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Mécanisme de réplication, et diversité génétiques des virus., Stratégie de…
Mécanisme de réplication, et diversité génétiques des virus.
Qu’est qu’un virus ?
Particule virale (virion) = entité biologique simple dt structure résume 2 ou 3 éléments :
- AN 1 seul type : génome
- Capside = asemblage protéique
- Enveloppe (péplos) = bicouche lipidique hérissée de spicules glycoprotéines
2 formes :
- Virion = virus à état libre dn espace inter-cellulaires
- Cell infectée = où virus est sous sa forme compléte
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Evolution des virus
2 causes diversité
Mécanismes mol : mutat°, recombinaison, résoosrtiment
-> erreur lors réplication
Variabilité par mutation prod suite masi corporation lors réplication :
- substitution (mésappariement), délétions ou insertions (dysfonctionnement ARN-pol)
- fréq + élevée pr virus ARN car ARN-pol pas de mécanismes correcteurs
Recombinaison :
- Virus ADN = cassur ADN génomique + liant° avce fragement ADN non parental
- Virus ARN = phénomène copy choice -> pol change matrice au cours élongation (rare pr ARN - alors que ARN + fréq élevée)
Réassortiment = échange de gènes observés chez virus à génome ARN segmenté (virus influenza et rotavirus)
Mécanisme : confection même hôte par différents virus, segments génomiques virus co-infectants sont redistribués façon aléatoire parmis virions prod -> à étape morphogénèse virale, observé in vitro/vivo, prod entre virus humains et animal, restreint aux virus appartenant même genre (Bunyaviridae)/ type (virus grippaux)/ sérogroupe (rotavirus)
Taille des pop virales : quasi-espèce, dérive génétique, press° sélect°
- Virus ARN -> Eviter pers sous forme quasi-espèce avec tx variation° 0,6 à 2 susbtsutuions de nt/génome/réplicat°
- Virus ADN -> varient bcp - avce tx substitut° proches cell hôtes 10-7 à 10-8/nt/an
Ex : virus grippe = virus ARN segmenté -> échange segment code pr différents prot = réassortiment
Recombiansion linéaire
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Virus grippe
Besoin pr évoluer :
- Transmis : contact, resitance aux c° ext et charge virale min
- Pénétrer dn cell cibles : interact° rc - HA et échapper aux ac neutralisants
- Optimisation multiplication : act complexe réplicat° et inhiber défenses cellr (interférons)
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Accumulat° mutat° ponctuelle ou insert°/délét° dn génes HA et NA, d’émues aux erreurs de recopiage ARN pol
- Modif niveau prot domai es antigénqiues
- Pression sélect° par Ac neutralisant individus infect : emergenc new variants
Cause antigénique SHIFT) que virus type A :
- Échange tôt 1 ou + segments ARN par réassortiment
- Appart° new virus avec HA, NA new, inconnu du SI à new sou-type
- Épidémie mondiale ou gde pandémie à intervalle irréguliers 3ou 4/siècle
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