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REGOLAZIONE ESPRESSIONE GENICA, DROSHA, DICER - Coggle Diagram
REGOLAZIONE ESPRESSIONE GENICA
CONTROLLO GENOMICO
CAMBIAMENTO DI TIPO SESSUALE IN LIEVITO
DECONDENSAZIONE CROMATINA
METILAZIONE DEL DNA
MODIFICAZIONE DEGLI ISTONI E PROTEINE DI RIMODELLAMENTO DELLA CROMATINA
CONTROLLO TRASCRIZIONALE
ELEMENTI DI CONTROLLO PROSSIMALE
CAAT BOX, GC BOX E OTTAMERO
I LORO FATTORI DI TRASCRIZIONE SONO DETTI REGOLATIVI/ TESSUTO SPECIFICI
ENHANCER E SILENCER
L'INTERAZIONE CON I GENI E' BASATA SU
RIPIEGAMENTO AD ANSA DEL DNA
PORTA UN EN/SI. SUL SITO DEL PROMOTORE
INTERVENTO DI COATTIVATORI
MEDIANO INTERAZIONE TRA ATTIVATORI E COMPLESSO RNA POLIMERASI
"MEDIATORE"
GLI ATTIVATORI SI LEGANO ALL ENHANCER CREANDO L'ENHANCEROSOMA.
I COATTIVATORI DEFORMANO IL DNA CREANDO L'ANSA (RIMODELLAMENTO CROMATINA E ACETILAZIONE ISTONI)
GLI ATTIVATORI SI LEGANO AL MEDIATORE, CHE FACILITA IL CORRETTO POSIZIONAMENTO DELA RNA POL II
SEQUENZE DI DNA CHE POSSONO STIMOLARE O INIBIRE LA TRASCRIZIONE
QUESTE SEGUENZE LEGANO DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE REGOLATIVI, CHIAMATI ATTIVATORI (EN) E INIBITORI (SI)
GLI INSULATOR IMPEDISCONO CHE QUESTI LAVORINO CONTEMPORANEAMENTE
ELEMENTI DI CONTROLLO DISTALE
ELEMENTI RESPONSIVI SUL DNA
ELEMENTI RESPONSIVI AGLI ORMONI
3 DOMINI: SITO PER L'E.R. SUL DNA, SITO PER L'ORMONE STEROIDEO, SITO DI ATTIVATORE TRASCRIZIONE
ESEMPIO CORTISOLO
FA PARTE DELLA FAMIGLIA DI GLUCORTICOIDI, STIMIOLA LA SINTENSI DI GLUCOSIO IN RISPOSTA A STRESS
IL CORTISOLO SI LEGA A RECETTORI DEI GLUCOCORTICOIDI PRESENTI NEL CITOSOL LEGATI A CHEPERONE HPS.
UNA VOLTA LEGATI CORTISOLO E RECETTORE, HPS VIENE RILASCIATO
IL COMPLESSO RECETTORE-ORMONE SI SPOSTA NEL NUCLEO E SI LEGA A ELEMENTI RESPONSIVI AI GLUCOCORTICOIDI (OVUNQUE QUESTI SI TROVINO)
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FATTORI TRASCRIZIONE ATTIVATI DALLA FOSFORILAZIONE
ESEMPIO cAMP
cAMP STIMOLA LA PROTEIN CHINASI A, CHE STIMOLANO LA FOSFORILAZIONE DI UN FATTORE DI TRASCRIZIONE CREB.
CREB SI LEGA A ELEMENTI DI RISPOSTA A cAMP SUL DNA (LE CRE)
IL COMPLESSO FOSFORILATO, RECLUTA UN COATTIVATORE TRASCRIZIONALE, IL CBP (CREB BINDING PROTEIN)
ESEMPIO STAT (fattore trascrizionale)
GLI STAT SONO FATTORI DI TRASCRZIONE CHE SONO ARRIVATI DAGLI INTERFERONI (ormoni glicoproteici)
L'INTERFERONE SI LEGA AL SUO RECETTORE E ATTIVA JAK (JANUS ATTIVATA CHINASI)
2.LA JAK CATALIZZA LA FOSFORILAZIONE DELLE STAT, CHE SI DIMERIZZANO E SI SPOSTANO NEL NUCLEO PER ATTIVARE LA TRASCRIZIONE
ELEMENTI RESPONSIVI ALLO SHOCK TERMICO
SONO FATTORI DI TRASCRIZIONE HEAT-SHOCK CHE SI ATTIVANO IN SEGUITO AD UN CAMBIAMENTO CONFORMAZIONALE, PROVOCATO DA UN AUMENTO DELLA TEMPERATURA, CHE PERMETTE IL LEGAME CON L'ELEMENTO RESPONSIVO
SERVONO AD ATTIVARE UN GRUPPO DI GENI CORRELATI CONTEMPORANEAMENTE
