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argomento S2, MICROBIOLOGIA DEGLI ALIMENTI - Coggle Diagram

- - - - assomigliano di più
        
        agli eucarioti
  - - - che batteri e archaea
        
        si svilluppavano
        
        da un punto in comune,
        
        in realtà sono simili
        
        solo perché sono
        
        unicellulari e procarioti,
        
        1 more item...
  - - - come scoperta,
        
        partendo da LUCA,
        
        poi abbiamo batteri
        
        e archaea,
        
        che sono procarioti
        
        ed unicellulari
        
        infatti i primi archaea
        
        sono stati scambisti
        
        per batteri
        
        ma poi ci si è resi conto,
        
        che vi erano
        
        1 more item...
  - - - dare ordine
      - e delle regole,
        
        quindi ordinare
        
        diversi organismi
        
        cercando poi
        
        di inquadrarli
        
        in delle categorie
  - - - partono da
        
        uno stesso
        
        progenitore,
        
        precursore
        
        comune
        
        indicato con
        
        la sigla LUCA
        
        1 more item...
    - - progenitore,
        
        universale
        
        che doveva essere
        
        un qualcosa che
        
        a livello cellulare
        
        era qualcosa di
        
        1 more item...
  - - - si suddividono
        
        in eucarioti,
        
        archaea,
        
        e bacteria
  - - - a livello genetico,
        
        si è capito
        
        che erano molto
        
        lontani,
        
        tanto che si è arrivati
        
        a questa conclusione,
        
        1 more item...
- - - - non contiene
        
        microrganismi
  - - - detta microflora indigena,
      - quando mangiamo
        
        verdure,
        
        insalate,
        
        o altre verdure,
        
        noi avremo sempre,
        
        all'interno
        
        di questo prodotto
        
        microrganismi che sono
        
        3 more items...
      - poi vi sono anche
        
        funghi e lieviti,
        
        che predominano
        
        sulla frutta
        
        (che hanno
        
        +zucchero
        
        e +acidità)
      - e sono presenti naturalmente,
        
        e significa
        
        che sono endofiti,
        
        ovvero che si trovano
        
        all'interno
        
        dei tessuti veggetali,
        
        1 more item...
      - quindi si crea
        
        una sorte di
        
        combienzalismo,
        
        a volte simbiosi,
        
        per cui i microrganismi,
        
        sono lì,
        
        svolgono la loro attività,
        
        che in molti casi
        
        1 more item...
        
        e viceversa,
        
        1 more item...
      - ma questa microflora,
        
        presente naturalmente,
        
        ha anche delle caratteristiche,
        
        dal punto di vista
        
        quantitativo
        
        e qualitativo,
        
        ovvero per es.
        
        1 more item...
      - ma oltre
        
        al numero,
        
        bisogna vedere
        
        il tipo di microrganismi
        
        che sono presenti
        
        e nel tempo,
        
        la microflora indigena
        
        1 more item...
    - - i contaminati
        
        come
        
        coliformi,
        
        e enterococchi
      - e patogeni
        
        come
        
        salmonella,
        
        Clostridium botulinum,
        
        lactobacilli monocytogenes
    - - dal suolo,
      - da processo di lavorazione,
      - contatto con
        
        strumentazione
        
        elle varie fasi,
      - lavaggio,
      - irrigazione,
      - riduzione in pezzi,
      - conservazione:
        
        minore microflora
    - - secondaria
        
        dopo la trasformazione
        
        processi tecnologici,
        
        derivanti da fabbrica
        
        (ambienti,
        
        superfici,
        
        H2O,
        
        materiali,
        
        personale)
      - primaria
        
        prima della trasformazione
        
        quindi da
        
        suolo,
        
        aria,
        
        H2O,
        
        pulviscolo,
        
        prodotto stesso
      - e possiamo distinguere
        
        in 3 diversi pericoli
        
        chimico
        
        presenza composti chimici
        
        ell'alimentio
        
        (pesticidi,
        
        metalli pesanti,
        
        fitofarmaci, antibiotici
        
        ormoni,
        
        nitrati, nitriti
        
        conservanti, coloranti
        
        detergenti, disinfettanti,
        
        tossine )
        
        fisico
        
        elemento che
        
        non rientra
        
        nella composizione
        
        1 more item...
        
        biologico
        
        virus, batteri,
        
        lieviti, funghi,
        
        muffe, parassiti
        
        tossine
        
        (prodotte da
        
        microrganismi)
        
        infestanti
        
        (insetti, volatili,i
        
        insetti striscianti
        
        roditori, ecc)
  - - - vengono da:
        
        piante:
        
        alcuni batteri
        
        del suolo
        
        si concentrano
        
        in parti di piante
        
        1 more item...
        
        animali:
        
        tratto intestinale,
        
        sui ha una diffusione
        
        nel terreno
        
        e in H2O,
        
        come,
        
        4 more items...
        
        suolo:
        
        batteri del suolo
        
        inclusi sporigeni
        
        come clostridium
        
        uomo:
        
        mani, naso, bocca,
        
        condizioni igieniche,
        
        diffusione nel terreno
        
        e H2O,
        
        come,
        
        staphylococcus,
        
        salmonella,shigella
        
        micrococcus,
        
        H2O:
        
        che è di irrigazione
        
        contaminate
        
        da colifirmi
        
        ed enterococchi
        
        ovvero microrganismi
        
        patogeni
        
        aria:
        
        quasi tutti i generi
        
        batterici,
        
        funghi
        
        e lieviti,
        
        a in bassa concentrazione,
        
        come bacillus,
        
        micrococcus
  - - - strumenti, materiale,
        
        luogo
        
        (superfici di lavoro:
        
        banconi ecc)
      - termizzazione, congelamento
      - riduzione a pezzi,
      - lavaggio,
    - - materiali usati,
      - conservazione
  - - - origine vegetale
        
        in cui è già presente
        
        una flora microbica
        
        indigena
  - - - ad alterazioni alimentari,
        
        vuol dire che
        
        ci dono stati
        
        dei problemi
- - - - ovvero microrganismi
        
        correlati con
        
        la carenza di igiene
      - cioè se io trovo,
        
        i coliformi,
        
        durante un processo
        
        di lavorazione
        
        è una cosa grave,
      - i coliformi,
        
        sono E.coli,
        
        di origine intestinale,
        
        perchè l'ambiente
        
        di delezione,
        
        è l'intestino
      - poi anche se
        
        a maggior parte,
        
        di E. coli,
        
        sono batteri,
        
        non patogeni,m
        
        a sono comunque,
        
        batteri con
        
        1 more item...
      - e quindi ritrovarli,
        
        nel corso di
        
        na catena alimentare
        
        significa che
        
        c'è stato
        
        n grosso problema
        
        1 more item...
      - quindi è indicativo
        
        di una grossa problematica
        
        che va risolta
  - - - qual è il problema
      - e il suo livello
  - - - quntitativa
      - o qualitativa
        
        durante il tempo,
        
        quindi si vengono
        
        a riprodurre
        
        specie microbiche
        
        che prima erano
        
        2 more items...
  - - - che mi possono
        
        indicare
        
        che un alimento
        
        ha subito una alterazione
  - - - di nuovo,
    - - vi è una variazione
        
        ella microflora normale,
  - - - sono un ottimo indicatore,
        
        ma bisogna saper vedere,
        
        saperlo misurare,
        
        vedere se è presente,
        
        sapere se cresce,
        
        se proiduce metabolita,
  - - - nell'alimento,
        
        vuol dire che
        
        c'è un problema,
  - - - n alimento
        
        che è correlata
        
        con la presenza
        
        di determinasti microrganismi,
    - - microrganismi,
        
        che possono procurare
        
        delle alterazioni
        
        perchè fanno
        
        delle attività
        
        metaboliche,
        
        1 more item...
    - - con una diminuzione
        
        della durata
        
        sullo scaffale
  - - - negli alimenti,
        
        se non fanno parte
        
        della microflora endogena,
  - - - se un certo
        
        prodotto è accettabile
    - - rispetto a che,
        
        devo sapere
        
        che quel prodotto
        
        può essere soggetto
        
        a contaminazione
        
        da parte di determinasti
        
        2 more items...
    - - di un certo valore,
        
        he in certi casi
        
        deve essere 0,
        
        o posso dare,
        
        n'indicazione di sicurezza,
        
        di quell'alimento
  - - - batterica totale,
      - o la concentrazione minima,
        
        che è indicativa,
        
        del livello
        
        a cui un alimento
        
        diventa inaccettabile,
    - - anche un indicatore
        
        chimico,
        
        cioè se io so che,
        
        un determinato
        
        microrganismo produce
        
        un metabolita,
        
        1 more item...
    - - quale è la concentrazione,
        
        minima
        
        accettabile
        
        oltre la quale
        
        non va più bene
  - - - microrganismi,
        
        e la loro presenza
        
        indicativa,
        
        della qualità di
        
        un determinato alimento
      - e in certi casi
        
        la quantità deve
        
        stare in un certo
        
        reing
      - in altri
        
        del tutto assenti
      - o in quantità controllata
      - e la presenza di questi,
        
