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CAP 12 - Coggle Diagram

- - - - utilizza H2O2 perossidare altri substrati tramite reazione perossidativa (nel fegato e rene)
        
        Sub=formaldeide e alcol
        
        sub=acido formico
      - quando H2O2 è in ecesso, la converte in acqua
  - - - viene esportato dai perossisomi nel citosol per reazioni biosintetiche
  - - - perossisomi che trasformano grassi in zuccheri (processo chiamato CICLO DEL GLIOSSILATO)
      - non ci sono nelle cellule animali
  - - - Ser-Lys-Leu
    - - 6 perossine di forme diverse formano un traslocatore nella membrana del perossisoma
      - la perossina Pex5 riconosce il segnale di importazione presente al C-terminale portando il carico all'interno del perossisoma e poi lo rilascia, ritornando nel citosol
      - PEx3 e PEx15 seguono la reazione di gemmazion
      - Pex1 e Pex6 creano un ATPasi xhe utilizza l'energia dell'ATP per aiutare Pex5 a essere rllasciato dai perossisomi
    - - malattia umana in cui si ha un deficit di perossisomi
      - dovuta a una mutazione che codifica per Pex5
- - - - costituiti da 2 membrane concentriche
        
        membrana interna - forma le creste e racchiude lo spazio della matrice
        
        le creste dividono la membrana interna in 2 domini
        
        membrana esterna - a contatto con il citosol
  - - - equivalente dello spazio della matrice
  - - - trasferisce proteine attraverso la membrana esterna
      - importa le proteine mitocondriali codificate nel nucleo
      - riconosce la sequenza segnale N-terminale, che viene poi trasportata su TIM23
      - non ha le porine
      - aiutato da Mia40
    - - TIM22
        
        media l'inserzione di una classe di proteine della membrana interna, compresa quella che traspprta ADP, ATP e fosfato dentro e fuori dai mitocondri
      - TIM23
        
        inserisce proteine trasmembrana nella membrana interna
        
        trasporta proteine solubili nello spazio della matrice
        
        lega un complesso che contiene Hsp70
      - trasferiscono proteine attraverso la membrana interna
    - - trasferiscono le proteine a barile Beta
      - si occupa di smistamento e assemblaggio
      - legano le porine
      - analogo al complesso BAM
    - - si occupa dell'attività ossidativa del citocromo
  - - - fuori dai mitocondri
      - nello spazio della matrice
- - - - ci sono 2 membrane concentriche
        
        MEMBRANA NUCLEARE INTERNA
        
        racchiusa dalla membrana nucleare esterna
        
        contiene
        
        proteine specifiche
        
        siti di attacco per i cromosomi
        
        lamine nucleari
        
        danno supporto strutturale (sostegno) all'involucro nucleare
        
        siti di ancoraggio per cromosono e citoscheletro
        
        MEMBRANA NUCLEARE ESTERNA
        
        in continuità con il RE
        
        coatellata da ribosomi per la sintesi proteica
        
        trasporto è selettivo
        
        hanno composizioni proteiche differenti
  - - - NUCLEOPORINE
        
        composte da pochi tipi di domini proteici ripetuti
        
        disposte a gruppi di otto con simmetria circolare
        
        3 tipi differenti
        
        nucleoporine impalcatura
        
        formano strutture a strati dell'anello
        
        correlate a complessi proteici che rivestono le vescicole tipo CLATRINA e PROTEINA DI RIVESTIMENTO COPII
        
        nucleoporine che rivestono il poro centrale
        
        proteine stransmembrana dell'anello che attraversano l'involucro e ancoranp il NPC all'involucro stesso
    - - proteine fino a 60000 dalton possono passare per diffusione passiva
  - - - codificate da una famiglia di geni correlati
      - ciascun gene codifica una proteina RECETTORE che può legare e trasportare un gruppo di proteine contenenti il segnale di localizzazione
    - - proteine CARGO
        
        la proteina CARGO 4 ha bisogno di una proteina adattatrice per legarsi al recettorie di importazione
    - - le proteine adattatrici possono formare un ponte tra i recettori di importazione e i segnali di localizzazione
    - - si legano ai segnali di loc, sulla proteina da trasportare
      - si legano alle ripetizioni fenilalanina-glicina (FG)
        
