Las causas de osteoporosis secundarias son múltiples enfermedades genéticas, endocrinas, gastrointestinales, hematológicas, reumatológicas, nutricionales, farmacológicas, etc.
El déficit de estrógenos o andrógenos va a ser muy diferente, en dependencia de la época de la vida en que se desarrolle; así los casos de hipogonadismo primario o secundario, en el período de adquisición de masa ósea, van a condicionar un menor pico de masa ósea
Los pacientes con hipercortisolismo endógeno como el síndrome de Cushing, presentan disminución de la DO hasta 21% en columna y 18% en cadera.