Se generan cenizas: Cabe destacar que la quema de los residuos genera cenizas, algo que incrementa los costos operacionales. Además, las medidas de seguridad en la incineración deben ser elevadas, tanto por la temperatura como por la emisión de gases.
Se necesita una zona de almacenamiento: El espacio que ocupa es elevado, no solo por el volumen de la caldera, sino por los residuos que deben utilizar para generar energía. Muchas organizaciones deben destinar un espacio único para los residuos y para la caldera.
Mantenimiento específico: El mantenimiento de las calderas es único, necesitándose a empresas concretas y que están especializadas en mantener un buen estado de las instalaciones de biomasa.
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