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argomento G4, MICROBIOLOGIA MOLECOLARE E GENETICA BATTERICA - Coggle…
argomento G4, MICROBIOLOGIA MOLECOLARE E GENETICA BATTERICA
mutageni
fisici: radiazioni
-
ionizzazione:
raggi gamma-->
-
ovvero ho riduzione produzione,
-
chimici:
-
-
analoghiti basi:
molecole simili
ai nucleotidi,
però non sono nucleotidi,
quindi se presenti
nell'ambiente,
possono essere
- 1 more item...
-
coloranti intercalanti
(acridine, bromuro di etidio)-->
-
-
RNA polimerasi
-
-
-
il fattore sigma,
a differenza
dagli altri,
non è stabbilmente
legato,
per cui si dissocia,
facilmente
determinando
- 1 more item...
RNA polimerasi
dei bacteria,
che mostra
la struttura
-
ed è la meglio studiata,
ed è costituita
da 5 subunità differenti,
indicate come
- 4 more items...
-
nei bacteria,
dopo la sintesi
di una breve sequenza
iniziale di RNA,
-
e l'allungamento
delle molecole
di RNA
procede a opera
- 1 more item...
-
-
sintesi proteica,
in sintesi,
e via via che
scorre il filamento,
il tRNA si stacca,
e se ne va,
dopo aver rilasciato
l'amminoacido,
al tRNA successivo per
- 1 more item...
-
e poi un altro tRNA con
l'amminoacido corrispondente,
si posiziona
sul codone corrispondente,
sull'mRNA,
il precedente scorre
- 3 more items...
ovvero vi è,
una precisa corrispondenza,
-
-
-
abbiamo il ribosoma,
e all'interno
passa il filamento
di RNA messaggero,
dove avviene
via via,
dove abbiamo
- 1 more item...
-
-
-
-
-
-
-
-
inizio traduzione:
-
si forma complesso d'inizio,
-
-
-
e codone d'inizio
sull'mRNA
è preceduto poco
più a monte
da sequenza,
di lunghezza variabile
tra 3 e 9 nucleotidi
- 1 more item...
-
-
allungamento, trascrizione e terminazione:
-
diversi ribosomi,
possono tradurre
simultaneamente,
una singola molecola
di mRNA,
formando il polisoma,
che aumentano
- 2 more items...
-
-
-
-
e la traslocazione,
richiede il fattore specifico,
-
-
e durante
formazione legami
peptidici,
la catena peptidica
nascente
si muove verso tRNA
nel sito A
- 1 more item...
-
-
-
e nel ribosoma,
vi sono altri siti
dove tRNA interagiscono,
e 2 di questi
si trovano
sulla subunità 50S
e sono detti
- 2 more items...
-
e questo codone,
è riconosciuto
da proteine particolari,
detti fattori di rilascio,
e riconoscendo
questo codone,
tagliano il polipeptide
- 1 more item...
-
-
le proteine
-
-
-
ma vi sono proteine,
che possono essere
-
o escrete
fuori la cellula,
e ciò vale,
per molti tipi
di proteine importanti,
che servono
- 1 more item...
esportazione proteina
attraverso sistema
di secrezione genica:
la sequenza segnale
è riconosciuta
-
sia da particelle
di riconoscimento
del segnale,
- 1 more item...
e la particella
di riconoscimento
del segnale
lega le proteine
che vengono inserite
- 1 more item...
unità di trascrizione
-
-
ed è quello che succede,
con i geni ribosomiali,
e possiamo avere:
-
gene codificante l'rRNA 16S,
gene codificante un tRNA,
gene codificante l'rRNA 23S,
gene codificante l'rRNA 5S,
-
-
ma ciò che è importante
è che quando
vengono trascritti
nella cellula,
in questo caso
la loro funzione
si va a esplicare ,
come struttura
- 1 more item...
mentre,
gli RNA messaggeri,
sono prodotti
di trascrizione
ad essere tradotti,
in proteine
e poi quando
la cellula non ne più bisogno,
- 1 more item...
mentre gli RNA ribosomiali,
siccome sono
parte integrante
del ribosoma,
si compattano
in una struttura
-
più resistente,
- 1 more item...
