Pada pasien dengan ET gejala-gejala yang sering terjadi adalah gangguan mental (75%), defisit neurologik (70%), sakit kepala (50%), demam (45%), tubuh terasa lemah serta gangguan nervus kranialis. Gejala lain yang juga sering ditemukan yaitu parkinson, focal dystonia, rubral tremor, hemikorea-hemibalismus, dan gangguan batang otak. Medula spinalis juga dapat terkena dengan gejala seperti gangguan motorik dan sensorik di daerah tungkai, gangguan berkemih dan defekasi. Predileksi infeksi terutama pada great white junction, ganglia basal dan talamus. Onset dari gejala ini biasanya subakut
