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Transcripción, Dogma, image, Complejo Transcripcional - Coggle Diagram

- - - - Polimerasa RNA II: Transcribe RNAm. Localizada en el nucleoplasma y representa la actividad celular restante, sintetiza RNAhn.
      - Polimerasa RNA III: Transcribe RNAt y otros RNA pequeños
      - Polimerasa de RNA I: Transcribe RNAr. Reside en el nucleólo y contribuye en la mayor parte de las síntesis de RNA celular, en cuanto a cantidad.
    - - Enzima de estructura compleja con subunidades β, β’, σ y α cuya síntesis depende de un complejo control transcripcional y traslacional. La mayoría de RNA polimerasas bacterianas tienen la misma composición.
      - Responsable de la síntesis de todos los tipos de RNA en procariotas.
    - - Bacterias
        
        Sistema de escisión-reparación uvr
        
        Se elimina por mutaciones en el gen mfd, cuyo producto proporciona el ligamiento de la polimerasa de RNA a las enzimas Uvr
      - Eucariotas
        
        TFllH
        
        Solubiliza el DNA en el sitio dañado
        
        Puede vincularse con una cinasa y un complejo de reparación cuando encuentra DNA dañado.
  - - - Promotor medular: rodea el punto de inicio, es rico en secuencias G-C y cuenta con una secuencia corta rica en A-T
      - Elemento de control en flujo ascendente: su participación aumenta la eficacia del promotor medular
    - - Los promotores de genes 5S y de RNAt son internos y se encuentran en flujo descendente. Hay 2 tipos de promotor interno.
        
        Cada uno contiene una estructura bipartida en las que dos elementos de secuencia corta están separados por una secuencia variable
        
        Tipo 1 Secuencia de caja A, separada de una secuencia de caja C
        
        Tipo 2. Secuencia de caja A separada de una secuencia de caja B
      - Los promotores de genes del RNAsn, están en flujo ascendente.
  - - - En levaduras se presentan las secuencias activadoras en flujo ascendente, las cuales son secuencias análogas a los potenciadores. Estas actúan en cualquier orientación y a cualquier distancia, sin embargo solo en flujo ascendente. Tienen una función regulatoria
    - - El promotor puede tener regulación específica y el potenciador aumenta la eficacia del inicio
      - El promotor puede carecer de regulación específica y se activa solo cuando el potenciador más cercano es activado de manera específica
  - - - TAF: factores vinculados con TBF
      - TBP: proteína de unión a TATA
        
        Componente del factor de posicionamiento, necesaria para que cada tipo de polimerasa de RNA se una a su promotor
        
        Se une a la caja TATA en el surco menor del DNA
      - Se encarga de reconocer promotores de la polimerasa de RNAll
    - - Es el factor de encargo de los promotores de la polimerasa de RNA III
      - TFIIIA y TFIIIC son factores de ensamblaje, que facilitan la unión de TFIIIB en la localización correcta
    - - Cuando se une, la TFllD adquiere la capacidad de proteger una región que se extiende más adelante en flujo ascendente.
    - - Subunidad RAP74: tiene actividad helicasa de DNA, puede participar en la solubilización del DNA en el inicio.
      - Subunidad RAP38: se une con la polimerasa de RNA ll
    - - Tiene actividades enzimáticas: ATPasa, helicasa y cinasa. Participa en la elongación. Participa en la reparación de daños del DNA
    - - Requeridas para solubilizar el DNA y permitir el inicio del movimiento de la polimerasa
- - - - La RNA polimerasa esta formada por 5 subunidades; 2 subunidades α, 1 subunidadad β' y 1 subunidad ω que tiene como función la unión de ribonucleótidos trifosfato.
        
        La RNA polimerasa I transcribe RNAr.
        La RNA polimerasa II transcribe RNAm.
        La RNA polimerasa III transcribe RNAt.
  - - - A medida que la RNA pol se desplaza, desenrolla la hélice de DNA para exponer un segmento nuevo del molde. Los nucleótido se agregan de forma covalente al extremo 3´de la cadena creciente de RNA, lo que forma un híbrido de RNA-DNA en la región desenrollada, y atrás de la región desenrollada la cadena molde de DNA se vuelve a aparear con su pareja original para formal la doble hélice de DNA.
  - - - Los represores se desplazan, los operadores transcripcionales se unen a los promotores
    - - Los Factores de transcripción se unen al promotor y se inicia el proceso transcripcional
    - - Se acerca el dominio de activación con el dominio del promotor
        
        Dominio conector; Une el activador con el dominio de unión con el ADN
        
        Dominio activador; Activa el proceso de transcripción
        
        Dominio de unión con el DNA; Seleccionar la ubicación correcta para la transcripción, específico para el promotor
        
        Dominios de unión con el DNA
        
        Cremalleras de leucina
        
        Hélice-asa-hélice
        
        Segmento Hélice-giro-hélice
        
        Receptores de esteroides
        
        Segmento dedo de Zinc
  - - - Cuando se transcriben el RNA recién sintetizado adopta una estructura de "Horquilla" que desestabiliza el complejo RNA-DNA obligando a separarse de la RNA polimerasa.
      - En el mRNA eucarionte, al terminar la transcripción se tiene un pre- mRNA, por lo que se debe llevar a cabo un proceso llamado "splicing" para retirar los intrones y dejar solamente a los exones y de esta manera ya tener un mRNA maduro.
      - Esta secuencia es rica en Guanina y Citocina, situada en el extremo de los genes, seguidas por secuencias ricas en Adenina. Forma secuencias palíndromicas
- - - - Procariotas. La actividad de reparación es dada por el sistema de escisión-reparación uvr. Involucra al gen mfd.
      - Eucariotas. Mecanismo similar al de procariotas. Factor de transcripción TFIIH participa en la reparación
- - - - ARNm Procariota
        
        Estructura; Una estructura formada de los nucleótidos codificantes en una estructura de una sola cadena
        
        Ciclo vital; El ARNm se transcribe en el citoplasma y se traduce de forma simultanea, por lo que su tiempo de vida es de unos cuantos minutos
        
        Estabilidad; Inestable, por ello que el ARN ribosomal se une a éste inclusive antes de terminar el proceso de transcripción.
        
        Transporte; No requiere de un transporte especial, ya que de forma casi inmediata a su formación se traduce.
      - ARNm Eucariota
        
        Ciclo vital; El ARNm se transcribe en el núcleo celular y se le agrega un casquete metilado y una cadena de poliA para proteger las secuencias codificantes de la degradación en su paso del núcleo hacia el citoplasma para ser traducido
        
        Transporte; Debido a sus modificaciones que ocurren en el núcleo, la cadena de ARNm se hace estable y permite que pueda viajar del núcleo al citoplasma para poder traducirse. La membrana nuclear es permeable a éste, por lo que pasa a través de ella fácilmente.
        
        Estructura; Una estructura formada de los nucleótidos codificantes en una estructura de una sola cadena con un añadido de una cadena larga de poliA en el extremo 3’ y un casquete metilado en el extremo 5’.
        
        Estabilidad; Estable, por ello que se encuentra activo inclusive horas posteriores a su formación.