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Material & Method, SW (Main Server (Flask), Web GUI Server (Flask)),…
Material & Method
DNA Extractor
magnetic beads-based DNA extraction
샘플용액을 Lysis과정을 거쳐 핵을 노출 시킨킨다.
Beads 를 샘플용액에 첨가하여 DNA에 Bead 붙도록 유도한다.
DNA와 붙은 Bead를 자석을 이용하여 불순물과 분리한다.
분리된 Bead를 Elusion buffer에 넣어 Bead와 DNA을 분리시킨다
다시 자석을 이용하여 Bead를 제거하고 DNA만 PCR칩으로 이동시킨다.
Real-Time PCR
PCR칩에 DNA와 형광물질을 섞은 샘플을 주입한다.
PCR칩에 있는 Heating Sensor를 사용하여 칩의 온도를 높이고 외부의 펜을 사용하여 온도를 낮춘다.
칩의 온도를 특정온도로 높이고 낮추는 과정을 거쳐 샘플안의 DNA를 증폭시킨다.
샘플에 Excitation LED와 filter를 사용하여 특정 파장을 측정한다.
DNA가 증폭된 것을 확인하는 방법은 샘플에서 나타나는 형광의 빛의 변화를 보고 알수 있다.
빛의 밝기를 측정하기 위해서 Photo diode를 사용한다.
SW
Main Server (Flask)
PCR Interface (Thread)
PCR Controller (socket server)
PIC (uPCR)
Temp & Fan Control
USB (HID)
Socket Comm (1 sec)
API Server (Main Thread)
Extractor & PCR Protocol Manager
DB (SQLite3)
database file
Response
Extractor Interface (Thread)
Extractor Controller (socket server)
Magneto (Extractor)
Motor Control
I2C
PWM
Socket Comm (1 sec)
Detection Interface
Web GUI Server (Flask)
React
Bootstrap
Web Browser
Request
Plotly
HW
PI
Magneto (DNA Extractor)
L6470
SPI
I2C
Syringe
Chamber
SC18IS602B
SPI to I2C Converter
PWM
Servo
Detector
Filter
optic detection
LED
PIC (USB) Micro Controller
PIC4553? 2553?
Temperture Control
Fan Control (Cooling)
Heating Control
User
Input
Function groupping