Bakteri yang sering ditemukan sebagai penyebab OMSK adalah bakteri aerob seperti Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Proteus sp, Klebsiella sp. Bakteri anaerob dalam jumlah yang minimal seperti Bacteroides, Peptostreptococcus, Proprionibacterium. Bakteri ini mungkin dapat masuk ke telinga tengah melalui perforasi membran telinga kronis.