le informazioni genetiche,
sui cromosomi
sono organizzate
in unità dio trascrizione,
-
-
-
trasferimento genetico
ma nel caso di batteri,
ciò non accade,
in quanto si divide,
e si moltiplica il DNA,
e poi le molecole figli
-
e una dall'altra,
nelle 2 cellule figlie
quindi è garantita
- 1 more item...
e non vi sono,
i fenomeni di
-
-
-
ecc,
tutti i fenomeni
che garantiscono
la variabilità
ma non è sempre positivo,
e ciò garantisce,
-
un rimescolamento,
dei geni,
perchè vi sono coppie,
omolghe,
che si appaiono,
-
e l'altro
dall'altro
- 1 more item...
ma pensando,
agli organismi superiori,
ma anche lieviti,
organismi unicellulari,
che hanno comunque,
dei fenomeni
di sessualità
dove tutta l'intera cellula,
di lievito,
- 1 more item...
-
-
-
e vi sono
3 modalità con cui
questo può avvenire,
e sono:
trasduzione:
è un processo,
attraverso cui,
si ha l'inserimento
- 1 more item...
coniugazione:
-
attraverso cui
2 cellule vive
si incontrano,
- 1 more item...
trasformazione:
consiste nel
trasferimento di
pezzetti di DNA,
- 1 more item...
trascrizione del DNA
-
e poi,
-
ma invece
nella trascrizione,
è soltanto
un filamento,
che è quello significante,
che viene trascritto,
quindi non l'intero
- 1 more item...
-
-
e si ha,
-
e il core con
fattore sigma,
che si mettono insieme,
e lo rendono attivo,
e posizionandosi
sul DNA,
in modo da tenerlo
- 1 more item...
-
ma la differenza
-
ma anche
differenze
nella tempistica
cioè,
-
invece RNA,
viene prodotto
quando serve
- 1 more item...
a volte gli RNA ribosomiali,
-
e però RNA messaggero,
è quello che serve
per portare
- 1 more item...
-
-
-
e vi possono essere
-
ovvero se sono
geni vicini,
sono trascritti insieme,
e poi separati
in un secondo momento,
con una reazione enzimatica,
e abbiamo il permotore,
che è il sito di attacco,
dell'RNA polimerasi,
dove questo incomincia,
ad agire,
dopo aver portato avanti,
-
plasmidi
ma sui plasmidi,
-
il discorso è diverso,
ovvero,
mentre la grandezza
-
-
la sequenza
è qualcosa
di caratteristico
di una determinata
- 1 more item...
quindi ad un certo punto,
-
-
quindi è come se
il plasmide,
contribuisce a dare
una marcia in più,
per cui il microrganismo
che lo ha,
riesce a stare meglio
in un determinato
- 1 more item...
-
svilupparsi meglio
rispetto a quelli che
- 1 more item...
e sono elemento genetici,
fatto di DNA,
sempre circolare,
ovvero DNA
a doppia elica,
che si richiude
su se stesso,
e hanno dimensioni
- 1 more item...
-
e per esempio
negli E. coli
il batterio
-
più studiato,
e si è visto
-
ed altri
che non li hanno,
e tutto ciò
- 1 more item...
oltre al DNA cromosomale,
-
ma la presenza di plasmidi,
è una cosa che,
non necessariamente
è legata,
a quella specie batterica,
-
da un punto molecolare,
possiamo dire che
i plasmidi nella cellula
possono essere,
sia da un punto
-
che per quanto
riguarda
il numero di plasmidi
- 1 more item...
cioè,
già una cellula
-
e quanti plasmidi
ci possono essere,
e vediamo che
che da un punto
di diversi plasmidi
- 1 more item...
ma in alcuni casi
si può arrivare
- 1 more item...
ma quante copie,
di un plasmide
ci possono essere
in una cellula,
e si può vedere
che per ogni plasmide,
fatto in un certo modo,
- 1 more item...
ma ovviamente,
non è possibile
che una cellula
abbia 100 copie
di plasmidi diversi,
ma questi sono
i valori che
- 1 more item...
la quantità di DNA,
che sta su un plasmide,
è circa l 5%
del DNA di un cromosoma,
e significa
che un plasmide,
è lungo da 1 a 25 kilo basi,
quindi al massimo
- 1 more item...
ma ciò che è importante,
è che questo plasmide,
è sincronizzato
con la replicazione,
attraverso
dei meccanismi
che vengono
dalla replicazione
- 1 more item...
ma non funziona sempre
tutto così
alla perfezione,
come in alcuni casi,
in cui il plasmide
si perde
da una generazione
- 1 more item...