        Le FG si trovano nelle fibrille citoplasmatiche
        
        compiti
        
        formano una barriera di permeabilità alle grandi macromolecole
        
        interagiscono tra loro debolmente, danto una struttura gelatinosa al groviglio
        
        formano siti di attacco per i recettori di importazione nucleare
    - - si legano, dissociano, rilegano alle sequenze FG
      - possono saltare da una nucleoporina a un'altra per attraversare i complessi dei pori nucleari
  - - - SEGNALI DI ESPORTAZIONE NULCEARE
        
        si legano ai recettori di esportazione
      - RECETTORI DI ESPORTAZIONE NUCLEARE
        
        funzionano al contrario dei recettori di importazione nucleare
        
        detti ESPORTINE
        
        sono strutturalmente correlati ai recettori di importazione - si pensa siano evoluti dalla stessa famihlia, quelle delle CARIOFERINE (famiglia di recettori di trasporto nucleare)
        
        si legano
        
        proteine dei NPC
        
        guidano il loro carico fino al citosol
        
        segnale di esportazione
  - - - Ran-GPD
        
        presente nel citosol
        
        proteina che attiva la GTPasi
        
        GAP
        
        innesca l'idrolisi per convertire Ran-GTP in Ran-GDP
        
        si lega alle ripetizioni FG nelle nucleoporine del canale dell'NPC
        
        idrolizza GTP dal nucleo a citosol, convertendolo in Ran-GDP che si dissocia dal recettore
      - Ran-GTP
        
        presente nel nucleo
        
        fattore di scambio della guanina
        
        GEF
        
        legata alla cromatina (infatti la cromatina delle cellule mitotiche è circondata da una nucola di Ran-GTP)
        
        converte Ran-GDP in Ran-GTP
        
        agisce da marcatore posizionale per la cromatina durant ela divisione cellulare
        
        promuove l'attacco del carico al recettore di esportazione
        
        si attacca ai recettori di importazione e se portano un carico di molecole l'accarro ai Ran-GTP provoca il rilascio del carico dai recettori di importazione nel nucleo
        
        importante dell'assemblaggio del fuso mitotico in una cellula in divisione
  - - - le lamine sono proteine dei filamenti intermedi che polimerizzano in un reticolo bidimensionale
      - la lamina interagisce con la cromatina, la quale interagisce con proteine integrali di mambrena
      - le lamine sono presenti solo nelle cellule dei metazoi
    - - nel corso della mitosi, l'involucro si riuassembla sulla superficie dei cromosomi figli
    - - controlla l'espressioni degli enzimi del colesterolo
    - - lega il colesteroll
  - - - il loro equilibrio è dato dalle velocità di importazione e esportazione. CAmbiando questa velocità, si cambia la localizzazione di un proteina
        
        se velocità di importazione> esportazione, la proteina si troverà nel nucleo e viceversa
    - - proteina che si trova nel citosol in uno stato fosforilato se la cellula t è a riposo
      - se le cellule T sono attivate, la concentrazione di Ca aumenta
        
        con Ca2+ alto, la proteina fosfatasi calcineurina si lega a NF-AT e la defosforila
        
        il complesso di NT-AT e calcineurina viene quindi importato nel nucleo dove NF-AT attiva la trascrizione di nuomerosi geni necessari per l'attivazione delle cellule T
    - - SCAP
        
        proteina di membraa che lega il colesterolo
      - SREBP
        
        regolatore trascrizionale latente che controlla l'espressione degli enzimi biosintetici del colesterolo
        
        è ancorato sulla membrana del RE
- - - - 2 tipi di proteine sono importante nel RE
        
        Proteine Transmembrana
        
        vengono importate attraverso la membrana e vi rimangono immese
        
        Proteine solubili in acqua
        
        vengono direttamente importate nella membrana RE e lasciate nel suo lume
      - le proteine vengono importate tramite SEQUENZE SEGNALE DEL RETICOLO ENDOPLASMATICO
        
        la proteina viene tagliata da PEPTIDASI del segnale
      - durante questo processoil ribosoma attaccato chiude il traslocatore
      - la sequenza segnale è guidata da
        
        Particella di riconoscimento del segnale SRP
        
        fa da navetta tra il citosol e il RE
        
        famiglia costituita da 6 catene polipeptidiche legate ognuna a una molecola di RNA
        
        ha 8 o più amminoacidi non polari al centro
        
        presenti in tutte le cellule
        
        il sito di legame è ribestito da metionine
        
        ha u dispositivo di sicyrezza per idrolasi secrete e lisosomiali
        
        contengono domini che legano GTP e durante la sua idrolisi forse si hanno cambiamenti conformazionali
        
        riconosce ed evidenzia un amminoacido che esce da un ribosoma
        
        recettore per SRP
        
        proteina integrale di membrana nel RE ruvido
        
        contengono domini che legano GTP
        
        durante questo processo di traslocazione si formano 2 classi di ribosomi
        
        ribosomi liberi - sintetizzano tutte le proteine codificate nel genoma nucleare
        
        ribbosomi attaccati alla membrana - sul lato citosolico, sono impegnati nella sintesi proteica
        
