Defesas naturais como muco, epitélio ciliado, lisozimas, secreções antibacterianas, ácido e bile no TGI podem ser superadas, por exemplo, nas bactérias gram negativas a membrana externa torna essas mais resistentes a lisoenzimas, ácidos e à bile. Enterobactérias com essas características podem se torna malignas se houver uma ulceração pois elas adentraram um ambiente estéril