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Bactéries anaérobies pathogènes chez l'homme - Coggle Diagram
Bactéries anaérobies pathogènes chez l'homme
Introduction
Morphologie des bactéries -> tableau.
Coloration de GRAM et structure de la paroi bactérienne
Coloration : Gram - (paroi moins épaisse) => roses. Gram + (paroi épaisse) => violets.
Double mb (mb cytoplasmique interne et externe) chez Gram - donc pb de perméabilité et de diffusion des antibiotiques.
Bactérie composée d'un cytoplasme, d'une membrane plasmatique (ou 2) et d'un chromosome circulaire. Autour de tout ça paroi rigide qui est l'exosquelette constitué de peptidoglycane.
Peptidoglycane -> cible thérapeutique des béta-lactamines qui vont inhiber la forma° de la paroi bactérienne. Mais plus de mal à agir sur les Gram -.
Diff entre aérobie et anaérobie
Bactéries anaérobies ne supportent pas l'oxygène => pas de développement en présence d'oxygène.
99% du microbiote digestif est composé de bactéries anaérobies. Très peu sont pathogènes et le deviennent seulement si déplacées à un mauvais endroit ou chez des personnes très fragiles au niveau immunitaire (NN ou personnes âgées).
Dérivés de l'oxygène toxiques mais présente d'enzymes comme la catalyse et l'oxydase pour les détoxifier -> explique la présence des bulles si on met de l'eau oxygénée.
Pas de tolérance de l'oxygène car les dérivés de l'oxygène toxiques pour les bactéries. Ces bactéries ne possèdent pas d'enzymes pour détoxiquer les dérivés toxiques de l'oxygène (catalase et oxydase).
Approche concrète anaérobiose.
Classifica° des genres et des espèces
Bactéries commensales (microbiote -> endogène).
Cutibacterium acnes -> donne l'acné.
Les plus importantes sont les bactéridies du groupe faillis (40% car plus tolérante à l'O2) -> maladie bactérienne la plus fréquente du colon.
Localisées au niveau de la peau, de la sphère pro-paryngienne, la sphère vaginale et la sphère digestive.
Maladies en générale peu pathogènes sauf si brèche -> en générale polymicrobiennes à cause de la brèche et donne des infec° tropiques qui peuvent évoluer à bas bruit avec peu de fièvre. Ex : appendicite ou péritonite.
Chroniques = carie dentaire, sinusite chronique.
Bactérie "type" : genre Bacteroides -> espèce bactéridies fragilis.
Bactéries environnementales (exogènes).
Très pathogènes car elles produisent des toxines. Toutes du genre Chlostridium.
C. Tetani = Tétanos. C. Perfringens = Diarrhée. C. difficile = colite pseudo-membraneuse (antibio détruisent l'intestin). C. botulinum = botulisme.
Maladies thermostables (résistent à la chaleur) retrouvées particulièrement dans l'environnement, dans la terre ou le colon.
Infec° localisée + diffusion e la toxine (pas de la bactérie).
Plusieurs types de maladies bactériennes
Maladie vraie -> multiplica° de la bactérie dans un site.
Intoxica° -> avale la toxine.
Infec° mixte -> bactérie qui se reproduit et crée la toxine.
Maladies dysimmunitaiâes -> Ag bactériens qui ressemblent à ceux de l'hôte qui donne une maladie auto-immune (Syndrome de Guilain-Barré).
Bactéries sporulées
Clostridium = bactéries qui possèdent des spores (comme chez les plantes) -> les graines se dispersent jusqu'à ce qu'elles trouvent un environnement favorable pour éclore et se développer -> dissémina° grâce à l'air et résistance aux environnement non favorables au développement de la bactérie.
2 types de bactéries : Les aérobies strictes de type Bacilles (Gram +) et Les anaérobies stricts de type Clostridium (Gram +).
Spores = pb dans les milieux hospitaliers car résistants au désinfectant usuel -> risque d'épidémie hospitalière.
Lorsque bactérie dans un environnement défavorable -> transforma° en spores pour trouver un bon environnement.
Moment où la bactérie va devoir devenir sporule -> produc° de la toxine pathogène.
F° d'une spore bactérienne : essentiellement la même, mais endospores, 1 par cell bactérienne.