-
-
-
-
-
-
il DNA batterico
quindi anche nei batteri,
vi è il cromosoma,
-
e non forma
le strutture cromosomiche,
presenti negli eucarioti,
come gli istoni,
ma è una cosa
che può accadere
- 1 more item...
-
è strutturato,
abbiamo fondamentalmente,
-
trasduzione:
è un trasferimento di geni,
da una cellula ad un'altra,
-
quindi i batteriofagi,
che sono virus
che attaccano i batteri,
possono
in alcune occasioni
trasportare
pezzi di DNA,
- 2 more items...
e la trasduzione,
è stata studiata,
-
in diverse specie,
ed è di tipo
o specializzato:
qui solo il DNA
del batterio specifico,
- 1 more item...
generalizzato:
qualunque pezzettino
di un DNA di un batterio,
- 1 more item...
rispetto ai meccanismi precedenti,
-
specifico (coniugazione),
-
-
trasformazione:
-
e poi la cellula,
acquisisce
materiale genetico,
dall'esterno
e di conseguenza,
subisce dei cambiamenti
come magari,
- 1 more item...
ma non è così facile,
perchè acquisire
materiale genetico
dall'esterno,
non significa
acquisire materiale,
che puoi usare,
- 1 more item...
è un fenomeno che
viene naturalmente
in natura,
e con frequenza bassa,
perchè sennò
sarebbero sempre
-
-
e cambiamento continuo,
- 1 more item...
e se parliamo
di batteri
della stessa popolazione,
questa cosa
avviene in modo
più facile,
perché comunque,
- 1 more item...
perchè la trasformazione,
mi deve poi,
portare ad un cambiamento,
nel genoma,
della cellula ricevente,
che sia un cambiamento
che sia ereditabile,
- 1 more item...
cosa importante,
è che questi frammetti,
di DNA devono avere,
delle dimensioni,
quindi se frammentini
-
ma se sono di circa
10 kilo basi
- 1 more item...
e un'altra cosa importante,
è che la cellula
deve essere competente,
e vuol dire,
-
la membrana impermeabile,
-
-
comunque,
la cellula batterica,
in laboratorio,
può essere competente
proprio per
ragioni di studio,
- 1 more item...
e poi vi deve,
essere integrazione,
del DNA trasformate,
con la proteina rercA,
che mi va a interagire,
in modo da produrre,
un'integrazione,
- 1 more item...
-
la molecola di DNA
che entra
nella cellula ricevente,
entra a singolo filamento,
e attivandosi
le proteine RecA,
si attiva il processo
- 1 more item...
e ciò significa
che la molecola
a singolo filamento,
andava a riconoscere
una sequenza
corrispondente,
- 1 more item...
-
coniugazione:
questa avviene,
tra batteri gram negativi,
perchè sono quelli,
che sono provvisti
di pilli sessuali,
ovvero recettori
sulle estremità
- 1 more item...
quindi abbiamo,
per esempio
cellula ricevente
indicata come
fattore F+
per il fattore F di E. coli,
che è il plasmide tipico,
- 1 more item...
-
e il trasferimento
del DNA,
avviene attraverso,
un pilo di coniugazione,
che è una struttura,
- 1 more item...
e ciò perchè,
il DNA si duplica,
mentre passa,
da una parte all'altra,
e questo in maniera
- 1 more item...
poi possono succedere,
varie cose,
abbiamo un prodotto
di replicazione,
in modo che il DNA
- 1 more item...
e via via che si duplica,
e si ha il passaggio,
si produce ulna
- 1 more item...
i batteri sono,
-
e quindi come,
altri fenomeni,
sono soggette,
ad una regolazione,
del quorum sensing,
che riguarda
- 1 more item...
macromolecoldee geni, il DNA
il DNA, è la sua struttura
-
perchè,
prima del DNA,
si pensava che
a svolgere
una funzione
di tipo informativo,
fossero le proteine,
per il motivo
- 1 more item...
mentre il DNA
è fatto solo
- 1 more item...
e che una cosa
- 1 more item...
