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SIRT7抑制剂的设计 - Coggle Diagram

- - - - 将HepG2细胞添加到孔板中在化合物或与索拉非尼的组合存在下再孵育xxx天。细胞固定，结晶紫染色，计算菌落数量
  - - - SIRT7氨基酸残基的突变如何影响其与化合物的相互作用，2800Z和40569Z均显著抑制SIRT7脱乙酰活性，在此基础上，突变SIRT7氨基酸残基活性位点再测SIRT7脱乙酰活性
  - - - 小鼠皮下注射肝癌细胞系，体内肿瘤生长到一定程度以后，对小鼠进行随机分组，用对照葡萄糖，化合物，索拉非尼。化合物及索拉非尼联合进行腹腔注射，每两天测量肿瘤体积与重量，最后2周后取出肿瘤进一步分析
      - 免疫组化染色和TUNEL实验进一步评估肿瘤的增殖和凋亡情况
    - - 之前已经证明SIRT7通过诱导p53 K320和K372去乙酰化和抑制p53依赖的NOXA表达来调节阿霉素的化学敏感性。——这两种化合物是否通过相同的机制增加索拉非尼的细胞毒性？？？
      - 通过信号通路上的蛋白表达推测与某个信号通路的关系
- - - - 蛋白处理
        
        Pymol：去水，加氢，加电荷
      - 小分子化合物数据库，及小分子预处理
        
        加氢，加电荷
    - - 导入受体
      - 导入配体
      - 设置受体网格grid box
        
        根据蛋白结构活性位点确定坐标
      - docking对接
        
        https://i.postimg.cc/C12rmmsY/15-2-2023-113954-www-ncbi-nlm-nih-gov.jpg
        
        筛选出得分最高的前100名化合物
        
        与蛋白家族其他成员进行对接选择与目的蛋白特异性结合而与蛋白家族成员亲和力低的化合物
    - - 结合自由能分析
    - - 最终选择1-2化合物进行实验