LA STRUTTURA DELLE PROTEINE
Struttura primaria:
rappresenta la sequenza degli amminoacidi. Così si ha la struttura della proteina
Struttura secondaria:
consiste nel ripiegamento della catena tramite i legami che si instaurano tra i gruppi carbonilici e i gruppi - NH -.
Questa struttura è stabile perchè i legami a idrogeno (deboli) sono presenti in cospicue quantità.
In base ai ripiegamenti della proteina ci sono 2 tipi di strutture secondarie
STRUTTURA β
STRUTTURA AD α-ELICA
Questa struttura è dovuta grazie ad una disposizione a spirale dove l'idrogeno del gruppo -NH-
In questa struttura si ha una disposizione di catene proteiche l'una accanto all'altra.
istaura con l'ossigeno del gruppo C=O (che dista 4 amminoacidi del gruppo -NH-) un legame idrogeno.
Questa struttura si ha con proteine o tratti di esse con residui voluminosi, che si dispongono verso l'esterno.
Queste catene presentano una conformazione a "fisarmonica".
Le catene sono antiparallele e i legami a idrogeno che si istaurano tra l'idrogeno del gruppo -NH- e l'ossigeno del gruppo C=O di amminoacidi delle 2 catene adiacenti.
Struttura terziaria
Una catena proteica non presenta per intero una conformazione ad α-elica o β
queste strutture sono intervallate da tratti poco organizzati detti "RANDOM COIL"
Qui i residui lontani nella sequenza possono interagire e legarsi, facendo assumere alla proteina la struttura terziaria.
I responsabili di questa struttura sono:
I legami a idrogeno;
Le forze di legame idrofobiche;
I ponti disolfuro;
I legami ionici.
In base alla forma che assume la proteina si distingue in:
FIBROSE.
GLOBULARI;
Ci sono diversi modi per rappresentarla
NASTRO;
SALSICCIA.
COMPATTA;
Struttura quaternaria:
Due o più proteine globulari si organizzano insieme attraverso dei legami non covalenti
per potenziare le loro funzionalità, così si ha la struttura quaternaria e le proteine che la costituiscono
sono chiamate "subunità" che a loro volta mantengono le loro strutture terziarie.
Le subunità sono legate fra di loro mediante dei ponti disolfuro.