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Núcleo, Síntese proteica, Síntese lipídica - Coggle Diagram

- - - - Externa
        
        Contínua com o RER
        
        Ribossomos aderidos
        
        Sintetiza proteínas
        
        Lançadas no espaço perinuclear
        
        Incorporadas às membranas do envoltório
      - Interna
        
        Sustentada pela lâmina nuclear
        
        Malha delgada de filamentos laminares
        
        A lâmina se interrompe somente à altura dos poros
        
        Alguma proteínas integrais de membrana servem como ancoragem
        
        Fundamental no momento da divisão celular
        
        Fosforilação auxilia a desmontagem e remontagem do envoltório
      - Espaço perinuclear
        
        Espaço entre a membrana interna e externa
    - - Servem como canais de comunicação entre o citoplasma e o citosol
      - Nucleoporinas
        
        Complexo do poro
        
        Constituído por
        
        Oito colunas protéicas
        
        Proteínas de ancoragem
        
        Proteínas radiais
        
        Reduzem o diâmetro do oríficio
        
        Fibrilas protéicas
        
        Íons e moléculas pequenas são transportados passivamente
        
        Macromoléculas (RNA e proteínas) demandam transporte ativo
        
        Encurtamento e adequação das proteínas radiais / movimento de diafragma
        
        Vetorial
        
        RNAm sai
        
        Proteínas residentes do núcleo entram (?)
  - - - Proteínas
        
        Relacionadas a transcrição e replicação do DNA
      - RNAs
      - Nucleosídeos
      - Nucleotídeos
      - Íons
  - - - 23 pares
        
        Cada cromossomo é uma única molécula de DNA
    - - DNA
        
        Genoma
        
        Proteoma
        
        Conjunto de proteínas
        
        Regula a expressão gênica
        
        Maior que o genoma
        
        Conjunto de genes
        
        Expressão depende do local e da necessidade da célula
        
        Universal
        
        É o mesmo para todas as espécies
        
        Especificidade
        
        Mais de um códon pode codificar o mesmo AA, mas o mesmo AA não pode ser codificado por códons distintos
        
        Proteção biológica
        
        Redundância (degeneração)
        
        Contínuo
        
        Sempre lido de 3 em 3 bases
      - Proteínas acessórias
        
        Histonas
        
        Proteínas não histônicas
    - - Histonas
  - - - Atua diretamente na síntese protéica
- - - - Comunicação do interior com o citosol
- - - - Menos corada
      - Cromossomos menos condensados
      - Genes Ativos
    - - Mais corados
      - Cromossomos mais condensados
      - Genes Inativos
      - Facultativa
        
        Condensada em uma parte da vida e descondensada em outra
        
        Hormônios sexuais secundários
      - Constitutiva
        
        Parte do material genético nunca vai transcrever algo
- - - - Não funcionais
    - - Direcionados pela sequência de AAs
      - Facilitados por chaperonas
    - - Importantes para a manutenção da estrutura terciária
      - Dissulfeto isomerase
    - - Gliocsidades
      - Manosidades
      - Glicosiltransferases
    - - Calnexina
      - Dependente de Ca
  - - - Brotam do elemento transicional
    - - Promove a variabilidade proteica
      - Forma o lisossomo
      - Exocitose
      - Fosforilação
      - Sulfatação
    - - Face cis
        
        Se funde com as vesículas de transição que vêm do RE
      - Face trans
        
        Libera as vesículas contendo material já processado
      - Cisternas médias
        
        Alterações diversas
  - - - Brotamento a partir de deformações de membrana
      - Endereçadoras
      - Descartadas antes da fusão
      - Clatrina
        
        Trans-Golgi -> lisossomos
      - COP I
        
        Cisternas Golgi -> outros locais
      - COP II
        
        RE -> Golgi
    - - GTPases monoméricas
    - - Secreção da maioria das moléculas
      - Ausência de sinal específico para iniciar
      - Transporte de macromoléculas em fluxo contínuo
    - - Produção de moléculas depende de sinal extracelular
      - Têm estoque a ser liberado rápido
        
        Neurônios
        
        Células endócrinas e exócrinas
- - - - Mutações com alteração de módulo de leitura
        
        Perde-se ou adiciona-se 1 ou 2 nucleotídeos
        
        Alteração radical na sequência de AA's
      - Mutações em sítios de corte / junção
        