-
-
e la molecola
di DNA,
forma degli avvolgimenti,
e a seconda
come si posizionano,
questo crea un rotazione,
in modo tale che
i 2 filamenti
- 1 more item...
-
normalmente
quando parliamo
di molecole di DNA,
-
quanto sono lunghe
esprimiamo
questa grandezza,
in kilo basi,
e si intende
- 1 more item...
ed è un modo
- 1 more item...
e 1 molecola di DNA,
è fatta da
un doppi filamento,
quindi dire che,
un gene misura
-
o 1 kilo base
significa che ci sono
1000 nucleotidi
- 1 more item...
-
i precursori
degli studi
sull'eriditieretà
che hanno scoperto
cose,
mai confutate,
anzi poi confermate
dagli studi
- 1 more item...
-
poi si è iniziato
a fare delle prove
come un esperimento
sui topi con i battei,
e forse è li che
si è iniziato a capire
che forse il DNA,
era quello che regolava
- 1 more item...
-
poi capito
come era strutturato,
si è capito anche,
come poteva funzionare,
ovvero,
-
e che le 2 molecole
sono complementari,
apriva alla comprensione,
- 1 more item...
e tutto ciò
per noi è ovvio,
ma questa scoperta
è stato molto grande,
e i studi per
tutto ciò sono
quelli di
-
ma insieme
- 1 more item...
-
perchè sequenze monomeri,
-
-
e per questo,
a differenza di,
-
o lipidi,
composti da
lunghe seguente
di unità ripetute,
gli acidi nucleici,
sono definiti
- 1 more item...
e in una
cellula o un virus,
questi elementi
costituiscono
il corredo
di informazioni genetiche,
-
e l'informazione genetica,
-
-
e l'informazione genica,
nelle cellule,
si trova
negli acidi nucleici
DNA,
trasporta
matrice genetica della cellula,
e RNA,
molecola intermediaria
che permette conversione,
dell'informazione
- 1 more item...
-
-
le bassi azotate,
sono legate
allo zucchero pentoso
mediante
legame glicosidico
-
e un atomo
di azoto
della base azotata,
- 2 more items...
-
i nucleotidi,
oltre essere inclusi,
negli acidi nulcleici
e svolgono altre funzioni,
-
-
replicazione DNA
-
-
e la replicazione
avviene attraverso,
addizione di nucleotidi
presenti nella cellula,
quindi
-
e che devono
essere già presenti
nella cellula
- 1 more item...
come avviene,
si ha la forca di replicazione,
-
la replicazione avviene
in direzione 5' 3',
i zuccheri messi
in una posizione,
in modo che fosfato,
fa da ponte,
e legava un nucleotide,
- 1 more item...
-
e ciò che succede,
è che per come
si apre la molecola,
si ha la formazione
in un caso
della nuova molecola
in modo continuo,
- 2 more items...
e nell'altro,
non si può fare ciò,
detto filamento copia,,
- 3 more items...
saldatura frammenti, filamento copia, quindi DNA polimerasi 3
sintetizza DNA in 5'-->3',
verso innesco di RNA,
di altro frammento,
sintetizzato in precedenza,
-
e raggiunto
questo frammento,
la DNA polimerasi 1
-
-
-
-
poi DNA ligasi
congiunge frammenti
e si ha DNA
- 1 more item...
inizio sintesi:
prima che
DNA polimerasi
possa sintetizzare
nuovo DNA,
la doppia elica
deve essere srotolata
- 1 more item...