Cycle de réplica° "végétatif" : Nutriments abondants et T° idéale...
Sporula° : mise en hiberna° en situa° de stress. La bactérie se transforme en spore, prête à "éclore" si les circonstances sont à nouveau favorables à la vie végétative.
Étapes de forma° des spores
Déshydrata° progressive du cytoplasme.
Appari° de composés (dipicolinate de calcium).
Densifica° des structures nucléaires.
Synthèse d'une paroi spirale épaisse et imperméable, donc hautement résistante (chaleur).
La spore intra-bactérienne est libérée dans le milieu extérieur et y survit des années.
Dans des conditions° favorables (nutritives, thermiques et chimiques), elle redonne une cell végétative (germina°).
Tétanos (Clostriduium Tetani)
Bacile ubiquitaire (spores), produit une exotoxine neurotrope.
Touches les personnes non-vaccinées (NN) ou celles avec un système immunitaire affaiblit (malades ou personnes âgées).
Présent partout dans l'environnement sous forme de spores.
Rentre dans le corps si blessure/ coupure, petite plaie cutanée (jardinage), morsures...
Diffusion par voie sanguine et neurologique.
Entraine un blocage des neurotransmetteurs musculaires -> contrac° musculaire incontrôlée.
Fréquence 1M° de personnes par an dans le monde et 100 infec° par an en France.
Colite pseudomembraneuse (Clostriduim difficile)
Clostridioides difficile : germe ubiquitaire, transmis par ingestion de spores, se développe dans le colon.
Résistance à l'acidité gastrique.
Passage à la végétative dans le tractus digestif.
Facteur de risque = antibiothérapie = rupture de la f° barrière du microbiote intestinal.
Sécré° de 2 toxines cytologiques A et B -> Diarrhées, colite pseudomembraneuse, perfora° intestinales, péritonite...
Si culture des bactéries -> odeur très caractéristique.
Localisa° des bactéries de notre corps
Flore intestinale diff en f° de l'endroit de notre corps (flore orale ≠ flore intestinale).
Flore orale = anaérobiose complète et voit passer tous les aliments.
Flore intestinale = anaérobiose complète.
Différence de flores = ttt qui vont marcher à certains endroits et d'autres autre part.
Différentes cultures de bactéries
Bacteroides fragilis (BGN, flore digestive) donne des colonies crémeuses qui poussent rapidement (24h) mais qui résistent très bien.
Fusobacterium nucleatum (BGN, flore digestive et oropharygnée).
Fusobacterium necrophorum (BGN, flore oropharygnée). Cette bactérie tue.
Cutibacterium (Propionibacterium) accès (bacille à Gram +, acné). Elle se divise rapidement et est visible regroupée car les celles n'ont pas le temps de se détacher.
Germes en cause selon le type d'infec°
Flore anaérobie digestive -> infec° intra-abdominales.
Flore anaérobie oropharyngée -> Infec° en ORL.
Bases du ttt des infec°
Antibiothérapie des infec° endogènes à germes anaérobies
Antibiotiques à spectre large incluant les germes anaérobies +++ : Bétalactamines +/- inhibiteurs des bétalactamases.
Anti-anaérobies exclusif = famille des azotés (metronidazole) : ne peut pas être utilisé seul (infec° polymicrobiennes). Aucune activité sur les bactéries aérobies. Toujours utilisé en associa°.
Connaitre tous les ttt pour traiter une flore -> car diff bactéries.
TTT ciblé lorsque les analyses seront arrivées.
Antibiotiques inefficaces sur les anaérobies : Aminosides, Témocilline et aztreonam, Fosfomycine, Acide nalidixique, ofloxacine et ciprofloxacin et Trimethoprime.
Bactéroides du groupe fragilis
Quasi-totalité des germes anaérobies sont sensibles à l'amoxicilline sauf notamment B. fragilis.
Résistance naturelle à l'amoxicilline et aux céphalosporines de 3ème généra° +++.
B fragilis
Principale bactérie anaérobie retrouvées dans les infec° anaérobies.
Habitat : côlon.
Céphalosporinase inhibée par les inhibiteurs des bétalactamases.
TTT de base des infec° "sous diaphragmatiques" incluant des germes anaérobies : Amoxiciline + inhibiteur de bétalastamase et Céphalosporine (plus large spectre) + metronidazole.