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TECNOLOGIAS DE SECUENCIACIONGUAJA - Coggle Diagram

- - - - Tecnica que consiste en la generacion de nanoporos que mide la frecuencia de las corritente electrica de iones que pasan por los nanoporos, que por medio de la magnitud indicara el nucleotido que pasa por las fecuencias.
        
        Esta tecnica aun se encuentra en desarollo esperando llegar a las metas establecidas por los cientificos ya sea en cuanto a precio, cantidad y velocidad.
        
        Informacion y analisis rapidos datos disponibles en tiempo real
        
        Se espera que sea un precio accesible, barato**
        
        4500 nucleotidos aprox.(2014)
        
        Preparacion de bibliotecas facil y rapidamente, autmatizada y facil de usar y versatil
    - - esta tecnologia permite por primera vez la observacion de la sintesis de DNA, por una DNA polymerasa a medida que ocurre.
        
        Esta tecnologia ofrece largas lecturas a nivel de una sola molecula y un tiempo de obtencion de resultado rapido
        
        Cuenta con una longitud de lectura de hasta 5 KB
  - - - Alta calidad de las secuencias en fragmentos largos de hasta 900pb
        
        Es útil para secuencias individuales de fragmentos de DNA de plásmidos de bacterias o amplificado por PCR
    - - Elevado costo por base
        
        Lo que hace ineficiente para proyectos a gran escala como genomas completos o metagenomas
  - - - Metodo que mide la bioluminisencia producida en la enlongacion de la cadena complementaria de DNA, donde la enzima luciferina se convierte en oxiluciferina,generando un destello de luz captado por una camara.
        
        El destello de luz corresponde a un numero y tipo de nucleotido
        
        Costoso
        
        Lecturas de alrededor de 700 pb
        
        como funciona?
    - - Se utiliza un ion semiconductor que cada vez que se incorpora un nuevo nucleótido en la cadena, en síntesis, se libera un protón (H+) que modifica el pH
        
        Se repiten varios ciclos
        
        Cada uno de ellos con con la adición de un único nucleótido (A, T, G, C)
    - - Es un metodo de secuenciacion por ligacion donde se sustituye la enzima polimerasa por la enzima ligasa junto con una sonda con 2 bases conocidas y 1 fluroforo
        
        El flurofo se excitara por medio de un laser lo cual hara que se desprenda un foton que sera captado por el medidor de fluorescencia
        
        Emplea sondas de 8 nucleotidos, marcadas por 4 colores
        
        Resultados en formato FASTQ
        
        Lecturas cortas y problemas con secuencias palindromicas.
    - - es una secuenciación por síntesis
        
        su tiempo de corrida es de : 60 millones de Mega bases por dia
        
        sus costos son de:$0.6 por Mega base
        
        y su longuitud de lectura es de: De 50 a 150 pares de bases
        
        la tasa de error puede ser de: 0.5 a 1%