        è indicativa
        
        della qualità
        
        i un determinato alimento
    - - e alimenti di riferimento
        
        vi è una quantità
        
        di metaboliti
        
        che va bene fino
        
        ad un certo punto,
        
        perchè è parte integrante
        
        di quell'alimento,
        
        dopo no,
        
        e vuol dire che vi è state,
        
        una proliferazione
        
        1 more item...
        
        dei processi alteratici,
        
        1 more item...
- - - - abbiamo quella
        
        che si chiama,
        
        Type strain (ceppo tipo):
        
        che è quello che
        
        magari pero primo
        
        è stato caratterizzato,
        
        1 more item...
  - - - per scissione binaria,
        
        e quindi vi
        
        devono essere,
        
        tutta una serie
        
        di caratteristiche,
        
        che mi permettono
        
        1 more item...
  - - - altri ceppi
        
        caratteristici,
        
        di una determinata
        
        specie,
        
        ma per quella
        
        determinata specie,
        
        rimane comunque
        
        un ceppo tipo
        
        che è quello principale
        
        1 more item...
  - - - alla tassonomia,
      - quindi, alla classificazione
        
        degli animali
        
        li il criterio di base,
        
        per definire
        
        una specie
        
        rispetto ad un'altra,
        
        è il fatto che
        
        1 more item...
  - - - per scissione,
        
        e da un determinato
        
        isolamento
        
        avere un ceppo,
        
        che deve essere
        
        caratterizzante,
    - - il ceppo batterico:
        
        è una popolazione
        
        omogenea,
        
        che deriva
        
        da un singolo isolamento
  - - - rispetto a quelli che sono
        
        i criteri di classificazione,
        
        che si adottano
        
        per gli organismi superiori,
- - - - che nell'insalata
        
        che mangiamo,
        
        ci sono microrganismi,
        
        e questi lì dentro,
        
        in qualche modo
        
        interagiscono
        
        1 more item...
    - - vi sono microrganismi endigeni,
        
        che costituiscono
        
        a microflora
        
        caratteristica di,
        
        quel sistema
  - - - n uno stesso ambiente,
        
        svolgono una influenza
        
        reciproca
    - - di un determinato prodotto,
        
        avrà una composizione
        
        dinamica
        
        come,
        
        nell'insalata ci sono
        
        dei microrganismi,
        
        1 more item...
        
        ma se poi la tengo,
        
        1 more item...
  - - - un sistema complesso,
        
        come quello
        
        della matrice alimentare
        
        vi possono essere
        
        dei scambi genetici
    - - ma hanno un effetto
        
        sul metabolismo,
  - - - questo interagisce,
        
        con la microflora indigena,
    - - ci sono contaminati
        
        che preservano gli alimenti,
        
        significa che
        
        microrganismi
        
        che producono acidi,
        
        servono per formaggi,
        
        1 more item...
        
        ma vuol dire anche,
        
        1 more item...
  - - - ecositema in cui
        
        si trovano a vivere
        
        diversi tipi
        
        di microrganismi
    - - che riguarda
        
        la microbiologia
        
        degli alimenti
  - - - di quantità
      - e qualità,
        
        perchè se arriva
        
        un patogeno aggressivo
        
        e in grosse quantità
        
        è un problema,
        
        quindi se il patogeno
        
        è mmolto aggressivo,
        
        molto virulento,
        
        1 more item...
    - - elevate
      - e non è molto virulento,
        
        normalmente
        
        a microflora indigena
        
        e quella all'opera
        
        nella produzione
        
        di un determinato alimento
        
        è sufficiente per bloccarlo
        
        1 more item...
  - - - di scambio di segnali
        
        molecolari,
        
        tra cellule batteriche
        
        attraverso quello che è
        
        l processo
        
        di quorum sensing,
  - - - positive e negative,
        
        che si svolgono
        
        tra i diversi microrganismi
  - - - e specie diverse
        
        che crescono bene,
        
        solamente quando
        
        sono insieme
    - - che posso avere
        
        a che fare,
        
        con microrganismi
        
        che hanno caratteristiche
        
        tali per cui,
        
        ognuno ha
        
        1 more item...
    - - qualcuno che
        
        o complementa,
        
        allora sta bene,
    - - batteri auxotrofi,
        
        ovvero che uno
        
        ha bisogno di
        
        un ausilio per
        
        una determinata sostanza,
      - quindi come
        
        in Lactobacillus
        
        che non riesce a fare
        
        la fenilalanina,
        
        ovvero non ha i geni
        
        per fare questo composto,
        
        e quindi ha bisogno
        
        che gli venga somministrato
        
        dall'esterno
        
        e nell'ecosistema
        
        può usufruire della
        
        fenilalanina
        
        prodotta da
        
        un'altra specie
        
        e per esempio
        
        può essere
        
        lo streptococcus faecalis
        
        e questi 2 se si trovano,
        
        è simbiosi perfetta,
        
        perchè lactobacillus
        
        produce acido follico
        
        di cui è carente
        
        1 more item...
    - - in ambiente
        
        naturale
        
        o laboratorio,
        
        se levo uno dei due
        
        l'altro muore
        
        a meno che
        
        non agginugo
        
        1 more item...
    - - vengono poi
        
        fatti in laboratorio,
        
        con i terreni di crescita,
        
        in maniera controllata,
        
        in modo selettivo,
        
        usando un ingrediente
        
        invece che un altro
        
        e vedere cosa succede
        
        nella crescita
        
        1 more item...
    - - beijerinckia lacticogenes
        
        fissa azoto,
        
        (non ha bisogno di azoto)
        
        perchè lui lo trasforma
        
        n ammonio
        
        e poi va direttamente
        
        1 more item...
        
        ed è eterotrofo,
        
        ovvero necessita
        
        di una fonte
        
        di carbonio
        
        di zuccheri
        
        perchè non è capace
        
        1 more item...
      - e il thiobacvillus ferroxidans,
        
        è autotrofo
        
        che fissa la CO2
        
        è capace di crescere
        
        in assenza
        
        di composti organici,
        
        perchè fissa la CO2
        
        come le piante,
        
        è un chemioautotrofo,
        
        cioè non è fototrofo
        
        che usa la luce,
        
        come fonte di energia
        
        ma usa sostanze
        
        chimiche
        
        ma poi sa usare
        
        a CO2
        
        e quindi è autotrofo
      - quindi
        
        abbiamo che
        
        uno è autonomo
        
        per l'azoto,e
        
        l'altro per
        
        il carbonio
        
        se questi 2
        
        si trovano nello
        
        stesso ambiente,
        
        e con copatibilità
        
        per tutto il resto,
        
        3 more items...
        
        e quello che produce uno
        
        è utile per l'altro
        
        e vice versa
    - - se si mettono a crescere
        
        singolarmente
        
        non crescono
        
        ma s esi mettono in simbiosi,
        
        vi è una crescita
  - - - una popolazione microbica,
        
        dove si raggiunge
        
        una concentrazioneun
        
        a densità cellulare,
        
        per cui le cellule
        
        si trovano vicine,
        
        noi qui avremo stimolato,
        
        1 more item...
    - - la popolazione cellulare
        
        iniziava ad aumentare,
        
        aderiva a substrato
        
        e iniziavano
        
        a prodursi queste molecola
        
        e sono quelle che determinano
        
        la capacità
        
        di fare il biofilm
        
        quindi i batteri,
        
        iniziano a produrre
        
        lattoni,
        
        questo va in giro,
        
        e si va a posizionare,
        
        sulla superficie
        
        1 more item...
        
        e quindi da
        
        un certo punto di vista,
        
        non è neanche
        
        troppo specifico,
        
        ma devono essere
        
        1 more item...
        
        nel caso di esopolisaccaridi,
        
        ne vengono prodotti
        
        di più,
        
        perchè è stimolata
        
        a trascrizione
        
        1 more item...
        
        e batteri che lo
        
        sanno fare,
        
        lo fanno
        
        er vivere meglio
        
        risopetto allo stesso tipo,
        
        1 more item...
        
        i biofilm,
        
        li possono formare
        
        sìpsenomanas
        
        o altre specie
        
        anche su altre superfici,
        
        alcuni per esempio,
        
        1 more item...
    - - tramite cui i microrganismi
        
        che possono produrre
        
        e in realtà,
        
        sono poi capaci
        
        di subirne
        
        gli effetti
        
        queste molecole induttori,
        
        che poi son lattoni
        
        dal punto strutturale
    - - che quando le cellule
        
        sono tante,
        
        si potenziano
        
        l'una con l'altra,
        
        e quindi un processo
        
        come
        
        1 more item...
    - - avere una certa densità
        
        di popolazione,
        
        perchè ha la capacità
        
        di produrre,
        
        un determinato lattone,
        
        che poi ha questo effetto
        
        1 more item...
        
        ma in realtà poi,
        
        se quel lattone
        
        rimane nella cellula,
        
        ha un effetto,
        
        cioè,
        
        la cellula deve
        
        produrre il lattone,
        
        mandarlo fuori
        
        e poi rientrare
        
        1 more item...
        
        e poi, ciò che avviene,
        
        è che avremo,
        
        l'attivazione
        
        la trascrizione
        
        d geni diversi
        
        1 more item...
  - - - con syntrophomonas,
        
        che è microrganismo
        
        fermentatore,
        
        e usa principalmente
        
        acido butirrico
        
        e in questo processo
        
        produce idrogeno,
        
        e quando produce
        
        troppo idrogeno,
        
        si inibisce da solo
    - - una catena complessa,
        
        n cui a monte
        
        vi è il syntrophomonas,
        
        che produce idrogeno,
        
        che è usato da
        
        questi altri,
        
        e va a servire
        
        anche altre
        
        1 more item...
        
