de inserção
Mais simples
Codificam apenas a transposase
Transposase
Necessária para o movimento
SequÊncias repetidas invertidas nas extremidades
Encontrada na maioria das bactérias
Uma mesma bactéria possui diferentes seuqências de inserção
Podem ser encontradas em plasmídeos bacterianos
Causa instabilidade de plasmídeo
Pode alterar o fenótipo
Pouco ou nenhum benefício a bactéria
Pode ser replicativa
Reguladas
Transposons
Descoberto em todos procariotos e eucariotos
Explicação para aquisição de genes de resistência de plasmídeos
Estrutura
Similar as sequências de inserção
Estruturalmente mais complexos
Genes adicionais
Tipos
CLASSE I
Compostos
Possui uma sequência de inserção nas extremidades
Sequências repetidas indiretas + transposase
CLASSE II
Não compostos
Possui sequências repetidas indiretas nas extremidades e alguns genes no interior
Sequências podem transpor de forma independente
Pode ocorrer recombinação entre os elementos da sequência de inserção, causando deleção ou inversão
da região que os separar
Regulação da Transposição
Altos níveis de transposições pode ser algo inviável
Existem diversos mecanismos
Transposição em niveis baixos
Promotor fraco
Baixa afinidade com RNA polimerase
Genes fracamente expressos
Repressor da transcrição do gene transposase
Proteína TnpR de Tn3
Resolvase
Repressor
IS10
mRNA antisenso
Transposição replicativa aumenta quantidade de transposons ou is
Epigenética
Genoma é dinâmico
Características de multicelulares e unicelulares estáveis no decorrer de varias divisões celulares sem alteração do genoma
Importante para diferenciação celular
Permite expressões fenotipicas diferentes sem alteração do DNA
Mecanismos
Metilação
Modificações pós transducionais de histona
Posicionamento de nucleossomos
MicroRNAs