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Bioinformática: su aplicación en genómica - Coggle Diagram
Bioinformática: su aplicación en genómica
Definiciones
Genómica: Técnicas y conocimientos aplicadas al estudio de los genomas completos
Tecnologías
1ra generación
Sanger
2da generación
Ilumina
3ra generación
PacBio
Metagenómica: Estudio del material genético de comunidades mixtas, aplicada a organismos microbianos
Implementadas para estudiar
Genomas completos
Estudio de enfermedades
Expresión de genes
Técnicas
Metabarcording
Amplificación de regiones conservadas y genes específicos
Shotgun
Secuenciación de todo el ADN para identificar genes y especies
Pasos de un estudio metagenómico
Predicción
Orphella
FragGeneScan
Prokka
Glimmer-MG
Montaje metagenómico
IDBA-UD
MetAMOS
Metavelvet
PHYSCIMM
LikelyBin
MetaWatt
CONCOT
Bases de datos
Wikipathways
MetaCyc
KEGG
InterPro
Compartir datos
MG-RAST
IMG/M
EBI Metagenomics
Transcriptómica: Estudia la transcripción de los genes
Implementa
Microarreglos de expresión (cDNA) - RNA-Seq scRNA-Seq