        ma la rimozione
        
        di idrogeno
        
        1 more item...
    - - uno dei 2 cresce,
      - e l'altro la situazione
        
        è indifferente,
    - - da syntrophomonas,
        
        diventa una fonte
        
        nutritiva,
        
        energetica,
        
        per questi altri batteri,
        
        quindi loro
        
        usano l'idrogeno
        
        1 more item...
    - - una situazione in cui
        
        i 2 ceppi crescono meglio,
        
        se stanno in colture insieme,
    - - se in questo sistema,
        
        lui crescerebbe pure,
        
        ma ad un certo punto
        
        smette di svilupparsi,
      - e la presenza
        
        n questo ambiente come
        
        batteri che hanno
        
        una attività particolare,
        
        per cui
        
        sono capaci
        
        1 more item...
  - - - 2 specie,
        
        vanno a competere
        
        per qualche cosa
        
        come magari
        
        o stesso substrato,
        
        stesse vitamine
    - - quello che ha
        
        l metabolismo più veloce,
        
        per quella fonte
        
        imitante
  - - - ma se ambiente
        
        povero di ossigeno,
        
        ovviamente
        
        l'anaerobio non può
        
        esserci,m
        
        a anaerobio facoltativo,
        
        o può usare,
        
        e poi continua
        
        1 more item...
      - microrganismo che
        
        è anaerobio obbligato,
        
        che in presenza di ossigeno
        
        questo,
        
        non può sopravvivere,
        
        perchè non ha enzimi per
        
        3 more items...
      - ma se in questo sistema
        
        si viene a trovare
        
        un anaerobio facoltativo
        
        che inizia ad usare
        
        l'ossigeno presente,
      - e a quel punto,
        
        l'anaerobio obbligato,
        
        potrà crescere
      - diciamo anaerobio facoltativo,
        
        perchè se è
        
        aerobio
        
        questo usa ossigeno,
        
        ma deve essere un ambiente,
        
        dove è sempre presente
        
        1 more item...
      - qui il vantaggio
        
        è per anaerobio obligato
    - - in cui uno si avvantaggio
      - e per l'altro non succede nulla
    - - nitrosomonas,
        
        sottopongono l'ammoniaca
        
        prodotta dalla fissazione
        
        dell'azoto,
        
        o dalla degradazione
        
        di proteine,
        
        amminoacidi,
        
        o altro
        
        e questa ammoniaca,
        
        è soggetta ad ossidazione,
        
        da parte di questi
        
        nitrosomonas,
        
        1 more item...
        
        e poi il nitrito,
        
        può diventa
        
        fonte di composti azotati
        
        e rnitrobacter,
        
        che la trasforma
        
        1 more item...
      - e tutto ciò,
        
        visto che stiamo
        
        parlando di fonte
        
        di azoto,
        
        ma anche energia,
        
        diventa anche
        
        molto importante
        
        1 more item...
      - e ora,
        
        mentre nitrosomonas
        
        usano ammoniaca,
        
        quindi se la trova
        
        la usa,
        
        i nitrobscter
        
        usano
        
        composto meno abbondante,
        
        e la cui produzione
        
        è legata
        
        1 more item...
      - quindi nitrobacter
        
        si avvantaggia
        
        dell'attività metabolica
        
        dei nitrosomonas,
        
        quindi è un commensale
        
        dei nitrosomas
  - - - in un ecosistema
        
        vi sono microrganismi diversi,
        
        almeno in natura,
    - - diverse cose,
        
        dipendono dal tipo
        
        di ambiente
        
        dalle caratteristiche
        
        che ha e come
        
        può influire sulle
        
        caratteristiche
        
        1 more item...
    - - io ho diversi
        
        generi
        
        specie
        
        di microrganismi
        
        e ognuno di questi
        
        stabilisce le sue interazioni
        
        con i suoi vicini,
        
        1 more item...
  - - - si nutre di un'altra
    - - non ci sta,
        
        ei batteri da soli
        
        possimo trovare
        
        che un batterio
        
        e preda di un'ameba
        
        che è predatore
  - - - cresce a spese dell'altra
    - - nei batteri,
    - - dobbiamo avere
        
        in parassita
        
        un microrganismo
        
        he cresce dentro
        
        un altro,
    - - che sembra a
        
        piccolo vibrione,
        
        a è un piccolo batterio
        
        che da solo non ha
        
        tutto l'apparato
        
        per potersi sviluppare,
        
        e quindi infetta
        
        cellule di E. coli,
        
        con sistema
        
        1 more item...
        
        ma poi,
        
        penetra all'interno,
        
        si stabilisce,
        
        si replica,
        
        usandso gli enzimi
        
        1 more item...
        
        poi la distrugge,
        
        esce fuori
        
        1 more item...
    - - altri facoltativi,
      - altri ectoparassiti
      - parassiti obbligati
      - endoparassiti,
        
        e diciamo che,
        
        la cosa fondamentale
        
        consiste nel fatto che,
        
        crescono a spese
        
        di quell'altro
        
        1 more item...
  - - - a crescita dell'altro,
    - - l'antibiotico del batterio
    - - lo fanno i stessi
        
        microrganismi
        
        come difesa,
    - - sono quelli prodotti da
        
        funghi
        
        batteri genere
        
        Bacillus,
        
        streptomyces,
        
        contro diverse
        
        specie batteriche
    - - i pseudomionas
        
        contro fusarium
        
        (fitopatogeno)
    - - lactobacillus
        
        contro clostridium,
        
        lystera,
        
        S. aureus
- - - - patogeni animali
        
        candida:
        
        opportunista,
        
        infezioni locali
        
        e sistemiche,
        
        e molti sono
        
        dermatofiti
        
        quindi prediligono
        
        a pelle,
        
        e li si sviluppano
        
        e poi sono
        
        difficili da debellare
        
        perchè essendo eucarioti,
        
        2 more items...
      - fitopatogeni
        
        fusarium
        
        botrytis: vite
        
        e in determinati casi
        
        è negativa, muffa griggia,
        
        positiva, muffa nobile
    - - kluiveromyces, pichia:
        
        proteine,
      - aspergillus
        
        acido citrico,
      - saccharomyces
        
        prodotti fermentati,
        
        utile nella
        
        lievitazione
      - penicillum
        
        penicillina G
  - - - scissione:
        
        quella che avviene
        
        in schyzzosaccaromyces
        
        dove si arriva
        
        a 2 cellule
      - sporulazione asessuale:
        
        ovvero nei funghi
        
        che fanno delle ife,
        
        che possono essere
        
        diploidi,
        
        che servono
        
        1 more item...
        
        ed è caratteristico
        
        delle muffe,
        
        ovvero queste che
        
        si staccano
        
        e si diffondono
      - gemmazione:
        
        è tipico
        
        nei lieviti,
        
        dove si ha
        
        una duplicazione
        
        del materiale genetico,
        
        dei cromosomi,
        
        1 more item...
  - - - ma sono saprofiti,
        
        (si nutrono
        
        di materia organica
        
        morta
        
        o in decomposizione)
      - o parassiti
        
        (vantaggio--nutrizionale,
        
        protezione
        
        a spese dell'ospite,
        
        causandogli
        
        un danno biologico)
    - - hanno una parete,
        
        (molecola presente
        
        la chitina)
      - e cellule
        
        sono aploidi o diploidi
      - e la riproduzione
        
        sessuale
        
        o asessuale
    - - e quando si dividono
        
        vanno a formare
        
        lunghi filamenti,
        
        formati da cellule
        
        allungate,
        
        mono, pluricellulare,
        
        1 more item...
    - - unicellulari i lieviti,
      - o pluricellulari
    - - è il corpo vegetativo
        
        (insieme delle ife)
      - ma questa parola,
        
        è usata anche
        
        per i lieviti
        
        anche se basterebbe
        
        chiamrli
        
        organismi unicellulare
        
        1 more item...
      - ma i organismi
        
        più complessi,
        
        abbiamo quello,
        
        olocarpico:
        
        in cui corpo è
        
        indifferenziato
        
        e si trasforma interamente
        
        1 more item...
        
        eucarpico:
        
        pluricellulare,
        
        corpo vegetativo
        
        1 more item...
  - - - asessuate
        
        propagazinoe
        
        e resistenza
        
        a condizioni avverse,
      - o sessuate
        
        riproduzione
    - - ascomiceti:
        
        le spore sono
        
        racchiuse nell'asco
        
        (sacchetto),
      - carpofori o corpi fruttiferi:
        
        le strutture che
        
        contengono le spore
        
        nei funghi superiori,
        
        funghi a cappello
        
        (basidomiceti),
        
        tartufi
        
        (ascomiceti)
      - prodotte per meiosi
        
        da una cellula madre,
        
        e posso moltiplicarsi
        
        per mitosi,
      - basidiomiceti:
        
        le spore sono
        
        poggiate sul basidio
        
        (base),
  - - - dominio: eukaryota
      - phyla:
        
        ascomycota
        
        (quello che ci interessa),
        
        e comprende
        
        genere:
        
        aspergillus,
        
        1 more item...
        
