Onset GNAPS biasanya berlangsung secara tiba-tiba, terjadi 7-14 hari setelah anak menderita faringitis atau infeksi saluran nafas atas, atau 3-6 minggu setelah infeksi kulit. Gejala klinik biasanya berupa sindrom nefritik akut, yang terdiri atas sekumpulan gejala berupa gross hematuria, edema periorbita, dan hipertensi, proteinuria dan oliguria sampai anuria karena penurunan laju filtrasi glomerulus (LFG). Variasi lain yang tidak spesifik bisa dijumpai seperti demam, malaise, nyeri, nafsu makan menurun, nyeri kepala, atau lesu.