Cerca de 79 gêneros de bactérias degradadoras de hidrocarboneto foram encontrados no ambiente marinho, no qual podemos citar alguns principais: Achromobacter, Acinetobacter, Alcaligenes, Archrobacter,Bacillus, Flóridavobacterium, Coryneforms, Microbacterium,Micrococcus, Pseudomonas, Actinomicetos, Nocardia,Aureobasidium, Candida, Rhodotorula e Sporobolomyces
A partir da década 70, começaram a ser testadas bactérias geneticamente modificadas por meio de sucessivas recombinações entre cepas com diversos plasmídeos, sendo obtidas vária linhagens de bactérias capazes de degradar mais de um tipo de hidrocarboneto, apresentando maior capacidade degradativa.
O uso de bactérias geneticamente modificadas pode ser aplicado além do monitoramento do processo de biorremediação, para o monitoramento de deformação, resposta ao estresse e avaliação de toxicidade