        penuicillum
        
        1 more item...
        
        saccharomyces,
        
        1 more item...
        
        chytridiomycota,
        
        zygomicota,
        
        e i basydiomycota
      - regno: funghi
    - - una classificazione
        
        precedente
        
        in cui erano divisi
        
        regno:
        
        e eumycota
        
        e comprondevano:
        
        5 more items...
        
        in myxomycota
      - usata fino al 1995
  - - - con modalità che sono
        
        simili a quelle
        
        della scissione
        
        di un batterio,
        
        ma solo perchè
        
        si tratta
        
        1 more item...
    - - o sabbiamo un ciclo
        
        o tipo sessuata
        
        o asessuata,
    - - aploide,
        
        con corredo genetico
        
        con un cromosoma
        
        er ogni coppia,
        
        si possono unire,
        
        quando appartengono
        
        a gruppi
        
        ad un tipo di
        
        accoppiamento differente,
        
        e sono caratterizzati,
        
        1 more item...
        
        le 2 cellule si uniscono,
        
        si ha fusione nucleare
        
        si realizza la duplicazione
        
        e poi un processo
        
        di divisione,
        
        in questo caso
        
        1 more item...
        
        quindi quì,
        
        per mitosi
        
        abbiamo
        
        riproduzione di tipo
        
        asessuate,
        
        1 more item...
        
        ed è detta,
        
        per gemmazione
      - o diploidi,
        
        cromosomi a coppie
        
        di omologhi,
        
        la cellula
        
        piuù andare incontro
        
        a meiosi
- - - - da alimento
        
        andato a male,
    - - un patogeno,
        
        devo già avere
        
        delle conoscenze,
        
        quindi andrò già
        
        a cercare qualcosa,
  - - - si possono usare
        
        diversi approcci,
        
        perchè non è detto
        
        che 1 cosa basati,
  - - - che i microrganismi
        
        abbiano
        
        una determinata origine
  - - - quando vado ad usare,
      - a scegliere i criteri,
        
        per identificare
        
        i microrganismi
        
        in un alimntio,
        
        io devo partire
        
        da conoscenze acquisite
        
        1 more item...
  - - - un microrganismo
        
        a che specie appartiene
        
        a che categoria,
        
        di soliti
        
        devo seguire
        
        un approccio
        
        polifasico
  - - - è tipo genotipico:
        
        qui il sequenziamento
        
        del DNA,
        
        o di segmenti di DNA;
        
        è una delle cose
        
        che oggi
        
        è più usata
        
        e sequenziamento
        
        di segmenti di DNA
        
        vuol dire
        
        di alcuni geni,
        
        1 more item...
        
        perchè a volte,
        
        lo sviluppo
        
        su determinati zuccheri,
        
        presenza di un
        
        carattere particolare,
        
        1 more item...
        
        la sequenza del DNA 16S,
        
        mi danno l'indicazione
        
        1 more item...
      - tipo fenotipico:
        
        caratteri espressi
        
        morfologia,
        
        fisiologia
        
        (API test,
        
        fermentazioni,
        
        resistenza agli antibiotici,
        
        nutrizionale)
        
        enzimologia
        
        serologia
        
        (anticorpi
        
        o policlonali)
        
        mono
        
        marcatori chemotassonomici
        
        acidi grassi cellulari,
        
        lipidi polari,
        
        poliammine,
        
        costituenti parete
        
        cellulare
        
        altro
        
        proteine
        
        profilo elettroforetico
        
        delle proteine totali,
        
        o di superficie
        
        (mono o bidimensionali)
        
        profilo degli
        
        enzimi
- - - - i microrganismi
        
        dal progenitore ancestrale
        
        (LUCA),
  - - - è partito tutto,
        
        e abbiamo
        
        batteri
        
        e poi in un'altra diramazione
        
        archaea
        
        e eucarya
  - - - schematica,
        
        delle relazioni filogenetiche
        
        fra gli organismi
        
        che mi permette
        
        di capire
        
        quanto questi
        
        1 more item...
    - - vi è una diramazione,
        
        significa che il gruppo,
        
        si è distanziato
        
        precocemente
        
        rispetto a tutti
        
        gli altri
    - - distinzione
        
        tra archaea
        
        e eucarya (eucarioti)
        
        e ho pianate,
        
        ecc,
        
        poi ho animali,
        
        e da qui,
        
        da una linea filogenetica,
        
        che è comune
        
        si distaccano
        
        1 more item...
        
        e poi gli animali
        
        avranno un albero
        
        filogenetico
        
        1 more item...
  - - - si va nel dettaglio,
        
        si ha poi un albero
        
        filogenetico,
        
        più completo,
        
        più specifico
        
        per una
        
        determinata categoria
  - - - da cui si ripartono
        
        tutte le altre,
        
        e ognuno di questi,
        
        è un phylum,
        
        ovvero un gruppo
        
        filogenetico importante,
    - - si prima
      - che altri conosciuti
        
        recentemente
        
        grazie alle
        
        tecniche molecolari,
- - - - del genoma
  - - - tecniche
        
        di tipo molecolare
        
        ovvero analisi su,
        
        DNA o RNA,
        
        per avere informazioni
        
        sulle relazioni tassonomiche
        
        1 more item...
        
        e anche per
        
        l'identificazione
        
        1 more item...
  - - - facendo uso
        
        del materiale genetico,
        
        posso seguire
        
        tanti approcci diversi,
        
        tante modalità di analisi
        
        che si possono usare,
  - - - tutto il genoma
        
        di un microrganismo,
        
        (perchè un batterio
        
        ha in suo genoma,
        
        il cromosoma)
  - - - in base,
        
        cioè i batteri
        
        hanno una composizione,
        
        in basi
        
        guanina-citosina
        
        e timina-adenina
  - - - anche indicazioni
        
        a livello del genere,
        
        è il contenuti in GC,
        
        ovvero
        
        i nucleotidi
        
        sono 4
        
        1 more item...
    - - che permettono
        
        di capire
        
        qual è la percentuale,
        
        di guanina
        
        e citosina
        
        rispetto alla
        
        timina
        
        e adenina,
        
        1 more item...
    - - più forte un triplo legame,
        
        quindi se io ho
        
        una regione di DNA
        
        con più tripli legami,
        
        a parità di T°,
        
        si denaturerà
        
        1 more item...
    - - questi aspetti
        
        e altri paramenti,
        
        si può arrivare
        
        a capire,
        
        tutto ciò,
        
        ed è importante
        
        ed informativa
        
        1 more item...
  - - - su tutto il DNA
        
        sono quelli che riguardano
        
        l'omologia DNA-DNA,
        
        cioè, quando si fanno
        
        analisi di tassonomia,
        
        è una delle analisi
        
        2 more items...
        
        ma è quella che
        
        alla fine mi consente
        
        di capire l'omologia,
        
        1 more item...
        
        cioè io ho
        
        organismo A
        
        e organismo B,
        
        vogli sapere
        
        1 more item...
        
        e per fare questo
        
        si usa una tecnica,
        
        che mi permette
        
        1 more item...
        
        e qui quindi,
        
        se l'appaiamento
        
        avviene in maniera
        
        1 more item...
        
        e se non si appaiano
        
        in modo importante,
        
        1 more item...
        
        ma in realtà,
        
        quando ho
        
        2 DNA,
        
        1 more item...
        
        possiamo dire
        
        che sui batteri,
        
        dobbiamo ancora
        
        1 more item...
  - - - meno complicate,
        
        a livello di tecnologie,
        
        di macchinari,
        
        che si fanno
        
        comunemente
        
        ei laboratori,
        
        come la tecnica,
        
        3 more items...
  - - - anche un singolo gene,
        
        ed è importante,
        
        e sappiamo,
        
        che ogni organismo
        
        ha un genoma
        
        con tanti geni,
    - - dal punto
        
        della fisiologia,
        
        dell'organismo,
        
        hanno tutti importanza,
        
        ovvero che
        
        tutti i geni,
        
        se stanno lì,
        
        2 more items...
    - - alcuni geni,
        
        che studiandoli,
        
        si è visto che hanno
        
        una particolare rilevanza
        
        dal punto di vista,
        
        della conoscenza nostra,
        
        cioè,
        
        è gene importantissimo,
        
        per l'organismo,
        
        ma per noi,
        
        ha un'importanza
        
        perchè ci permette
        
        di trarre
        
        1 more item...
        
        e tipicamente,
        
        uno di questi geni,
        
        è quello per RNA 16S,
        
        che è un RNA ribosomiale,
        
        e questo
        
        1 more item...
        
        ed è stato studiato
        
        anche il suo corrispondente,
        
        RNA ribosomiale 18S,
        
        1 more item...
        
        ed è quello,
        
        che ha permesso
        
        di costruire
        
        1 more item...
        
        e questo
        
        è stato particolarmente
        
        studiato,
        
        perchè ha
        
        delle caratteristiche,
        
        1 more item...
        
        quindi,
        
        quando studiamo
        
        un unico gene,
        
        lo dobbiamo scegliere
        
        per bene,
        
        1 more item...
- - - - e caratteristiche
      - i criteri,
        
        di microrganismi,
    - - cosa andiamo
        
        a vedere
        
        per definire
        
        come è fatto
        
        un microrganismo,
  - - - per distinguere
        
        i microrganismi,
        
        gli uni dagli altri
  - - - la morfologia delle colonie:
        
