La zona del cerebro más relevante en la discalculia a de ser el lóbulo parietal, concretamente el segmento horizontal del surco interparietal y el giro angular izquierdo. El segmento horizontal del surco interparietal se encarga de representar de forma interna las cantidades y las relaciones entre ellas. El giro angular se activa en aquellas tareas que requieren codificación verbal del número. Sin embargo, el lóbulo frontal también esta implicado, puesto que cumpliría con algunas funciones secundarias relacionadas con la resolución de problemas aritméticos, además de encargarse de la memoria de trabajo, y de organizar y planificar los pasos de la tarea, así como de comprobar y corregir errores.
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