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Biologie moléculaire - Coggle Diagram
Biologie moléculaire
Transcriptomique
RNAseq
Résultat : On obtient une analyse globale des ARN en séquençant de petites distances (50-70 nucléotides) en grande quantité
Micro-array
Résultat : les résultats obtenus se trouvent sur une puce de très petite taille. Cette puce contient l'ensemble des transcrits et on les observe dans des spots colorés où il y a eu lieu d'hybridation et on connait leur positions.
Limites : C'est une analyse globale de tous les ARN produits par une cellule, on ne peut donc étudier spécifiquement sur notre séquence d'intérêt puisqu'il n'y a pas de comparaison entre la situation t_0 et la situation après manipulation t_1
Northern Blot
Résultat : on obtient des tâches qui correspondent aux endroits où une sonde s'est hybridée. Au plus la tâche est grande, au plus il y a d'intensité
Limites: c'est une méthode qui n'est pas facile à mettre en applicatioin puisqu'il nous faut une grande quantité d'ADN de départ pour obtenir de meilleurs résultats avec cette méthode. Il y a également un problème de résolution puique le gel d'agarose limite le nombre de transcrits dans une même expérience (utilisation des sondes différentes). Il y également une limite avec ces sondes qui ne sont pas colorées et ne permettent pas d'avoir des distinctions des résultats.
Hybridation in situ
Résultat : Méthode de locatisation de l'expression d'un gène codant pour un récepteur via des sondes fluorescentes
TacMan PCR
Résultat : on obtient un graphique exponentielle (si positif) qui montre le principe de real time. Les molécules d'ADN sont amplifiées suivant les cycles dans l'opérateur de PCR. Un test est considéré comme positif si l'on dépasse le niveau de threshold et le nombre de cycle qui est nécessaire pour le dépasser est une valeur indicative car si elle est petite, alors on a beaucoup d'ARNm
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Protéomique
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Western Blot
Résultat: Cette méthode consiste à détercter des protéines via des anticoprs. La protéine est tout d'abord détectée par un 1e anticorps et ce dernier est ensuite détecté par un 2e qui est fluorescent