        (crescita sui
        
        terreni selettivi,
        
        per vedere
        
        le modalità
        
        di sviluppo,
        
        1 more item...
  - - - riguardano la fisionlogia:
        
        ovvro,
        
        i batteri crescono
        
        a differenti
        
        T°,
        
        pH,
        
        presenza o meno di ossigeno,
        
        e tutti questi,
        
        1 more item...
  - - - la scienza
        
        cambia,
        
        si hanno
        
        nuove conoscenze,
        
        nuove tecniche
        
        per sapere
        
        nuove cose,
    - - essere aperti
        
        a nuove conoscenze,
        
        e alla possibilità
        
        che arrivi qualche cosa,
        
        che metta in discussione
        
        anche delle conoscenze
        
        acquisite
  - - - la divisione di Gram,
        
        fatta con la colorazione,
        
        in cui i batteri
        
        sono comunque suddivisi,
        
        in 2 categorie
        
        i Gram negativi
        
        e Gram positivi,
        
        1 more item...
  - - - tutta una serie
        
        di specifiche,
        
        perchè non basta
        
        essere psicotrofo,
        
        ma bisogna mettere
        
        insieme
        
        1 more item...
  - - - e qui ci vuole
        
        il microscopio,
        
        ma prima di questo
        
        molte cose
        
        non si sapevano,
        
        ma da quando
        
        è stato scoperto,
        
        e quindi si sono
        
        viste le cose
        
        1 more item...
  - - - in questo campo,
        
        molte delle conoscenze
        
        nuove che
        
        via vi a si accumulano,
        
        servono principalmente,
        
        a confermante
        
        1 more item...
  - - - le proteine,
      - fare un profilo
        
        delle proteine
        
        che compongono
        
        i batteri,
        
        i quali invece
        
        sono gli enzimi,
        
        1 more item...
    - - se io vedo composizione
        
        proteica totale,
        
        includo anche
        
        gli enzimi,
      - ma se vogli vedere,
        
        proteine con
        
        funzioni di enzimi
        
        allora posso fare,
        
        dei tipi di analisi
        
        differenti
  - - - che servono per
        
        andare a vedere
        
        quali sono
        
        gli antigeni presenti
        
        sulla superficie,
        
        il che è importante
        
        1 more item...
  - - - fermentare i carboidrati,
        
        comunque saper
        
        metabolizzare,
        
        certi zuccheri,
        
        significa
        
        differenze metaboliche,
        
        1 more item...
    - - in acidi grassi,
        
        la superficie delle cellule
        
        è una struttura lipidica,
        
        quindi poter identificare
        
        come sono fatti
        
        questi acidi grassi,
        
        mi da delle
        
        informazioni
        
        1 more item...
  - - - ci possono aiutare,
        
        per avere la possibilità
        
        di identificare
        
        un microrganismo
        
        a livello di
        
        gene,
        
        specie,
        
        ma anche di ceppo
- - - - deterioranti,
        
        fanno danni visibili,
        
        o percepibili,
        
        per cui il danno,
        
        è principalmente
        
        di tipo economico,
        
        perché avremo
        
        1 more item...
  - - - di zuccheri
        
        può prevenire,
        
        le contaminazioni microbiche,
    - - pensando a microrganismi
        
        che fermentano,
        
        sono interessanti,
        
        perchè producono
        
        degli elementi,
        
        e non esiste
        
        1 more item...
    - - contaminate,
        
        che si trova
        
        su una matrice alimentare,
        
        se è di suo gradimento,
        
        inizierà ad usare
        
        l materiale a disposizione,
    - - per produrlo
        
        quell'alimento
    - - di trasformazione microbica
        
        degli alimenti,
        
        avvengono perchè
        
        i microrganismi
        
        si possono sviluppare
        
        all'interno
        
        1 more item...
    - - che le fermentazioni
        
        riducendo la presenza
        
        degli zuccheri
        
        ridice anche,
        
        a possibilità
        
        di ulteriori contaminazioni
        
        sia perchè
        
        viene a mancare
        
        1 more item...
    - - che la fermentazione
        
        poi determina
        
        una diminuzione di pH,
        
        quindi a pH basso
        
        si ha una diminuzione
        
        delle potenzialità di sviluppo
        
        2 more items...
    - - trasformazioni
        
        che alcuni microrganismi
        
        possono svolgere
        
        sulla matrice alimentare
        
        portando alla produzione,
        
        di prodotto che
        
        1 more item...
    - - attività enzimatiche
        
        che contribuisvono
        
        nel determinare
        
        caratteristiche dell'alimento,
        
        aroma, sapore,
        
        consistenza,
  - - - utili,
      - indesiderati
        
        sono quelli che
        
        possono portare
        
        ad una
        
        alterazione degli alimenti
        
        perchè hanno degli effetti
        
        1 more item...
        
        e quindi portano,
        
        alla produzione
        
        di molecole
        
        che incidono
        
        sulle caratteristiche
        
        1 more item...
        
        e rappresentano
        
        un problemap importante
      - e patogeni
        
        sono quelli che
        
        sono un rischio,
        
        er la salute,
        
        e per patogeni alimentari,
        
        si ha alimento
        
        che diventa veicolo
        
        di trasmissione
        
        di malattie
  - - - da patogeno
        
        è un pericolo,
        
        noi spesso
        
        non lo possiamo percepire,
        
        ma ingerendo
        
        questo alimento
        
        poi si scatena
        
        1 more item...
  - - - batteri lattici
        
        per prodotti
        
        lattiero caseari
      - lieviti, batteri
        
        per pane,
        
        prodotti vegetali
        
        fermentati
      - aceto,
      - lieviti
        
        per birra,
        
        bevande alcoliche
        
        fermentate
      - integratori alimentari
    - - creali
        
        prodotti forno,
        
        birra,
        
        sakè
      - frutta e verdura
        
        vino (uva)
        
        tequila (agave)
      - latte
        
        formaggi, yogurt
      - carne
        
        salumi,
    - - vegetali fermentasti
        
        lactobaccillus plantarium,
        
        leuconostoc mesenteroides,
        
        pediococcus pentosaceus,
        
        enterococcus faecalis,
        
        abbassamento pH,
        
        produzione acidi organici
      - formaggi, latti fermentati
        
        lactociccus lactis,
        
        leuconostoc mesenteroides
        
        staèphilococcus thermophilus,
        
        ed altri
        
        abbassano pH,
        
        e producono
        
        acidi organici
      - formaggi
        
        brevibecterium lenens
        
        attività metabolica
        
        sulla matrice
        
        lipolisi,
        
        pigmentazione
        
        quindi lisano,
        
        1 more item...
        
        proteolisi
      - pane prodotti forno
        
        lactobacillus sanfranciscensis
        
        altri
        
        abbassamento pH,
        
        produzione acidi organici
      - birra
        
        saccharomyces cerevisiae
        
        producono
        
        etanolo e CO2
      - pane e prodotti lievitati
        
        saccaromicies cerevisiae
        
        producono
        
        etanolo e CO2
      - vino
        
        saccariìomicies cerevisie
        
        produce
        
        etanolo
        
        e CO2
        
        lactobacillus plantarioìum
        
        produce
        
        composti aromatici
      - carni fermentate
        
        lactobacillus plantarium
        
        abbassamento pH
        
        produzione acidi organici
        
        fermentazione zuccheri
        
        con produzione
        
        acido lattico
      - insaccati
        
        staphylococcus carnosum
        
        riduzione nitrati,
        
        (stabilizzazione colore,)
        
        aroma,
        
        proteolisi,
        
        lipolisi
      - e tanti altri prodotti
        
        con specifiche
        
        specie batteriche
        
        con una attività
        
        diversa
- - - - sistematico,
        
        usato da tutti
        
        i microbiologi,
        
        e abbiamo
        
        un raggruppamento
        
        in categorie:
        
        6 more items...
        
        e sono le categorie
        
        1 more item...
  - - - e sono presenti
        
        in ambienti
        
        sia nei vegetali
        
        come endofiti,
        
        ma anche
        
        nel tratto intestinale
        
        e li troviamo anche,
        
        come organismi
        
        utili
        
        nei prodotti
        
        1 more item...
      - e in particolare
        
        lo streptococcus thermophilus,
        
        è spesso usato
        
        in colture di innesto
        
        per formaggi
        
        ed ha un'azione
        
        acidificante
        
        e aromatizzante
      - sono aerobi,
      - quando si dividono,
        
        le cellule
        
        rimangono vicine
        
        e formano una catenella
      - e un contenuto di GC
        
        del 33-42%
      - sono cocchi,
        
        forma sferica
        
        o ovoidale
      - ma in questo genere,
        
        possiamo trovare
        
        anche dei patogeni,
        
        come:
        
        S. pyogenes
        
        un beta emolitico
        
        1 more item...
        
