Estudio de asociación de todo el genoma identifica loci para las concentraciones de enzimas hepáticas en mexicoamericanos: el consorcio GUARDIAN
El Consorcio Genetics Underlying Diabetes in Hispanics (GUARDIAN)
Enzimas Hepáticas
Se formó para identificar los determinantes genéticos de los fenotipos relacionados con la diabetes tipo 2 en pacientes hispanos
Se utilizan comúnmente para evaluar la función y la enfermedad hepáticas
Altas concentraciones de aspartato aminotransferasa (AST), alanina aminotransferasa (ALT) y gamma ‐ glutamil transferasa (GGT)
Son altamente heredables (20% ‐77%)
Se asocian con diversas afecciones, incluida la enfermedad del hígado graso no alcohólico
Compuesto por cinco familias
HTN-IR, IRAS-FS, MACAD, IRAS y Tripoide
Determinar si los loci en genes conocidos y nuevos estaban asociados con la variación en los niveles de AST, ALT y GGT en poblaciones de ascendencia mexicoamericana
Realización del primer GWAS de enzimas hepáticas en individuos de méxico-americanos.
Métodos
Variables de resultado y covariables
Estratificación de la población
Estudio de población
Genotipado
En estos análisis se utilizaron cinco cohortes de individuos autonotificados de ascendencia mexicoamericana, comprobados en diversas condiciones, que tenían medidas de las enzimas hepáticas y se utilizaron en estos análisis
Las concentraciones en unidades internacionales por litro de ALT, AST y GGT se determinaron mediante ensayos colorimétricos enzimáticos. La edad y el sexo fueron autoinformados.
Los SNP inferenciales primarios no mostraron ausencias diferenciales por rasgo, tenían una tasa de llamadas de SNP> 98% y no se apartaron de las expectativas de equilibrio de Hardy-Weinberg.
Las proporciones de la mezcla se incluyeron como covariables en las pruebas de asociación con las enzimas hepáticas
RESULTADOS
Estos mismos rs4823173, rs2896019 y rs2281135) fueron también las principales señales para los niveles de ALT en la misma dirección de efecto positivo, acercándose a la de genoma
Estos resultados demuestran que PNPLA3 , un locus previamente identificado con ALT, AST y NAFLD / NASH en otros ancestros, también está asociado con la función hepática en los hispanos
Los SNP en el gen PNPLA3 (rs4823173, rs2896019 y rs2281135) se asociaron significativamente con los niveles de AST