Su estructura más compleja es el aparato reproductor. Son hermafroditas, por lo que son capaces de autofecundarse, sin embargo, no es habitual. La mayoría tiene uno o más de un par de testículos, distribuidos por todo su cuerpo, que conduce a un pene. Los ovarios, también numerosos, se situan detrás de la cabeza. Son ovíparos, y de los huevos suelen salir crías inmaduras de menor tamaño.