        e S. mutans
        
        causa carie
        
        (è streptococco orale)
        
        sono batteri che
        
        1 more item...
      - classe: bacilli
        
        ordine: lactobacillales
        
        phylum: firmicutes
        
        famiglia: streptococcaceae
        
        genere: streptococcus
    - - genere Lactobacillus
        
        fanno una fermentazione
        
        omo ed etero-lattica
        
        quindi in campo alimentare
        
        hanno una
        
        grandissima applicazione,
        
        ci sono diversi
        
        ceppi selezionati,
        
        che poi vengono
        
        usati
        
        non fanbno
        
        spore
        
        sono microrganismo
        
        immobili,
        
        quindi non hanno
        
        ne ciglia
        
        ne flagelli,
        
        e non si muovono
        
        1 more item...
        
        sono aerobi,
        
        ma prediligono
        
        habitat con
        
        bassa tensione
        
        di ossiggeno
        
        è un genere
        
        molto importante
        
        in campo alimentare
        
        perchè è il microrganismo
        
        che contiene le specie
        
        che danno il via
        
        ai processi
        
        1 more item...
        
        sono presenti
        
        nelle piante
        
        come endofiti,
        
        quindi sono
        
        parte integrante
        
        1 more item...
        
        e anche nei prodotti
        
        lattiero-caseari
        
        è un commensale
        
        dell'uomo:
        
        microbiota intestinale
        
        e vagliale
        
        con specie
        
        e ceppi,
        
        che sono ambientati
        
        1 more item...
        
        usati per
        
        produzione
        
        di formaggi
        
        e insaccati
        
        e un contenuto in GC
        
        del 35-53%
        
        e oltre a fare,
        
        la fermentazione lattica,
        
        possono usare
        
        il lattosio,
        
        grazie all'enzima
        
        2 more items...
        
        ci sono 2 tipi
        
        di fermentazione
        
        e la eterofermentsativa
        
        osiamo ottenere
        
        anche altri
        
        1 more item...
        
        la omofermentativa
        
        da qui otteniamo
        
        l'acido lattico
        
        e troviamo queste
        
        modalità di fermentazione,
        
        differenti,
        
        in diversi microrganismi,
        
        ma popi la modalità cambia
        
        a monte,
        
        nel 1° caso:
        
        abbiamo che
        
        1 more item...
        
        nel 2° caso:
        
        abbiamo un altro tipo
        
        1 more item...
      - e in base
        
        alle modalità
        
        di fermentazione
        
        ovvero
        
        del tipo di prodotti
        
        che si ottengono
        
        possiamo distinguere
        
        i lactobacilli
        
        2 more items...
      - e vuol dire che
        
        la fermentazione
        
        da parte
        
        di questi microrganismi
        
        conduce alla produzione
        
        di diverse
        
        1 more item...
      - non producono spere,
      - classe: bacilli
        
        ordine: lactobacillales
        
        phylum: firmicutes
        
        famiglia: lactobacillaceae
        
        genere:
        
        Lactobacillus
        
        Leuconostoc
        
        Oenococcus
        
        Streptococcus
    - - producono endospore,
      - sono aerobi,
      - hanno forma bastoncelli,
      - classe: bacilli
        
        ordine: bacillales
        
        phylum: firmicutes
        
        famiglia: bacillaceae
        
        genere: bascillus
      - e contengono varie specie,
        
        mesofile,
        
        termofiles,
        
        psicrofile,
      - e abbiamo
        
        e vi sono
        
        bacillus cereus
        
        patogeno aliemntare,
        
        bacillus thuringenis
        
        patogeno per insetti
        
        bacillus
        
        anthracis e cereus
        
        sono patogeni umasni,
        
        Bacillus subtilis
        
        che è la specie
        
        modello
        
        dei gram positivi
        
        (come la E.coli per i negativi)
        
        è stato studiato ampiamente,
        
        e sappiamo che
        
        è in compagnia
        
        con altre specie
        
        1 more item...
      - e con contenuto
        
        in GC di 32-62%
      - poi possiamo trovare
        
        delle caratteristiche
        
        importanti,
        
        rilevanti
        
        sia da un punto
        
        fisiologico
        
        che biochimico
        
        in alcune specie
        
        1 more item...
        
        e sono caratteristiche
        
        molto diverse,
        
        come vi sono
        
        microrganismi,
        
        con comportamenti
        
        1 more item...
      - e abbiamo
        
        termofili
        
        sviluppo a T° alte,
        
        acidofili,
        
        cresce a pH basso,
        
        psicrofili
        
        sviluppo sotto15°C
        
        e tanto altro
        
        fono ad arrivare
        
        a degradatori
        
        e patogeni
    - - ma alcuni ceppi,
        
        possono essere
        
        gli agenti causali
        
        dell'acne
        
        perchè sono capaci
        
        di creare questa
        
        1 more item...
      - sono colonizzatori
        
        della pelle,
        
        ovvero fano parte
        
        sia del microbioma
        
        cutaneo,
        
        quindi
        
        1 more item...
        
        e che e presente
        
        1 more item...
      - ma in realtà,
        
        all'interno
        
        di questo gene,
        
        troviamo anche
        
        delle specie
        
        che son utili,
        
        1 more item...
      - si dividono
        
        in maniera irregolare,
        
        e ciò porta,
        
        alla creazione
        
        di grappoli,
        
        caratteristici
        
        1 more item...
        
        ma le cellule
        
        1 more item...
      - è un organismo
        
        con capacità soprattutto
        
        di dare infezioni,
      - ma vi sono
        
        altre caratteristiche,
        
        i cocchi
        
        hanno forma sferica,
        
        o ovoidali
      - classe: bacilli
        
        ordine: bacillales
        
        phylum: firmicutes
        
        famiglia: staphylococcaceae
        
        genere: staphylococcus
      - nei cibi,
        
        la presenza
        
        di staphylococcus
        
        può essere un indice
        
        di pericolosità,
        
        soprattutto quando
        
        1 more item...
      - ma ve ne sono alcuni,
        
        che sono utili,
        
        come
        
        lo S. carnosus,
        
        che è usato come
        
        starter per gli insaccati,
        
        e lui fa,
        
        una riduzione
        
        1 more item...
      - quindi,
        
        spesso gli insaccasti
        
        sono trattati con questo,
        
        microrganismo,
        
        per aumentare
        
        il colore rosso
      - e l'ulteriore riduzinoe
        
        di questo nitrito
        
        adfì ammoniaca
        
        fa ridurre il pH,
        
        che favorisce
        
        la conservazione
        
        1 more item...
      - e poi si producono
        
        anche dei composti,
        
        come acidi grassi,
        
        amminoacidi
        
        che son o un prodotto
        
        del metabiolismo
        
        di questo staphylococcus,
        
        1 more item...
    - - non sporigeni:
        
        includono,
        
        streptococchi,
        
        lattobacilli
        
        qui vi sono
        
        diverse specie,
        
        che sono estremamente
        
        1 more item...
        
        staphylococcus,
        
        ci sono importanti
        
        patogeni alimentari
      - quindi alimenti
        
        con basso GC,
        
        sono più specializzati,
        
        e quindi
        
        hanno genoma
        
        un po più piccolo,
        
        e quindi tendono
        
        ad essre più specializzati
        
        ovvero,
        
        4 more items...
      - sono tipicamente
        
        dei sporigeni:
        
        con basso contenuto
        
        in GC
        
        che sono più specializzati
        
        presenti nel suolo,
        
        ci sono patogeni
        
        ed in cludono
        
        microrganismi,
        
        anaerobi: i clostridi,
        
        e aerobi: bacilli
      - sono batteri
        
        gram positivi,
        
        (parete esterna
        
        più spessa
        
        ed è quella che
        
        impedisce
        
        di poteste via il colore
        
        1 more item...
      - quindi questi,
        
        se sanno fare i patogeni,
        
        fanno i patogeni
        
        come i clostridi,
        
        una parte del
        
        loro genoma
        
        1 more item...
        
        cioè in condizioni
        
        avverse,
        
        2 more items...
    - - sono anaerobi
      - producono spore
      - sono bastoncelli,
      - sono termofile,
        
        ed hanno spore
        
        molto resistenti
      - classe: clostridia
        
        ordine: clostridiales
        
        phylum: firmicutes
        
        famiglia: clostridiaceae
        
        genere: clostridium
      - e se non termofili
        
        producono spore
        
        resistenti alle alte T°
        
        rispetto al ceppo
        
        in condizioni
        
        vegetative
      - includono,
        
        patogeni umani,
        
        e 7 neurotossine
      - e vi sono
        
        invece il botulinum,
        
        è patogeno alimentare
        
        il perfrigens,
        
        è patogeno alimentare
        
        clostidium tetani
        
        è molto pericoloso,
        
        perchè provoca,
        
        una patologia letale
        
        ma non è di tipo
        
        alimentare
        
        e altri
        
        hanno capacità metaboliche,
        
        particolari,
        
        come il acetobutylicum
        
        che producono
        
        3 more items...
      - alcuni hanno
        
        capacità di proteolisi
        
        e spiega perchè
        
        possono risultare
        
        importanti,
        
        nella degradazione
        
        1 more item...
      - ed hanno contenuto GC
        
        23-43%
  - - - alto contenuto
        
        in Guanina e Citosina,
      - hanno un genoma
        
        abbastanza abbondante,
      - sono gram positivi,
      - ed include ceppi
        
        produttori di antibiotici,
      - e in questo gruppo vi sono,
        
        i micobatteri:
        
        patogeni come
        
        micobacterium tuberculosis
      - quindi anche
        
        in questa categoria
        
        troviamo diversi
        
        tipi di organismi,
        
        che rispetto poi,
        
        a quelle che sono
        
        1 more item...
      - ma non lo possiamo
        
        considerare
        
        come parametro discriminarne,
        
        anzi è una cosa
        
        importante
        
        se un microrganismo
        
        2 more items...
      - le tecniche
        
        di classificazione,
        
        sono quelle che
        
        vanno a vedere
        
        quali sono
        
        le peculiarità metaboliche
        
        le caratteristiche
        
        1 more item...
        
