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La segunda expedición de Colon vino con 19 buques, otros señalan que con 13 buques y una cantidad de 1200 hombres.Vienen: pilotos, labradores, carpinteros, albañiles, entre otros. Más una representación religiosa de seis miembros encabezados por el Padre BoilSe ordenó traer: Caña dulce, caballos, cerdos, semillas de varias plantas, etc, y mercancías para el intercambio tales como: espejos, cascabeles, paños, bisuterías, medicinas, instrumentos de labranzas y municiones de guerra.
Esta segunda expedición salió de España el 25 de septiembre de 1493 y llegó a las nuevas tierras el 22 de noviembre de 1493.
Próximo al río Baja bonico, hace construir el primer asentamiento, que primero llamó Santísima Trinidad y luego le denomino La Isabela. Luego de un reconocimiento y ordenamiento de la isla Colon establece el tributo en el que todo aborigen mayor de 14 años tenia que entregar un cascabel flamenco lleno de polvo de oro o 25 libras de algodón.Así se inicia el sistema de Colonización establecido por Colón.