-
-
regione a singolo
filamento,
vengono ricoperte,
da copie di
proteine di legame
a singolo filamento,
- 2 more items...
e lo srotolamento
mediato da
elicasi
genera superavvolgimenti,
positivi,
nella direzione
- 1 more item...
e per contrastare,
questo fenomeno
un altro enzima
la DNA girasi,
-
e introduce
superavvolgimenti
- 1 more item...
e in bacteria,
è individuato
un singolo sito
cromosomico
in cui inizia
sintesi DNA,
- 1 more item...
ed è una specifica
sequenza di DNA,
di 250 basi,
e riconosciuta dalle
proteine necessarie
per inizio replicazione,
- 1 more item...
quindi assemblate
le 2 elicasi,
nei 2 filamenti,
in direzione opposta,
e poi seguite da
2 DNA polimerasi,
- 1 more item...
e inizia la replicazione,
-
-
quindi abbiamo
una replicazione
che quando inizia,
inizia da una parte
del DNA,
con origine di replicazione,
che ha una sequenza
di circa 250 basi,
- 1 more item...
i 2 filamenti si trovano
in direzioni opposte,
e comunque abbiamo
che l'attacco
del nucleotide,
a quello precedente,
avviene sempre
in direzione 5'-->3',
- 1 more item...
e questo avviene
- 1 more item...
nei batteri,
-
e avvengono
nello stesso modo
degli organismi superiori,
-
-
quindi DNA
2 funzioni,
-
e quella
di fornire l'informazione,
legami tra nucleotidi
acidi nucleici:DNA, RNA
-
-
-
struttura acidi nucleici,
-
-
ogni cromosoma,
ha 2 filamenti
di DNA,
e ognuno ha
-
milioni,
di nucleotidi
uniti da legami
- 1 more item...
-
-
doppia elica
partendo dalla
-
anche se singoli legami
idrogeno sono deboli,
ma il loro numero,
tra coppie di basi,
di una lunga molecola,
da stabilità
- 1 more item...
quando avviene
-
ovvero la sintesi di DNA,
è una sintesi,
ma che avviene,
-
ma sintetizzato tutto
il DNA cromosomale
perchè dopo
- 1 more item...
-
-
-
-
cromosoma batterico
-
ma ciò che,
è importante,
è sapere quanto
mediamente è grande,
un cromosoma batterico,
ovvero
-
e quanta informazione
ci posso trovare
- 1 more item...
e ciò perchè,
DNA batterio,
è mediante,
la sua molecola,
lunga 1 millimetro,
ovvero 1000 volte
la lunghezza
di un battere
- 1 more item...
-
è circolare,
si intende che
la molecola è chiusa
su se stessa,
cioè
il DNA
ha inizio e fine,
e queste qui,
- 1 more item...
-
è un DNA,
sempre a doppia elica,
e una base corrisponde
al rispettivo nucleotide,
-
-
-
-
-
-
l'informazione genica
questa informazione
è racchiusa in
molecole di DNA,
che è presente
in tutte le cellule viventi,
e il DNA,
in queste cellule,
deve fare 2 funzioni:
la replicazione
ovvero la capacità
che ha una molecola
di DNA di un cromosoma,
- 1 more item...
e a ciò,
si accompagna
anche la possibilità,
- 1 more item...
e oltre alla capacità
-
ovviamente,
la molecola di DNA,
deve svolgere,
la sua attività informativa,
-
e ciò vuol dire,
che su molecole DNA,
ci sta informazione
per costruire
le proteine,
- 3 more items...
-
-
-
mutazioni
-
e nelle cellule batteriche,
-
-
invece,
nel caso di
un batterio,
noi abbiamo
una differenza
a livello genetico,
è rilevata,
in quella cellula
- 1 more item...
-
-
mentre negli eucarioti,
-
ma sono qualcosa,
che è legato,
all'espressione
di una sequenza genetica,
-
e quindi
alla produzione
di proteine,
in determinati complessi,
determinati tipi di celle,
questo perchè
un organismo complesso
si ha una specializzazione,
- 1 more item...
e i tipi di mutazione,
che si ritrovano
in un gene,
-
e possono essere
riconducibili,
a una semplice
mutazione puntiforme,
che riguarda,
- 1 more item...
invece,
nella mutazione a sostituzione,
-
-
-
-
slittamento di lettura
-
-
quindi,
a quel punto
è preferibile
inserzione
di 3 nucleotidi,
che magari altera
un po' la grandezza,
- 1 more item...
le mutazioni avvengono,
-
o a causa
di errori di trascrizione,
durante l'attività enzimatica,
-
-
-
-
-