        caratteristiche genetiche,
        
        ed altro
      - e il fatto,
        
        di poter agire
        
        su vari substrati,
        
        gli permette anche,
        
        di diventare patogeno
      - ma non posso considerare
        
        la patogenicità,
        
        come un qualche cosa,
        
        discriminante,
        
        a livello
        
        di genere
        
        o di specie,
      - perchè quello ha,
        
        magari la capacità
        
        di metabolizzare
        
        tante cose,
        
        e se le trova
        
        nell'ambirete naturale
        
        1 more item...
        
        o se lo trova,
        
        in un ambiente diverso
        
        1 more item...
      - ma per noi,
        
        è importantissimo
        
        se quel microrganismo
        
        è patogeno
        
        e cosa combina,
        
        però non può essere
        
        determinante
        
        1 more item...
      - ma quello che conta,
        
        è la capacità di fare
        
        certe cose,
        
        di avere
        
        determinaste proprietà
        
        metaboliche
      - i grppi importanti,
        
        propionibatteri
        
        e bifidobatteri
      - ordine actinomycetales,
    - - la flora microbica
        
        varia con l'età,
        
        ma la loro prevalenza,
        
        dipende anche
        
        dall'alimentazione
        
        che uno ha,
      - e nel caso
        
        dei lattanti
        
        dominano questi
        
        actinobacteri,
        
        in particolare
        
        gli apparteneti
        
        1 more item...
      - ed è usato anche
        
        come probiotico
        
        ovvero come
        
        microrganismo
        
        utile per le caratteristiche
        
        che può avere
        
        1 more item...
      - sono quelli,
        
        più caratteristici
        
        e presenti
        
        nell'intestino
        
        abbondanti
        
        nei lattanti,
      - dominio: prokaryota
        
        ordine:bifidobacteriales
        
        phylum: actinobacteria
        
        famiglia: bifidobacteriaceae
        
        genere: bifidobacterium
        
        regno: bacteria
    - - e fa la fermentazione
        
        propionica
        
        dell'acido lattico
        
        e questa fermentazione,
        
        produce la CO2
        
        che crea
        
        queste bolle
        
        nella matrice
        
        1 more item...
        
        e poi da
        
        i buchi caratteristici
      - lo troviamo in formaggi
        
        come emmenthal,
      - include
        
        anaerobi
        
        chemiorganotrofi
      - dominio: prokaryota
        
        ordine: actinomycetales
        
        phylum: actinobacteria
        
        famiglia: propionibacteriaceae
        
        genere: propionimacterium
        
        regno: bacteria
  - - - poche specie,
        
        perché scoperti
        
        e studiati
        
        da poco tempo
        
        è ciò è stato grazie,
        
        a tecniche
        
        di tipo molecolare
        
        1 more item...
  - - - un maggior numero
        
        di specie,
    - - anche insieme
        
        ad altri microrganismi
        
        importanti per l'ambiente
  - - - sono microrganismi
        
        gram negativi,
      - comprendono microrganismi,
        
        con gruppi
        
        che sono importanti
        
        non solo
        
        nel settore alimentare,
        
        ma anche,
        
        in campo ambientale
        
        e agrario
        
        perchè ci sono,
        
        1 more item...
      - tendenzialmente
        
        hanno un elevato
        
        contenuto
        
        in Guanina-Citosina,
        
        soprattutto nei generi,
        
        che includono
        
        1 more item...
      - e in questo phylum,
        
        sono inclusi,
        
        i batteri
        
        da cui si ritiene
        
        abbaino avuto
        
        origine i cloroplasti
        
        1 more item...
    - - importanti
        
        sia in capo alimentare
        
        ma anche
        
        agronomico,
        
        ambientale,
        
        perchè poi
        
        in qualche modo,
        
        interagiscono
        
        1 more item...
    - - in enterobatteriaceae
        
        escherichia, erwinia, enterobacter
        
        sono
        
        aerobi,
        
        anaerobi facoltativi,
        
        perchè loro,
        
        nell'intestino
        
        di animali,
        
        usano prodotti metabolici,
        
        1 more item...
        
        sono gram negativi,
        
        quindi noi,
        
        li possiamo trovare
        
        nell'ambiente,
        
        ma lì vi sono
        
        1 more item...
        
        hanno una forma
        
        bastoncellare,
        
        sono presenti
        
        in intestino animale,
        
        ma è da qui,
        
        che si diffondono
        
        1 more item...
        
        classe: gamma-proteobacteria
        
        ordine: enterobacteriales,
        
        phylum: proteobacteria
        
        famiglia: enterobatteriaceae
        
        genere:
        
        escherichia,
        
        erwinia,
        
        enterobacter
        
        e per questo che
        
        sono inclusi
        
        in questa categoria,
        
        microrganismi
        
        3 more items...
        
        e la loro presenza,
        
        negli alimenti,
        
        e nelle H2O,
        
        è un indicatore di
        
        un'avvenuta contaminazione,
        
        1 more item...
        
        e quando, si parla
        
        di contaminazione,
        
        si deve tener conto
        
        del fatto,
        
        1 more item...
        
        poi se si tratta
        
        di ceppi patogeni o no,
        
        1 more item...
        
        anzi nel momento
        
        in cui ho avuto
        
        1 more item...
        
        e se il ceppo che
        
        è stato portato
        
        1 more item...
        
        ma anche se
        
        1 more item...
        
        sono microrganismi,
        
        con contenuto in
        
        Guanina.citosina,
        
        più basso,
        
        1 more item...
        
        e caratteristiche di E. coli,
        
        ceppo K12,
        
        è il ceppo modello,
        
        per studi di
        
        1 more item...
        
        produce vitamina K,
        
        ed è uno dei motivi
        
        per cui sono presenti
        
        1 more item...
        
        è il microrganismo
        
        più conosciuto,
        
        nella storia
        
        1 more item...
        
        fermenta lattosio,
        
        è una famiglia,
        
        che raggruppa molti generi
        
        tutti molto importanti,
        
        per l'implicazione
        
        che hanno
        
        1 more item...
        
        sono enterobatteri,
        
        perchè
        
        il loro habitat preferenziale
        
        è l'intestino
        
        degli animali
    - - sono gram negativi,
      - sono incapaci di fermentazione,
      - e sono presenti principalmente
        
        in materiale
        
        in decomposizione
        
        come:
        
        nell'intestino di
        
        diversi animali,
        
        pollame,
        
        latte,
      - classe: beta-proteobacteria
        
        ordine: burkholderiales
        
        phylum: proteobacteria
        
        fasmiglia: alcaligenaceae
        
        genere: alcaligenes
      - visto che hanno
        
        una sviluppata capacità
        
        di agire sulle proteine,
        
        con capacità
        
        di proteolisi,
      - e infatti,
        
        il motivo per
        
        cui sono importanti,
        
        in questi processi
        
        di decomposizione,
        
        è che degradano
        
        1 more item...
      - e ciò fa si che
        
        ceppi selezionati,
        
        di alcaligenes,
        
        possono poi
        
        trovare applicazione
        
        a livello industriale
        
        1 more item...
    - - e poi l'etanolo,
        
        è attaccato
        
        da microrganismi
        
        del genere acetobacter,o
        
        gluconobacter,
        
        pasa per
        
        questi intermedi
        
        1 more item...
      - e ciò spiega,
        
        per quale ragione
        
        questi microrganismi,
        
        possano poi andare
        
        a risultare
        
        dei contaminanti
        
        1 more item...
      - in realtà
        
        la partenza l'etanolo,
        
        che in realtà
        
        è prodotto da,
        
        altri microrganismi
        
        partendo dagli zuccheri,
        
        1 more item...
      - ma è anche vero,
        
        che sono microrganismi,
        
        usati per
        
        la produzione di aceto,
        
        che ha una produzione
        
        elevata,
        
        e dipende
        
        da come sono
        
        usati
      - questimicrorganismi,
        
        sono capaci
        
        di fare una fermentazione
        
        partendo da
        
        un prodotto
        
        che è l'acido acetico
        
        1 more item...
      - e in condizioni normali,
        
        sono comunque presenti,
        
        sulla superficie
        
        dei vegetali,
        
        come piante
        
        fiori,
        
        frutti,
        
        ma li possiamo trovare
        
        in cereali fermentati,
      - classe: alfa-proteobacteria
        
        ordine: rhodospirillales
        
        phylum: proteobacteria
        
        fasmiglia: acetobacteriaceae
        
        genere:
        
        acewtobacter
        
        gluconobacter
      - quindi fino ad
        
        un certo punto,
        
        è normale
        
        che siano preseti
        
        in questo che
        
        è il loro ambiente,
        
        ma poi li troviamo
        
        n grossa quantità,
        
        nella frutta deteriorata,
        
        e in parte
        
        li possiamo trovare,
        
        in bevande fermentate
        
        ma in piccole quantità
      - hanno tendenzialmente,
        
        una T° ottimale
        
        di 25-30°C,
        
        ma si possono sviluppare
        
        anche a 5°C
        
        e ciò, rappresenta
        
        un problema,
        
        perchè a
        
        questa temperatura
        
        1 more item...
      - altre caratteristiche,
        
        hanno un contenuto
        
        in C-G del 55-60%,
        
        un PH ottimale
        
        al di sotto di 7,
        
        anche se crescono
        
        fino a pH 3
        
        in quanto producendo
        
        1 more item...
        