        Alteração de íntrons removidos
        
        Exon
        
        O que é "relevante" para ser mantido na sequência
        
        Intron
        
        Removido durante o sliplicing
      - Expansão de repetições trinucleotídicas
        
        Doença de Huntington
        
        Mesmo códon se repete várias vezes
      - Sem sentido
        
        UAG, UGA,UAA
        
        1 base alterada no códon gera um AA de terminação
      - Com perda de sentido
        
        Triptofano
        
        1 base alterada no códon codifica um AA diferente
      - Silenciosa
        
        1 base alterada no códon ainda codifica o mesmo AA
    - - Prática
        
        Fatores de transcrição
        
        Específicos
        
        Facultativos
        
        Interagem com o regulador do gene
        
        Repressores
        
        Ativadores
        
        Desencadeiam ou freiam a transcrição do DNA
        
        Desorganizam os nucleossomas
        
        Basais
        
        Constitutivos: mesmo para quase todos os genes
        
        Natureza inespecífica
        
        Se unem à sequência TATA para iniciar a síntese do RNAm
        
        Necessários para o promotor
        
        Associação aos reguladores ou inibidores
        
        Átomos expostos nos sulcos do DNA
        
        Transcrição termina quando a RNA polimerase alcança a extremidade 3'
        
        Liberação da enzima
        
        Transcrito primário
        
        Metade RNA dos transcritos primários não completa sua síntese
        
        União dos nucleotídeos entre si
        
        RNA Polimerase
        
        III
        
        Síntese de RNAr 5s, RNAt, RNAcp e alguns RNAnp
        
        Medianamente sensível a a-amanitina
        
        II
        
        Síntese de RNAm e maioria dos RNAnp
        
        Muito sensível a a-amanitina
        
        I
        
        Síntese de RNAr 45s
        
        Insensível a a-amanitina
        
        Ribonucleotídeos se agregam um de cada vez
        
        Desnecessária a separação das duas cadeias de DNA por toda a sua extensão
        
        "Bolha" de transcrição
        
        Ocorre cópia de apenas uma das cadeias de DNA
        
        3' -> 5'
        
        Convencionalmente se diz que a transcrição avança na direção 5'->3'
        
        RNA não sintetizado corresponde com a cadeia não transcrita do DNA
        
        Sequência do gene se define por sua cadeia 5' -> 3'
        
        Antecipa que o RNA é sintetizado a partir da sua extremidade 5' e progride para a 3'
      - Teórica
        
        Como as duas cadeias de DNA estarão iguais, ambas poderiam ser transcritas
        
        União das duas cadeias do DNA
        
        Separação dos ribonucleotídeos dos desoxiribonucleotídeos do DNA e liberação do RNA
        
        União de cada ribonucleotídeo com seus dois vizinhos
        
        Pareamento dos 4 ribonucleotídeos com os 4 desoxiribonucleotídeos
        
        Ocorre de forma simultânea
        
        Separação da fita de DNA
    - - Códon = 3 bases nitrogenadas
        
        Rna: T => U
        
        AA's recebem nomenclatura tradicional
      - Ligações transitórias (não covalentes)
      - A - U - C - G => T - A - G - C
        
        Ligação entre dois nucleotídeos = fosfodiéster
        
        5' -> 3'
        
        Polarização da molécula
        
        Não ocorrem espontaneamente
        
        Catalisadas por RNA polimerase
    - - O conjunto de genes expressos em cada situação é variável
      - Reflete o estado fisiológico da célula
        
        Mostra como os genes estão "funcionando" em determinada situação
      - Os mecanismos mais importantes para controlar a atividade dos genes ocorrem a nível de transcrição
        
        Entretanto
        
        Pode-se produzir alterações pós síntese do RNA
        
        Durante a tradução em proteínas ou posterior degradação das mesmas
        
        Durante sua sobrevida no citosol
        
        Durante a exportação de RNAm ao citoplasma
        
        Durante o processamento do transcrito primário
      - Síntese de RNA a partir de DNA modelo
        
        Características do RNA
        
        Base pirimídica uracila
        
        Ribose
        
        Unifilamentar
        
        Tipos de RNA
        
        RNAs funcionais
        
        Desmitificam o dogma de que cada gene codifica uma proteína
        
        Nunca traduzidos
        
        RNAs pequenos
        
        RNAt
        
        Sua forma tridimensional é única para reconhecer seu AA específico
        
        RNAr
        
        RNAm
        
        Traduzidos em ptns
    - - Eucromatina
  - - - AA's essenciais
        
        Obtidos através da alimentação
        
        Grupo carboxila se liga à extremidade 3' do RNAt
      - RNAt ou moléculas adaptadoras
        
