เชื้อ E.coli เป็นแบคทีเรียซึ่งเป็นสาเหตุที่พบบ่อยมากที่สุดร้อยละ 35-90 ของกระเพาะปัสสาวะอักเสบเฉียบพลันในผู้หญิง

เชื้อ S.saprophytocus เป็นแบคทีเรียที่พบบ่อยเป็นอันดับสองของกระเพาะปัสสาวะอักเสบเฉียบพลันในผผู้หญิงวัยรุ่นซึ่งพบได้ร้อยละ 10-20 และเชื้อแบคทีเรียที่พบตามผิวหนัง

การรักษากระเพาะปัสสาวะอักเสบแบบไม่ซับซ้อนคือให้ ATB 3 วันซึ่งจะมีประสิทธิภาพมากกว่าการรักษาแบบรับประทานยาปฏิชีวนะครั้งเดียว (single dose therapy) และมีประสิทธิภาพเทียบเท่ากับการรับประทานยาปฏิชีวนะระยะยาวมากกว่าขณะที่ผลข้างเคียงน้อยกว่าการให้ยาปฏิชีวนะเป็นเวลา 3 วันจะแนะนำสาหรับผู้ป่วยหญิงที่มีอาการมาไม่น้อยกว่า 7 วันแล้ว

อาจพบร่วมกับอาการปวดท้องน้อย(Suprapubic pain)

การตรวจปัสสาวะด้วยกล้องจุลทรรศน์ อาจพบเป็นหนองหรือมีแบคทีเรียปัสสาวะเป็นเลือด การเพาะเชื้อจากปัสสาวะถือเป็นการทดสอบเพื่อวินิฉัยหากมีผลเพาะเชื้อมากกว่าหรือเท่ากับ 102 cfu/ml บ่งชี้ว่าติดเชื้อ

พิจารณาส่งเพาะเชื้อปัสสาวะในกรณีไม่แน่ใจว่าเป็นกระเพาะปัสสาวะอักเสบเมื่อมีอาการสัมพันธ์กับการติดเชื้อระบบปัสสาวะแบบซับซ้อนหรือการติดเชื้อระบบปัสสาวะส่วนบนมีการติดเชื้อระบบปัสสาวะแบบเป็น ๆ หาย ๆ หรือรักษาให้ยาปฏิชีวนะแล้วเป็นใหม่และควรพิจารณาส่งเพาะเชื้อปัสสาวะก่อนการรักษา