Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

р е п л и к а ц и я - Coggle Diagram

- - - - отщепление пирофосфата
        
        нуклеотид
  - - - ладонь
        
        активный центр
      - пальцы
        
        связывают новый нуклеотид и отправляют в ладонь
      - большой палец
        
        закрепляет активный центр на матрице и праймере
      - катализ
        
        2 иона 2-х валентного металла (Mg) (за счет аспартата): располагает фосфаты и стабилизирует депротонированную гидроксильную
      - кинетическая коррекция
        
        карман активного центра по форме соответствует правильным парам оснований
        
        дискриминатор аминокислот от РНК-нуклеотидов
        
        остаток тирозина формирует стекинг-взаимодействие
        
        альфа-спираль изгибается и аргинин и лизин взаимодействуют
      - таутомерные сдвиги (вместо кето енол)
        
        самокорректирующие полимеразы (нужен праймер)
      - процессивность = сколько раз полимераза совершает каталитический цикл и не отваливается
    - - созревание тРНК у эукариот и амеб
      - добавляет к 5 концу нуклеотиды
    - - бактерии
        
        1: удаление праймера
        
        2: починка ДНК
        
        3: репликация хромосом
        
        4 и 5: починка (дополнительные)
      - эукариоты
        
        альфа: начало синтеза
        
        дельта (ведущая) и эпсилон (отстающая): репликация
        
        гамма: в митохондриях
        
        бета: починка
    - - закрепляет ДНК-полимеразу на ДНК
      - бактерии
        
        3 субъединицы
        
        домен = бета-лист и альфа-спирали с гидрофильными аминокислотами
        
        вода позволяет скользить
      - накладывание
        
        АТФ-зависимый погрузчик зажимов
        
        связывает с АТФ зажим
    - - тау-белки связываются с ДНК-полимеразами
- - - - фрагменты оказаки
    - - потом удаляется РНК-азой Н (гибридная)
        
        разрыв между последним и предпоследним нуклеотидом праймера
        
        5* экзонуклеаза удаляет последний
        
        ДНК-лигаза
      - у бактерий ДНК-полимераза 1 удаляет праймер, синтезирует и удаляет последний нуклеотид
        
        ДНК-лигаза
- - - - АМФ из АТФ и освобождают пирофосфат
    - - АМФ из НАД
- - - - угол отхождения зависит от нуклеотида
        
        гидролиз АТФ