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LAS MOLÉCULAS DE AGUA, LA QUÍMICA Y LA VIDA - Coggle Diagram
LAS MOLÉCULAS DE AGUA, LA QUÍMICA Y LA VIDA
INTRODUCCIÓN
EL AGUA
ASUMIR QUE EL AGUA ES VIDA
SIGUE SIENDO OBJETIVO DE INVESTIGACIÓN
DESCONOCEN SU RELACIÓN CAUSA/EFECTO
ESTRUCTURAS HECHAS POR ESTA
SON CONTINUOS OBJETOS DE ESTUDIO
RAZÓN:
MOLÉCULAS DE AGUA AGRUPADAS EN ESTRUCTURAS
DESVIADAS POR SIMETRÍA TETRAÉDRICA
MOLÉCULA SIMPLE
EL AGUA FORMA
LÍQUIDOS
ESTRUCTURAS AMORFAS
SÓLIDOS COMPLEJOS
MODELO UNIVERSAL SIMETRÍA TETRAÉDRICA
FIJA ESTRUCTURAS POLIMORFAS DEL ESTADO SÓLIDO
ÁTOMO DE OXÍGENO DE LA MOLÉCULA
COMO DOBLE ACEPTOR DE ENLACES H
CADA H
COMO DADOR DE ENLACES DE H
MAYOR DENSIDAD DE H2O SIENDO LÍQUIDO
COEXISTENCIA DE DOS MOLÉCULAS DE H2O
ESTAS INTERFIEREN EN LA ESFERA DE COORDINACIÓN DE OTRAS
SIN ESTAR UNIDAS POR PUENTES DE H
INTERPRETACIÓN DE AUTORES
OTROS AUTORES
COEXISTENCIA DE DOS MODELOS ES MEJOR PARA EL H2O COMO LÍQUIDO
DEDUCIDO POR EVIDENCIAS
ESTRUCTURALES Y ESPECTROSCÓPICAS
CIRSCUNSTANCIAS EXTERNAS
RESPONSABLES DE INTERCAMBIO ENTRE MODELOS
ALGUNOS AUTORES
PARTICIPACIÓN DE MOLÉCULAS DE H2O
COMPATIBLE CON MODELO TETRAÉDRICO
CONSIDERANDO ALTAS VELOCIDADES
FORMANDO NUEVOS ENLACES ENTRE MOLÉCULAS
MOLÉCULAS MOVIÉNDOSE EN ESTADO LÍQUIDO
CONOCER COMPORTAMIENTO DE H2O
ESENCIAL PARA PROFUNDIZAR EN
ENTRESIJOS DE BIOLOGÍA
ENTRESIJOS DE CIENCIAS ATMOSFÉRICAS
DOS MODELOS
UNO MANIFIESTA ENLACES FUERTES DE H
COHESIONAN ORDENAMIENTO TETRAÉDRICO
SEGUNDO MODELO
ENLACES DE H
NO EXISTEN O SON DÉBILES
NO ASOCIADOS A ORDENAMIENTO MOLECULAR DETERMINADO
INTERFASE ENTRE
AGUA LÍQUIDA
HACEN OPERATIVO A UNO DE LOS MODELOS
ASÍ EN EL ENTORNO DE LA INTERFASE
LAS MOLÉCULAS DE H2O SE ENCUENTRAN ALEJADAS ENTRE SÍ
RODEADAS POR MOLÉCULAS DEL DISOLVENTE NO-POLAR
COHESIÓN ENTRE ELLAS ES ALTA
DEBIDO A QUE LOS ENLACES DE H SON FUERTES
DISOLVENTE NO POLAR
MODELO UNLIKE
ENLACES DE H FUERTES ENTRE MOLÉCULAS DE H2O
COEXISTEN ORGANIZACIONES SUPRAMOLECULARES DISTINTAS
PRODUCIDO CUANDO
MOLÉCULAS DE H2O RODEAN A OTRAS IGUALES
IDENTIFICADO EN H-RMN POR
SEÑAL ESTRECHA A 4.8 PPM
OBSERVADA CUANDO SE USA D2O COMO DISOLVENTE
ENLACES DE H FUERTES
POR LA SIMETRÍA TETRAÉDRICA
SE ROMPEN Y FORMAN ALTA VELOCIDAD
IMPLICA MOVIMIENTOS MOLECULARES GRANDES
SUS MOLÉCULAS DE H2O
CONDUCIDAS EN CANALES O POROS
A MUY ALTAS VELOCIDADES
NO DIFUNDIBLES
SIN COSTE ENERGÉTICO
A TRAVÉS DE COMPACTOS DE MOLÉCLAS ORGÁNICAS
MODELO LIKE
ENLACES H INEXISTENTES O DÉBILES
ENTRE MOLÉCULAS DE LA ORGANIZACIÓN SUPRAMOLECULAR
PREFERENTE CUANDO MOLÉCULAS DE H2O
SE ENCUENTRAN RODEADAS POR MOLÉCULAS NO POLARES
AGUA COMO VAPOR TIENE CARACTERÍSTICAS DEL MODELO LIKE
OBSERVABLE A 0.5-2.0 PPM EN EL ESPECTRO DE H-RMN
LAS GOTAS DE H2O LÍQUIDO SE SUSPENDEN EN DISOLVENTE NO POLAR
CORRESPONSABLE DE FENÓMENOS COMO
PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS
RECONOCIMIENTO CELULAR
