Estudio de asociación de todo el genoma identifica loci para las concentraciones de enzimas hepáticas en mexicoamericanos: el consorcio GUARDIAN

El Consorcio Genetics Underlying Diabetes in Hispanics (GUARDIAN)

Enzimas Hepáticas

Se formó para identificar los determinantes genéticos de los fenotipos relacionados con la diabetes tipo 2 en pacientes hispanos

Se utilizan comúnmente para evaluar la función y la enfermedad hepáticas

Altas concentraciones de aspartato aminotransferasa (AST), alanina aminotransferasa (ALT) y gamma ‐ glutamil transferasa (GGT)

Son altamente heredables (20% ‐77%)

Se asocian con diversas afecciones, incluida la enfermedad del hígado graso no alcohólico

Compuesto por cinco familias

HTN-IR, IRAS-FS, MACAD, IRAS y Tripoide

Determinar si los loci en genes conocidos y nuevos estaban asociados con la variación en los niveles de AST, ALT y GGT en poblaciones de ascendencia mexicoamericana

Realización del primer GWAS de enzimas hepáticas en individuos de méxico-americanos.

Métodos

Variables de resultado y covariables

Estratificación de la población

Estudio de población

Genotipado

En estos análisis se utilizaron cinco cohortes de individuos autonotificados de ascendencia mexicoamericana, comprobados en diversas condiciones, que tenían medidas de las enzimas hepáticas y se utilizaron en estos análisis

Las concentraciones en unidades internacionales por litro de ALT, AST y GGT se determinaron mediante ensayos colorimétricos enzimáticos. La edad y el sexo fueron autoinformados.

Los SNP inferenciales primarios no mostraron ausencias diferenciales por rasgo, tenían una tasa de llamadas de SNP> 98% y no se apartaron de las expectativas de equilibrio de Hardy-Weinberg.

Las proporciones de la mezcla se incluyeron como covariables en las pruebas de asociación con las enzimas hepáticas

RESULTADOS

Estos mismos rs4823173, rs2896019 y rs2281135) fueron también las principales señales para los niveles de ALT en la misma dirección de efecto positivo, acercándose a la de genoma

Estos resultados demuestran que PNPLA3 , un locus previamente identificado con ALT, AST y NAFLD / NASH en otros ancestros, también está asociado con la función hepática en los hispanos

Los SNP en el gen PNPLA3 (rs4823173, rs2896019 y rs2281135) se asociaron significativamente con los niveles de AST