        Poliribosomi - il ribosoma si lega a una molecola di mRNA
  - - - poche regioni
      - epatocita- produice particelle lipoproteiche
      - citocromo 450 - effettua reazioni di detossificazione
      - presente nelle cellule muscolari, si chiama Reticolo sarcoplasmatico
      - connesso a delle cisterne
    - - facili da purificare
      - lisci e ruvidi
        
        hanno densità diverse (lisci poco densi)
        
        sono sedimentati dall'equilibrio di saccarosio
      - frammenti di RE (piccole vescicole-100,200nm)
      - assumono e rilasciano Ca2+ e sintetizzano lipidi
  - - - 3 subunità
        
        beta
        
        più piccole, irrilevanti
        
        gamma
        
        alfa
        
        alfa eliche attraverso le quali la catena polipeptidica può attraversare a membrana
        
        controlla il poro
        
        tiene il traslocatore chiuso quano è a riposo
      - il poro può aprirsi anche lungo giunzioni laterali
      - nelle cellule eucariotiche 4 complessi Sec61 formano in grande complesso traslocatore
        
        a questo traslocatore possono essere aggiunti enzimi come OLIGOSACCARIDE TRASFERASI e la PEPTIDASU DEL SEGNALE
        
        traslocatore e componenti accessorie formano un
        
        TRASLOCONE
- - - - NUCLEO
        
        contiene il genoma e si occupa della sintesi e trascrizione del DNA e RNA
      - RETICOLO ENDOPLASMATICO
        
        RE ruvido
        
        presenta i ribosomi sulla superficie che sono implicati nella sintesi delle proteine
        
        RE liscio
        
        non sono presenti i ribosomi
        
        le proteine appena sintetizzate passano nel RE
        
        si occupa anche della produzione dei LIPIDI per tutta la cellula
        
        deposito degli ioni Ca+
        
        si estende dal nucleo in tutto il citoplasma
      - APPARATO DEL GOLGI
        
        riceve le proteine e i lipidi prodotti dal RE
        
        consiste di pile organizzate in compartimenti a forma di disco
        
        CISTERNE del Golgi
        
        invia le proteine e lipidi ricevuti verso altre destinazioni nella cellula
        
        modifica covalentemente le proteine durante il trasporto
        
        posto vicino al nucleo e al RE
      - LISOSOMI
        
        contengono enzimi digestivi
        
        degradano organelli intracellulari morti e particelle assunte dall'esterno tramite endocitosi
      - CLOROPLASTI E MITOCONDRI
        
        si occupano della respirazione cellulare
        
        generano ATP usato nelle reazioni biochimiche
        
        Cloroplasti- sono una versione dei PLASTIDI (si trovano nelle piante, alghe, protozoi)
        
        contengono un loro genoma
      - PEROSSISOMI
        
        compartimenti vescicolari
        
        contengono enzimi utilizati nelle reazioni ossidative
      - ENDOSOMI
        
        partecipano all'endocitosi
        
        tutti i materiali endocitati passano da loro
      - CITOPLASMA
        
        contiene tutti gli altri organelli citoplasmatici
        
        citosol
        
        sito della sintesi e della degradazione delle proteine
        
        svolge il metabolismo intermedio delle proteine
        
        reazioni in cui piccole molecole sono degradate e altre sono sintetizzate
  - - - RE, apparato del Golgi, endosomi, lisosomi, perossisomi, vescicole di trasporto
        
        agiscono nelle vie secretoria ed endocitica
      - mitocondri
      - Nucleo e citosol
        
        comunicano attraverso i Complessi dei pori nucleari e sono topologicamente continui
      - plastidi
    - - evoluti da batteri che sono stati inglobati da cellule con le quali viveavno i simbiosi
      - il lume si è evoluto dal citosol batterico
      - hanno doppia membrana come i batteri da cui derivano
  - - - traslocazione proteica
        
        spazio topologicamente distinto
        
        proteine traslocatrici di membrana trasportano direttamente le proteine soecifiche
        
        dal citosol al RE, ai mitocondri e perossisomi
      - trasporto vescicolare
        
        compartimento topologicamente equivalente
        
        le vescicole si caricano di molecole provenienti dal lume di un compartimento e si distaccano dalla sua membrana, le trasportano al secondo compartimento e si fondono con la seconda membrana
        
        dal RE all'apparato del Golgi
      - trasporto regolato
        
        fra citosol e nucleo
        
        attraveso pori nuleari che servono da cancelli selettivi
        
        spazi topologicamente equivalenti
    - - SEGNALI DI SMISTAMENTO
        
        se la proteina NON li ha, rimangono nel citosol come residuo permanente
        
        se li hanno dirigono il trasporto verso specific organelli
        
        si trovano lungo 15/60 residui della sequenza amminoacidica
        
        le SEQUENZE si trovano spesso all'N-terminale della catena e sono rimosse dalla troteina a opera di Peptidasi del segnale
      - RECETTORI DI SMISTAMENTO
        
        riconoscono i segnali di smistamento