        Humanos: +/- 50 espécies
        
        Pode estar carregado ou descarregado
      - Anticódon
        
        3 bases que reconhecem o RNAm
      - Aminoacil-RNAt-sintetase
        
        Ligam AA aos RNAts correspondentes de forma específica
      - Rnam (molde)
      - Ribossomos
        
        Composição
        
        Duas subunidades
        
        RNAr
        
        Estabilizam o complexo de iniciação e demais componentes da tradução
        
        Proteínas
        
        Função
        
        Síntese protéica
        
        Localização
        
        Retículo endoplasmático rugoso
        
        Livres
    - - RNAt
        
        Hipótese da oscilação
        
        A trinca do anticódon não reconhece apenas um códon por pareamento. Se isso ocorresse, deveria haver 1 RNAt para cada AA
        
        As duas primeiras bases formam pares de bases Watson e Crick com ligação de hidrogênio
        
        Garante especificidade da codificação
        
        O pareamento do anticódon começa a partir da 3 base
        
        Ligações de Hidrogênio mais fracos
        
        A primeira base do anticódon pode parear com mais de uma base
    - - Ligação dos AAs a seus respectivos RNAts
        
        Citosol
        
        Aminoacil-RNAt-sintetase
        
        A duas ligações envolvidas têm alto gasto energético
      - Ligação do RNAm
        
        "Quepe" é reconhecido pelo ribossomo
        
        6 a 10 bases longe do código de iniciação
        
        AUG
        
        Sinaliza o início da proteína a ser sintetizada
        
        Demanda
        
        3 more items...
        
        Não formilada em eucariotos
        
        Com menor das subunidades ribossômicas
        
        Ao aminoacil-RNAt de iniciação
      - Alongamento
        
        Fatores de elongação
        
        Ingresso do aminoacil-RNAt no ribossomo
        
        Anticódon complementar ao segundo códon do RNAm
        
        Gasto de ATP e dois GTP
        
        Peptiidiltransferase
      - Término
        
        Ocorre quando o ribossomo alcança um códon de terminação
        
        UAA, UGA, UAG
        
        Depende de fatores de liberação
        
        Hidrólise da ligação peptidil-RNAt terminal
        
        Liberação do RNAt e do peptídeo livre
        
        Dissociação do ribossomo 70s
        
        Modificações pós traducionais
        
        Estrutura primária é alterada por
        
        Fosforilação
        
        Carboxilação
        
        Metilação
        
        Glicolisação
        
        Mudanças
        
        Variáveis
        
        Não previsíveis
        
        Podem ter impactos gigantes que não tiveram in vitro, in vivo
        
        1 more item...
        
        Papel estrutural ou modulatório
        
        Reconhecimento de glicanos
        
        Reconhecimento específico
        
        Endógeno
        
        2 more items...
        
        Exógeno
        
        2 more items...
        
        Pode ocorrer de forma
        
        Sutil
        
        Intensa
        
        Estrutura
        
        Estável
        
        Dobramento correto
        
        Resistente a proteases
        
        Importância
        
        Proteção contra proteases
        
        Adesão
        
        Papel na sinalização
        
        Regulação das interações proteína-proteína
        
        É influenciada por fatores
        
        Celulares
        
        3 more items...
        
        Ambientais
        
        3 more items...
        
        Proteína por si só
        
        4 more items...
        
        Formação de pontes dissufito
        
        Demais fatores
        
        Frequentemente resultantes de ações enzimáticas
        
        Também podem ocorrer durante a síntese e não somente no final
        
        Polissomos
        
        Exportação
        
        Proteínas que permanecem no citosol, são incorporadas ao núcleo, às mitocôndrias ou aos peroxissomos
        
        RE
        
        Golgi
        
        Exportação
        
        Proteínas que irão permanecer no próprio retículo, levadas para o golgi, formar lissomomos, compor membranas plasmáticas ou endomembranas ou serem exocitadas
        
        Forma final é dada pela chaperonas
        
        Evita que hajam ligações com proteínas não ligadas corretamente
        
        Auxilia na "moldagem"