IL POSIZIONAMENTO DELLO STESSO ELEMENTO RESPONSIVO SU DIVERSI SITI, NE PERMETTE IL CONTROLLO SIMULTANEO
CONTROLLO POST-TRASCRIZIONALE
CONTROLLO MATURAZIONE RNA E ESPORTAZIONE DAL NUCLEO
SPLICING ALTERNATIVO (OLTRE VARIE MATURAZIONI)
FAVORITO DA PROTEINE REGOLATRICI E ENHANCER E SILENCER DELLO SPLICING CHE SI LEGANO A snoRNA
mRNA DIFETTI ESCONO PIU' LENTAMENTE, MENTRE ALTRI RESTANO NEL NUCLEOPLASMA FINO A QUANDO NON E' RICHIESTA LA LORO TRADUZIONE
EMIVITA mRNA
VARIAZIONI:
LUNGHEZZA CODA POLI A: PIU' E' LUNGA PIU' L'mRNA E' STABILE
SPECIALI CARATTERISTICHE DELLA CODA 3-UTR
REGIONI RICCHE DI AU DIMINUISCONO LA STABILITA'
BASSE CONCETRAZIONI DI FERRO RICHIEDONO RECETTERORE DELLA TRANSFERRINA
L'mRNA CHE TRADUCE PER IL RECCETTORE E' PROTETTO DALLA PROTEINA CHE SI LEGA AD IRE, NELLA REGIONE IRE UTR, IN MODO TALE CHE GLI ENZIMI CHE DEGRADANO L'mRNA NON POSSONO AGIRE
AD ALTE CONCENTRAZIONI DI FERRO INVECE, LA PROTEINA CHE LEGA IRE E' INATTIVA PERCHE' LEGATA AL FERRO, E QUINDI GLI ENZIMI DEGRADATIVI POSSONO ACCORCIARE LA CODA.
IN SEGUITO LA DEGRADAZIONI POTRA' AVVENIRE IN SENSO 3'--5' OPPURE 5'--3' DA ESONUCLEASI
TRANFERRINA= PRINCIPALE PROTEINA ADIBITA AL TRASPORTO DEL FERRO
CONTROLLO SULLE PROTEINE
DIFFERENTI MECCANISMI: ALTERAZIONI STRUTTURALI (REVERSIBILI E IRREVERSIBILI), ATTIVITA' DELLA CHEPERONE, INIDIRIZZAMENTO INTRA-EXTRA CELLULARE, INTERAZIONE CON IONI O MOLECOLE REGOLATIVE, VELOCITA' DI DEGRADAZIONE
DEGRADAZIONE
UBIQUITINAZIONE
LEGAME TRA UNA PROTEINA E UBIQUITINA, MEDIATO DA
ENZIMA CHE ATTIVA L'UBIQUITINA (E1)
ENZIMA CHE CONIUGA L'UBIQUITINA (E2)
UBIQUITINA LIGASI (E3)
FORMAZIONE DI CATENE DI UBIQUITINA, CHE FUNGONO DA SEGNALE PER I
PROTEASOMI
OGNI PROTEASOMA E' FORMATO DA PROTEASI, ATPasi, SITO DI LEGAME PER L'UBIQUITINA
SUMO (small ubiquitin-related MOdifiers)
SVOLGONO UN ATTIVITA' MOLTO SIMILE ALL'UBIQUITINA
CONTROLLO TRADUZIONALE
ESEMPIO EME E GLOBINA
INIBITORE CONTROLLATO DALL'EME (HCI)
ALTE [EME]
HCI INATTIVO
BASSE [EME]
HCI ATTIVO
FOSFORILA eIF2, ANDANDO A BLOCCARE LA TRADUZIONE
LA SINTESI DI GLOBINA E' NECESSARIA SOLO SE EME E' DISPONIBILE
FERRITINA (PROTEINA PER IMMAGAZZINAMENTO FERRO), CONTROLLATA DALLA CONCENTRAZIONE DEL METALLO
LA REGIONE UTR 5' FORMA UNA FORCELLA RICHIESTA PER LA INIBIZIONE DELLA TRADUZIONE DELLA FERRITINA
BASSE [FERRO]
LA PROTEINA CHE SI LEGA ALL'IRE SI UNISCE ALL'IRE FORMANDO LA FORCELLA, E INIBENDO LA TRADUZIONE DI FERRITINA
ALTE [FERRO]
LA PROTEINA CHE LEGA L'IRE SI TROVA LEGATA AL FERRO, E QUINDI INIBISCE LA FORMAZIONE DELLA FORCELLA, PROVOCANDO LA TRADUZIONE DELLA FERRITINA
miRNA (micro)
RNA A SINGOLO FILAMENTO (20-22 NUCLEOTIDI)
HANNO IL COMPITO DI SILENZIARE L'ESPRESSIONE DEI GENI DI CUI SONO COMPLEMENTARI SULL mRNA
miRNA PRIMARI (pri-miRNA)
PRECURSORI DEL miRNA (pre-miRNA)
miRNA MATURI
SI COMPLESSANO CON PROTEINE E VANNO A UNIRSI ALLA SEQUENZA COMPLEMENTARE SULL'mRNA, PROVOCANDO L'INIBIZIONE DELL'ESPRESSIONE GENICA
DROSHA
DICER