        hanno una tolleranza
        
        all'alcool etilico
        
        cosa che non vi è,
        
        per molti altri
        
        microrganismi,
        
        hanno la tolleranza,
        
        perchè lo usano,
        
        e sono tolleranti
        
        fino ad una gradazione
        
        1 more item...
        
        infatti quando
        
        si prepara
        
        un terrene selettivo
        
        per acetobatteri,
        
        1 more item...
        
        sono tolleranti
        
        all'acuito acetico,
        
        che hanno prodotto,
        
        fino ad un valore
        
        intorno al 10%,
        
        sono microrganismi
        
        aerobi,
        
        perchè hanno bisogno
        
        di ossigeno,
        
        per sviluppartisi,
        
        però poi
        
        sono capaci,
        
        di fare questa attività,
        
        1 more item...
        
        usano anche
        
        altri zuccheri,
        
        però hanno la capacità,
        
        particolare di usare,
        
        1 more item...
    - - sono microrganismi,
        
        in cui la caratteristica
        
        principale,
        
        è che sono
        
        anaerobi facoltativi
      - e quindi microrganismi,
        
        che sono capaci,
        
        di fare una fermentazione,
        
        in condizioni
        
        di anaerobiosi,
        
        ovvero quando
        
        2 more items...
      - e all'interno di
        
        questa categoria
        
        troviamo gli organismi,
        
        che alcuni
        
        sono benefici,
        
        come simbionti intestinali,
        
        1 more item...
        
        ma altri
        
        sono patogeni,
        
        anche molto pericolosi
    - - pseudomonas
        
        classe: gamma-proteobacteria
        
        ordine: pseudomonadales
        
        phylum: proteobacteria
        
        fasmiglia: pseudomonadaceae
        
        genere: pseudomonas
      - e burkholderia
        
        phylum: cproteobacteria
        
        classe: beta-proteobacteria
        
        ordine: buekholderiales,
        
        famiglia: burkholderiaceeae
        
        genere: burkholderia
        
        genere importante
        
        nell'ambiente
      - all'interno,
        
        di questi generi
        
        troviamo
        
        microrganismi diversi,
        
        inclusi
        
        molti patogeni
        
        3 more items...
    - - sarà alfa, beta, ecc
        
        perchè in questo
        
        phylum
        
        sono state distinte
        
        diverse classi
        
        e sono:
        
        6 more items...
      - ma questa distinzione,
        
        non è in tutti i phylum,
        
        ma solo
        
        nei più grandi
        
        e con differenze
        
        arcate
        
        nei vari gruppi
  - - - nel regno di batteri
        
        sono tantissimi
    - - che contengono
        
        microrganismi
        
        importanti in questo settore,
        
        sono:
        
        phylum dei proteobacteria
        
        phylum firmicutes
        
        phylum actinobacteria
  - - - di un genere,
        
        io ho microrganismi
        
        di diverse specie
        
        che si distinguono,
        
        tra loro,
        
        per delle caratteristiche
        
        1 more item...
    - - in comune
        
        li permette
        
        di mettere
        
        in uno stesso genere
    - - possono
        
        essere presenti
        
        in una famiglia
        
        perchè hanno
        
        caratteristiche in comune
        
        che permette di
        
        1 more item...
- - - - una serie di informazioni,
        
        che però hanno subito
        
        una serie di cambiamenti
        
        nel corso del tempo,
  - - - perchè è importante
        
        avere un'idea,
        
        di come si è arrivati
        
        alla situazione attuale,
        
        anche perchè
        
        sono cambiante
        
        1 more item...
  - - - era importante
        
        classificare gli organismi,
        
        per capire qualche cosa,
        
        e stabilire
        
        le correlazioni
        
        e le funzioni
        
        di ciascuno di essi,
  - - - animali (si muovevano)
      - piante
        
        (facevano fotosintesi)
      - e protozoi,
        
        ciò era stato fatto
        
        alla fine dell'800
        
        (organismi microscopici,
        
        e ancora
        
        non si poteva fare
        
        una distinzione
        
        di tipo sistemico
        
        e preciso
        
        3 more items...
  - - - ha suddiviso
        
        gli organismi viventi in 5 gruppi,
        
        piante,
        
        protisti,
        
        funghi,
        
        (sono stati separati,
        
        perchè sono
        
        completamente distinti
        
        non sono assimilabili alle piante,
        
        1 more item...
        
        monere
        
        (sono i procarioti)
        
        (sono stati distinti
        
        dai protisti)
        
        (che insieme
        
        1 more item...
        
        animali,
      - lui come criteri,
        
        per la suddivisione
        
        aveva usato,
        
        nutrizione
        
        (autotrofi: le pinte,
        
        fotto chemiosintesi
        
        e eterotrofi: funghi,
        
        assorbimento)
        
        riproduzione,
        
        organizzazione cellulare,
        
        motilità
        
        e i batteri hanno
        
        un po' tutto,
  - - - suddivisione in 6 gruppi
        
        piante,
        
        protisti,
        
        funghi,
        
        animali,
        
        e quelli che erano
        
        monera
        
        sono stati suddivisi
        
        eubatteria
        
        e archeabacteria
    - - che se si andava
        
        avanti così,
        
        la cosa diventava
        
        complicata,
        
        ed ha deciso
        
        di fare degli accorpamenti
        
        1 more item...
  - - - lui ha preso
        
        il lavoro
        
        di precedenti,
        
        e quelli prima ancora,
        
        ed ha fatto
        
        una suddivisione
        
        con accorpamento,
        
        1 more item...
  - - - da quando si è capito
        
        che sono
        
        2 cose diverse
- - - - usato,
  - - - punto qualcuno,
        
        lo ha iniziato a studiare,
        
        come ne hanno
        
        studiati altri,
  - - - è un po' l'eccellenza,
  - - - in molti,
        
        le informazioni relative
        
        su questo gene,
        
        sono disponibili
        
        sulle banche dati,
  - - - la sequenza del gene
        
        16S, di una qualunque
        
        forma microbica,
        
        di tutti i ceppi
        
        che son stati sequenziati,
        
        basta che mi collego,
        
        per es. sulla
        
        1 more item...
  - - - di fare dei progressi,
        
        nell'ambito
        
        della conoscenza,
        
        perchè tutte le informazioni,
        
        sono condivisibili
        
        per la comunità scientifica
  - - - circa 1500 nucleotidi
    - - per RNA ribosomale
        
        nella subunità piccola
        
        (la 30S)
        
        dove vi è il 16S
        
        mentre nella 50 S
        
        vi è il 23S
  - - - anche il 23S,
        
        che è una cosa
        
        che è stata fatta,
  - - - abbiamo che
        
        il DNA continua,
        
        ma dopo il gene 16S,
        
        ci sarà quello
        
        del 23S che
        
        è stato studiato,
        
        1 more item...
        
        e che quindi
        
        1 more item...
        
        però è fattibile,
        
        1 more item...
  - - - molte informazioni
  - - - e quindi è poca roba
        
        per fare dei confronti
  - - - perchè è presente
        
        in tutti i batteri,
        
        quindi se voglio fere
        
        un confronto
        
        tra un batterio
        
        e altri
        
        devo disporre
        
        1 more item...
  - - - per arrivare
        
        ad una analisi
        
        filogenetica
        
        devo partire
        
        da materiale comune,
  - - - e siccome è
        
        un gene importantissimo,
        
        perchè codifica
        
        per RNA dei ribosomi,
        
        che devono esse
        
        qualche cosa,
        
        2 more items...
  - - - come il 23S,
    - - sono fatti bene,
        
        quindi non ci sono
        
        motivi
        
        per cambiarli
  - - - ed hanno
        
        delle regioni in comune,
        
        tra tutti i batteri,
        
        presenti sulla terra
    - - vi sono
        
        delle regioni variabili,
        
        ovvero che sono
        
        diverse
        
        tra diversi gruppi
        
        di batteri,
        
        1 more item...
  - - - la sequenza di
        
        questo gene,
        
        per un microrganismo
        
        che mi interessa,
        
        posso poi
        
        poi mettere a paragone,
        
        con la sequenza
        
        di altri DNA 16S
        
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        e vedo quanto di assomigliano
  - - - del mio microrganismo,
      - e quello di altri
        
        già studiati,
        
        vanno a mostrare
        
        una omologia
        
        sopra il 97%,
        
        io posso dire
        
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  - - - è molto più semplice,
        
        di non fare quella
        
        la sequenza
        
        di tutto il genoma,
        
        pero questa ,
        
        del genoma ,
        
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    - - anche un modo
        
        diverso
        
        di aggire,
        
        confrontare i risultati,
        
        e procedure
        
        per arrivare
        
        al risultato