Eles podem se formar por fatores como a supersaturação da urina (quando ela está muito concentrada em determinado soluto, como o cálcio), pela deficiência de inibidores de cálculos (como o citrato que atua como inibidor de cálculos de oxalato de cálcio, pela redução de cálcio iônico disponível, reduzindo a precipitação, agregação e crescimento), doenças metabólicas que desencadeiam a excreção exagerada de alguns sais da urina (como o de ácido úrico ou da glândula paratireoide), alterações anatômicas e obstrução das vias urinárias.