CAUSANTE DE
EFECTOS HIDROFÓBICOS
HIDRATACIÓN HIDROFÓBICA
ENLACES DE H INEXISTENTES O DÉBILES
MOLÉCULAS CON BAJA MOVILIDAD
EN GEOMETRÍA DESVIADA POR SIMETRÍA TETRAÉDRICA
COMPACTOS: SON PERMEABLES AL AGUA LIKE
AGUA LIKE NO ES CANALIZABLE
DIFUNDIDA EN CUALQUIER DIRECCIÓN EN ENTORNOS POLARES SIN USAR ENERGÍA
INTERCALACIÓN SUPRAMOLECULAR
PROVOCA QUE MOLÉCULAS DE H2O
FORMEN PARTE DE DE LA ESFERA DE COORDINACIÓN DE OTRAS
SIN ESTAR UNIDAS ENTRE SÍ POR ENLACES H
NATURALEZA UNLIKELIKE
DETERMINADA POR CONCENTRACIÓN DE H2O EN LA ESTRUCTURA
EN MODELOS ABIERTOS
UN ENLACE DE H FUERTE MINIMIZA
LA ENERGIA DEL ESTADO DE TRANSICIÓN
CONDUCE LA DISOCIACIÓN DE LA MOLÉCULA DE H2O
MODELO ANFÓTERO DEL AGUA
PROPORCIONA EL MARCO TEÓRICO
DONDE SE EXPLICA LA AUTOIONIZACIÓN DE
HIDRÓXIDO
IONES HIDRONIO
EN BAJAS CONCENTRACIONES
POR DISOCIACIÓN ESPONTÁNEA DEL H2O
LA ESTABILIDAD DE ESPECIES IÓNICAS GENERADA POR LA DISOCIACIÓN
GENERADA EN MODELO UNLIKE
1 more item...
EL IÓN DE HIDRONIO
SE ESTABILIZA EN AGUA SEGÚN UNA ESTRUCTURA ALTAMENTE SIMÉTRICA
EL AGUA EN LAS CIENCIAS ATMOSFÉRICAS
INTERPRETACIÓN DE MODELOS ESTRUCTURADOS CON AGUA DESORDENADA
PERMITE ASOCIAR LA ESTABILIDAD DE ESPECIES IÓNICAS GENERADAS POR DISOLUCIÓN
EN ESTRUCTURAS SIMÉTRICAS COORDINADAS POR ENLACES DE H
EQUILIBRIO DE DISOLUCIÓN
CALCULADO POR CO2
SE DESPLAZA HACIA LA FORMACIÓN DEL ANIÓN BICARBONATO
ION NO+
CATIÓN PRIMARIO MÁS ABUNDANTE EN CAPAS ALTAS DE ATMÓSFERA
SU HIDRATACIÓN E...
INSERCIÓN FORMAL DE MOLÉCULA DE H2O
PARA GENERAR
MOLÉCULA NEUTRA DE ÁCIDO NITROSO
OCURRE POR DISOCIACIÓN ESPONTÁNEA DEL H2O DE
SOLVATACIÓN Y ESTABILIZACIÓN DEL IÓN HIDRONIO RESULTANTE
DISOLUCIÓN DE CO2 Y EL IÓN NO+
OCURREN SOBRE MODELOS DE H2O DISTINTOS
SE EXPLICAN DE FORMA DISTINTA
PRIMER CASO
IONIZACIÓN POR DISOCIACIÓN DE ESPECIE NEUTRA
SEGUNDO CASO
TRANSFERENCIA DE IONIZACIÓN DE UNA ESPECIE IÓNICA
SOLVATACION DE CO2
DADA EN UNLIKE
AQUÍ LA DISOCIACIÓN DE H2O ES PROCESO PERMITIDO
SOLVATACIÓN DE NO+
DADA EN LIKE
OCURRE POR EXALTACIÓN DEL CARÁCTER DIPOLAR DE LA MOLÉCULA DE H2O
POR ESTA ESPECIE IÓNICA
SEGUIDO DE INSERCIÓN FORMAL DE HIDRÓXIDO
Y TRANSFERENCIA DE PROTÓN AL AGUA DE SOLVATACIÓN
ESTRUCTURA DE H2O EN MODELOS LIKE
DESVIADA DE LA ESTRUCTURA TETRACOORDINADA
MANTIENE UNA ORDENACIÓN ESTRUCTURAL QUE DEPENDE DE LAS CONDICIONES AMBIENTALES EN QUE SE ENCUENTRA
FASE INICIAL CONSISTE EN CRISTALIZACIÓN DE UNA PEQUEÑA GOTA DE AGUA
EL AGUA ENTRE LA BIOLOGÍA Y LA QUÍMICA
EL AGUA PARTICIPA EN LOS FENÓMENOS BIOLÓGICOS
PARTICIPA EN EL ENSAMBLAJE DE PROTEÍNAS
VARIABLES ESTRUCTURALES DESCONOCIDAS DEL AGUA
SON DESCONOCIDAS
ES COMÚN QUE LA PARTICIPACIÓN DEL AGUA DISMINUYA
RAZONES
RESULTADOS QUE LA BIOLOGÍA DETERMINA NO SON SOLO EFECTOS SIN ATENDER A LAS CAUSAS QUE LOS PRODUCEN
QUÍMICA ES UNA CIENCIA QUE RELACIONA CAUSA Y EFECTO
EJEMPLO: BIOLOGIA OBSERVA ESCENARIOS DONDE LAS PROTEINAS SE PLIEGAN O AGREGAN SUCEDE DIFUSION.
