Il maggiore è il Nilo. Altri fiumi importanti sono il Congo(confine tra Repubblica Democratica del Congo e Zambia), il Niger( attraversa il Mali, il Niger, costeggia il Benin, attraversa la Nigeria), e lo Zambesi(Zambia). Lungo la Rift Valley troviamo i laghi più importanti: il Lago Vittoria(Kenya, Uganda, Tanzania, Rwanda e Burundi), il Tanganica(Tanzania, Repubblica Democratica del Congo, Burundi e Zambia). Le cascate più spettacolari sojo le cascate Vittoria(lungo il corso del fiume Zambesi ).