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REGOLAZIONE GENICA - Coggle Diagram

- - - - sequenze promoter : a monte della prima tripletta codificante di un gene (ATG); TATA, CAAT, CACCC
      - sequenze enhancer: esercita un controllo a distanza, fa un ripiegamento a cappio
      - elementi cis: ripiegamenti della molecola di DNA; peptide a dito di zinco (atomo di zinco ripiega una catena aminoacidica); coiled coil (associazioni di più peptidi che lavorano in coppie); zip di laucina (residui di leucina che sporgono da tratti delle proteine coinvolte e che si agganciano tra loro come i denti di una chiusura lampo).
    - - presenza di gruppi chimici sulle molecole proteiche degli istoni;
      - L’ aggiunta di gruppi chimici ( metile, acetile, fosforile o altri più rari) agli amminoacidi determina una modifica dell’impacchettamento del DNA attorno agli istoni nei nucleosomi.
      - l’acetilazione degli istoni determina una maggiore facilità per gli enzimi della trascrizione di raggiungere i filamenti di DNA, aprirli e poi trascriverli in RNA
      - la metilazione (che insieme a specifiche proteine determina la formazione dell’eterocromatina) fa sì che i nucleosomi siano più compatti riducendo la quantità di DNA che sporge tra un nucleosoma e l’altro e impedendo agli enzimi di trascrizione di trascrivere il filamento
    - - meccanismo che inibisce la trascrizione del DNA legandosi ai singoli istoni; sulla cromatina
    - - si ha un gradiente di densità differente tra differenti regioni di DNA, in funzione di maggiore o minore capacità di formare le anse, ordinatamente organizzate su una nuova proteina detta Scaffold
      - diversi livelli di espressione
  - - - differenziano l’RNA messaggero trascritto da un certo gene al fine di essere utilizzato in tessuti differenti o in cellule fenotipicamente diverse dello stesso tessuto
      - gene che codifica per la calcitonina che dà prodotti diversi in relazione allo splicing e alla poliadenilazione alternativi a cui il trascritto primario può essere oggetto.
    - - sottrazione/ aggiunta di un uracile alla catena, alternativamente la sostituzione di una citosina con un uracile , ovvero (più raramente) la sostituzione di un adenina con una inosina
    - - caratteristico delle cellule batteriche al fine di proteggerle da virus
      - identificare la presenza di un DNA diverso da quello della cellula per modificarlo e degradarlo
      - capacità di un enzima associato a CRISPR (nella maggior parte dei casi Cas9)di correggere i danni sul DNA dovuti ad un’infezione di tipo virale
      - i due filamenti si appaiano e ciò richiama l’enzima Cas9 che taglia il tratto appaiato al filamento guida e lo sostituisce con un nuovo tratto di DNA stampato grazie alla emielica “sana”
    - - la durata dell’RNA messaggero nel citoplasma è regolata da quei meccanismi che proteggono l’mRNA come il capping al 5' della molecola e la poliadenilazione al 3’.
    - - un mRNA viene tradotto un certo numero di volte a seconda dei differenti tipi di cellula in cui questo è stato trascritto, per cui in alcune cellule viene tradotto più o meno velocemente e si produrranno più proteine, in altre cellule invece la sintesi avviene più lentamente con una minore produzione di proteine.
    - - i prodotti proteici non sono da subito funzionanti dopo la traduzione, bensì necessitano di maturazione e la velocità con cui avviene ci fa comprendere come una proteina prodotta da un gene che viene trascritto in mRNA riesca più o meno rapidamente ad agire in un tessuto rispetto che ad un altro.
    - - elemento fondamentale dell’epigenetica.
      - esprime l’effetto parentale
      - più studiato è quello basato sulla metilazione del DNA:
      - PATOLOGIE: Prader Willi, Angelman