L’État subventionne la rémunération des assistants d’éducation, les bourses et aides, des fonds sociaux, l’achat de manuels scolaires pour les élèves et le projet d’établissement de l’EPLE. Les autres administrations publiques sont principalement l’Agence de services et de paiement (ASP) qui rémunère les personnels sous contrats aidés. Les collectivités territoriales versent aux EPLE diverses subventions. Les ménages contribuent au budget des EPLE en finançant en partie l’hébergement et la restauration. Quant aux entreprises, elles contribuent par le biais de la taxe d’apprentissage et de matériels cédés aux lycées professionnels. Les EPLE ont aussi des ressources propres tirées de la vente de services ou d’objets confectionnés par les élèves, la location de salles, les revenus financiers, les dons et legs.