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Prélèvements bactériologiques - Coggle Diagram
Prélèvements bactériologiques
Généralités :
LA QUALITÉ DU PRÉLÈVEMENT CONDITIONNE LES RÉSULTATS +++
=> nature de l'échantillon, mode de collection et quantité, modalités d'acheminement, collaboration entre clinicien et microbiologistes
1 : LES BACTÉRIES SONT DES ÊTRES VIVANTS QUI SE MULTIPLIENT ET QUI MEURENT
=> Délai de transport et conservation des échantillons (idéal = transport rapide des prélèvements au labo)
2 : IL EXISTE UNE FLORE COMMENSALE SUR LA PEAU ET LES MUQUEUSES
=> Il faut éviter la contamination du prélèvement
3 : LA QUALITÉ DE L'EXÉCUTION DU PRÉLÈVEMENT EST FONCTION DE LA LOCALISATION DE L'INFECTION
Sites stériles (
TOUTE PRÉSENCE DE GERMES SERA CONSIDÉRÉE ANORMALE
) :
LCR
Tractus urinaire (jusqu'à la vessie)
Sang
Voies respi basses
Voies génitales hautes (utérus, trompes)
Thorax, abdomen
4 : IDENTIFIER LES PRÉLÈVEMENTS => INDISPENSABLE ++++
ECBU :
Au labo :
Cytologie : compte des leucocytes / hématies
Culture : sur milieu gélosé
Enregistrement du prélèvement
Prélèvement :
Contamination fréquente par le microbiote cutané +++ (seuil acceptable < 10%)
TOILETTE SOIGNEUSE NÉCESSAIRE
Patient continent => dans un pot à pipi
Patient incontinent => sondage allez-retour
Indications :
BU positive, hématurie, Pyurie
(BU AVANT TOUT ECBU)
Fièvre isolée > 39° C
Signes cliniques de cystite / pyélonéphrite / prostatite
Contrôle d'un TTT antibio
Situations particulières (femmes enceintes, diabète, pathologies urologiques...)
Clinique :
Cystite aiguës / chronique : brûlures mictionnelles, douleurs lors de la miction, urines +/- sanglantes, miction fréquente
Pyélonéphrites aiguës / chroniques : + fièvre et douleurs lombaires
Objectif bactériologique :
Isolement, identification et dénombrement du ou des germes responsables de l'infection
Etude de la sensibilité aux antibiotiques
EXAMEN LE + COURANT AU LABO DE MICROBIOLOGIE
Hémocultures :
Prélèvement :
ÉVITER LES CONTAMINATIONS DES FLACONS
Faire en sorte que la bactérie présente dans le sang soit introduite dans le flacon (parfois > 1 bactérie/ml de sang) => faux négatif
Hygiène des mains, des flacons et de la zone de prélèvement +++
Importance de la quantité de sang prélevé => 2 paires de 4 flacons, 10ml/flacon
Au labo :
1 : EXAMEN DIRECT AU MICROSCOPE => appel. du résultat au service si urgence
2 : MISE EN CULTURE / ANTIBIOGRAMME => identification à + 24h après positivité
Objectif bactériologique :
Identifier l'agent infectieux responsable de bactériémie ou d'endocardites infectieuses
(SEPSIS = URGENCE VITALE)
Guider la thérapie antimicrobiènne
Confirmer la présence de microorganismes dans le sang
(SANG = MILIEU STÉRILE)
Résultats et interprétation :
Durée de l'incubation dans l'automate :
10j pour la recherche des levures
14 à 28j pour les bactéries du groupe HACEK responsable d'endocardites
5j dans la majorité des cas
Limites de la méthode :
Toutes les bactéries ne poussent pas dans ces milieux
Problème de faux positif / faux négatif
Hémoculture positive avec un éventuel contaminant
Hémoculture négative malgré contexte d'infection
2nd analyse la + fréquente au laboratoire
Coprocultures :
Indications :
Syndrome dysentérique
Fièvre > 39° C
Diarrhées avec signes de gravité
Situations particulières : VIH, prise d'antibio, retour de voyage...
Diarrhées > 3j malgré le TTT symptomatique
Prélèvements :
Respecter une technique de prélèvement la plus propre possible
Au labo :
Copro pour patient externe ou hospitalisé depuis moins de 3j
Recherche de Clostridium difficile (chez patients > 3 ans, pas de demandes antérieures de > 7j)
Selles moulées systématiquement refusées au labo
Objectif bactériologique :
Diagnostic de diarrhées bactériennes (recherche de bactéries à Gram - largement dominantes)
Possible recherche de virus