Ocurre por la exposición a los animales infectados o la exposición al agua contaminada con heces de animales infectados .
Después de la ingestión (y posiblemente inhalación) por un hospedador susceptible , se da lugar a la eclosión.
Los esporozoítos son liberados y parasitan las células epiteliales
El tracto gastrointestinal u otros tejidos del tracto respiratorio. En estas células, el parásito presenta la multiplicación asexual (esquizogonia o merogonia) y posteriormente la multiplicación sexual (gametogonia) produciendo microgametos (masculinos) y macrogametos (femeninos) .
Después de la fertilización de los macrogametos por los microgamentos, se desarrollan los oocistos y esporulan en el hospedador infectado. Se producen dos tipos diferentes de oocistos, unos de pared gruesa, que comúnmente son excretados por el hospedador, y los oocistos de pared delgada que están involucrados en la autoinfección. Los oocistos son infectantes al ser excretados, permitiendo la transmisión fecal-oral directa e inmediata.