Pada tahap perumusan masalah, siswa diminta untuk membuat pertanyaan-pertanyaan yang relevan terkait dengan hasil observasinya. Melalui kegiatan ini, siswa didorong untuk memahami masalah atau objek yang diamatinya. Pada tahap pengajuan hipotesis, siswa diminta membuat jawaban sementara berupa dugaan awal terhadap pertanyaan-pertanyaan yang dibuatnya pada tahap perumusan masalah. Pada tahap ini, siswa didorong untuk merefleksikan apa yang diketahuinya dan memilih pengetahuan yang sesuai untuk menjawab pertanyaan. Untuk membuat dugaan tersebut, siswa perlu mengingat, memahami, dan menerapkan pengetahuan yang dimilikinya. Pada tahap analisis data, siswa melakukan kegiatan menganalisis data yang diperolehnya pada tahap pengumpulan data. Kegiatan ini akan menunjang pemahaman siswa tentang konsep yang dipelajarinya. Pada tahap perumusan kesimpulan, siswa diminta untuk membuat kesimpulan tentang konsep yang dipelajari atau ditemukan dengan menggunakan kata-katanya sendiri dengan merujuk pada hasil analisis data yang diperolehnya. Dalam merumuskan kesimpulan terlebih menggunakan kata-kata sendiri, siswa harus memahami dengan baik hasil analisis data yang diperolehnya. Hal ini kemudian berdampak positif terhadap pengetahuan dan pemahaman siswa terhadap konsep yang ditemukan atau dipelajarinya.