LA CAUSA SE EXPLICA CON CONCEPTOS AMBIGUOS
NO SE PUEDE CONOCER A NIVEL MOLECULAR UN PROCESO BIOLÓGICO
SI NO SE INVESTIGA COMO PROCESO QUÍMICO
SI NO SE DEFINEN LAS CONDICIONANTES CINÉTICO/TERMODINÁMICO
SOLO SE PUEDE ENTENDER EL CAUSA/EFECTO
EN EL FENÓMENO OBSERVADO
FENÓMENOS DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR DETERMINADOS POR LA BIOLOGÍA
OCURREN A NIVEL CELULAR
NECESITAN MEDIO ACUOSO
EMERGENTES CAUSA/EFECTO
PROCESO TERMODINÁMICO
CONDUCTOR A LA AGREGACIÓN DE BIOPOLÍMEROS
DEBE TENER CORRESPONDENCIA ESTRUCTURAL CON EL H2O
SI ES REVERSIBLE PUEDE SER REPRESENTADO
POR UNA ECUACIÓN QUE RELACIONE ESTRUCTURA Y ESTEQUIOMETRIA DEL PROCESO
(H2O()U) = (H2O)(L)
BALANCE ENERGÉTICO
DONDE SE COMPENSA LA GANANCIA EN ENTALPIA Y ENTROPIA
ESTE COMROMISO ACTIVA CONCEPTOS AMBIGUOS
EQUILIBRIO TERMODINÁMICO ENTRE AGREGADO MOLECULAR Y AGUA
DURANTE LA AGREGACIÓN MOLECULAR
(H2O)m(l))
REPRESENTA UN NÚMERO DISCRETO DE MOLÉCULAS
PARTE DE LA ESTRUCTURA MOLECULAR
REVERSIBILIDAD DE LOS EQUILIBRIOS
LAS MOLÉCULAS DE (H2O)m QUE RELLENAN LAS CAVIDADES
CUMPLEN DIFERENTES PAPELES
SEGÚN EL RELLENO DEL HUECO RESULTADO DE LA AGREGACIÓN
SEGÚN SU ENSAMBLAJE MOLECULAR
PRINCIPIOS DE REVERSIBILIDAD MICROSCÓPICA
RESUELVE LA INCERTIDUMBRE GENERADA
POR LA REVERSIBILIDAD DE LOS EQUILIBRIOS
PERMITE DISEÑAR MODELOS MOLECULARES
EN DONDE
INCORPORACIÓN DE AGUA
AGREGACIÓN DE MOLÉCULAS
SON CAUSA DE LA TERMODINÁMICA
PRIORIZAR A=B FRENTE A=C
PLEGAMIENTO DE MOLÉCULAS MODELO
ORDENADAS EN LA INTERFASE ENTRE EL AGUA Y UN DISOOLVENTE NO POLAR
CONDUCEN LA FORMACION DE ESTRUCTURAS POROSAS
CON PARTICIPACION DE MOLECULAS DE AGUA DE LA INTERFASE
DISPONER DE AGREGADOS DE MOLÉCULAS DE AGUA
EN CAVIDADES SIMILARES A LOS POROS NATURALES
PERMITE INVESTIGAR EN MODELOS DE DISEÑO
PARTICULARIDADES ESTRUCTURALES DEL AGUA
EN POROS DE DISTINTOS DIÁMETROS
CON MISMO CONTENIDO DE AGUA
DINÁMICA DEL AGUA AUMENTA CON EL DIÁMETRO DEL PORO
PERMITE
INVESTIGAR MODELOS ESTRUCTURALES DEL H20
CONFIRMAR RESULTADOS DE CÁLCULOS TEÓRICOS
EL AGUA SINTETIZA POROS
Y SE PIERDE CON EL TIEMPO
POR SU DIÁMETRO