Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
สารชีวโมเลกุล Biomolecule - Coggle Diagram
สารชีวโมเลกุล Biomolecule
กรดอะมิโน (Amino acids) และโปรตีน (Proteins)
ปฏิกิริยาของกรดอะมิโนและโปรตีน
Ninhydrin ใช้ทดสอบกรดอะมิโนและโปรตีน ได้สารเชิงซ้อนสีน้ำเงิน
Sanger's reagent ใช้ทดสอบกรดอะมิโนและโปรตีน ได้สารสีเหลือง
Dansyl chloride ใช้ทดสอบกรดอะมิโนและโปรตีน ได้สารเรืองแสงสีเขียวหรือ น้ำเงิน-เขียว
Biuret ใช้ทดสอบพันธะเปปไทด์ ได้สารสีม่วง
Conformation of protein
Primary structure (โครงสร้างปฐมภูมิ) แสดงลำดับการเรียงตัวของกรดอะมิโน
Secondary structure (โครงสร้างทุติยภูมิ) มีพันธะไฮโดรเจนยึดสายของเพปไทด์
โครงสร้างแบบพับจีบ (Pleated-sheet structure)
แบบเกลียว (Helix structure)
Tertiary structure (โครงสร้างตติยภูมิ) เป็นก้อนมีทั้งโครงสร้างแบบเกลียวและแบบพับจีบ
Quaternary structure(โครงสร้างจตุรภูมิ)มีมากกว่า 1 ก้อน
การจำแนกประเภทของโปรตีน
composition (องค์ประกอบ)
simple protein มีเฉพาะกรดอะมิโน
conjugated protein มีสารอื่นด้วย (prosthetic group)
3-Dimensional structure (โครงสร้าง 3 มิติ)
fibrous protein (โปรตีนเส้นใย) ลักษณะยาว เรียงตัวขนาน ไม่ละลายน้ำ ทนต่อเอนไซม์เหนียว ทำหน้าที่เป็นโครงสร้าง เช่น เคราทิน ไฟโบอิน คลอราเจน
globular protein (โปรตีนเส้นใย) ก่อนข้างกลม ละลายน้ำ ย่อยสลายง่ายด้วยกรดและ
เอนไซม์ เช่น เอนไซม์ แอลบูมิน ฮีโมโกลบิน
Function (หน้าที่)
เสริมโครงสร้าง (Mechanical support)
ป้องกัน(Defense)
การเคลื่อนไหว(Movement)
ควบคุม(Regulation)
สะสม (storage)
ขนส่ง (Transport)
ตอบสนองต่อการกระตุ้น(Stress response)
เร่งปฏิกิริยา(Catalysis)
เอนไซม์
การเรียกชื่อเอนไซม์
เติม ase ลงท้ายชื่อปฏิกิริยา
เติม ase ลงท้ายชื่อซับสเตรท
การจัดประเภทเอนไซม์
Oxidoreductase : เร่งปฏิกิริยา Oxidation-reduction (ถ่ายทอดอิเล็กตรอน)
Transferase : เร่งปฏิกิริยาการย้ายหมู่ที่ไม่ใช่ H (เช่น-NH2, -C=O , -CH3)
Hydrolase : เร่งปฏิกิริยาการย่อยสลายด้วยน้ำ
Lyases : เร่งปฏิกิริยาการตัดพันระ C-C, C-S, C-N และเติมหมู่ธาตุเข้าพันธะคู่
Isomerase : เร่งปฏิกิริยาการเปลี่ยนไอโซมอร์
Ligase : เร่งปฏิกิริยาการสร้างพันธะ(C-C, C-S , C-O, C-N )
แบบจำลองการทำงานของเอนไซม์
lock and key model แบบจำลองแบบแม่กุญแจและลูกกุญแจ
Induced Fit model แบบจำลองแบบเหนี่ยวนำให้พอดี
ปัจจัยที่มีผลต่อการทำงานของเอนไซม์
ความเข้มข้นของสารตั้งต้น (Substrate Conentration) อัตราเร็วของปฏิกิริยจะเพิ่มขึ้น แต่จะถึงจุดอิ่มตัว
ความเข้มข้นของเอนไซม์ (Enzyme Concentration) อัตราเร็วของปฏิกิริยาจะเพิ่มขึ้น
ความเป็นกรด -ด่าง (pH) โดยทั่วไป Optimum pH = 5-9
อุณหภูมิ (Temperature) ส่วนใหญ่ optimum temperature ประมาณ 30 องศา
ตัวยับยั้ง (Inhibitor) คือสารเคมีซึ่งลดอัตราการเร่งของเอนไซม์
กรดไขมัน (fatty acid)
พิจารณาตามความจำเป็นต่อร่างกาย จำแนกได้เป็น 2 ประเภท
กรดไขมันจำเป็น (essential fatty acid)
เป็นกรดไขมันที่ร่างกายสร้างไม่ได้แต่มีความสำคัญและจำเป็นต่อการดำรงชีวิต มี 2 ชนิด คือ
กรดลิโนเลนิก (linolenic acid) เป็นสารตั้งต้นของกรดไขมันชนิดโอเมกา
กรดลิโนเลอิก(inoleic acid) เป็นสารตั้งต้นของกรดอะราชิโดนิก (Arachidonic acid)
ไม่ใช่กรดไขมันจำเป็น (nonessential fatty acid)
เป็นกรดไขมันที่ร่างกายสร้างขึ้นเองได้ เช่น กรดสเตียริก (stearic acid) กรดโอเลลิก(oeic
acid) กรดปาลมิติก (palmitic acid) เป็นต้น
การศึกษาสมบัติทางเคมีของไตรกลีเซอไรด์
เลขไอโอดีน (lodine Number) วัดความไม่อิ่มตัวของลิพิด
เลขซาพอนนิฟิเคชัน (Saponification number) ค่าสูง มีเปอร์เซ็นต์ไตรกลีเซอไรด์ที่มีโซ่สั้น ๆ และน้ำหนักโมเลกุลต่ำจำนวนมาก
ปฏิกิริยาไฮโดรลิซีส (Hydrolysis) การแยกสลายด้วยน้ำของไตรกลีเซอไรด์ ได้กลีเซอรอล และ กรดไขมัน
ปฏิกิริยาชาปอนนิฟิเคชัน (Saponification) ทำปฏิกิริยากับเบสแก่ เช่น โซเดียมไฮดรอกไซด์(NaOH)
ปฏิกิริยาไฮโดรจีเนชัน (Hydrogenetion) การเติมไฮโดรเจนในกรดไขมันชนิดไม่อิ่มตัวที่ตำแหน่งพันธะคู่
ลิพิดเบ็ตเตล็ด
ไข (wax) หรือขี้ผึ้งเป็นเอสเทอร์ของกรดไขมันกับแอลกอฮอล์ที่มีจำนวนคาร์บอนสูง(14-16 C atom) พบตามผิวหนังของสัตว์ เคลือบใบไม้และผลไม้ ไม่ละลายน้ำ
ฟอสโฟลิฟิค (Phospholipid) เป็นเอสเทอร์ของกลีเซอรอลกับกรดไขมัน 2 กลุ่ม ส่วนกลุ่มที่ 3เป็นกรดฟอสฟอริก ละลายน้ำอยู่ในรูป micell เช่น phosphatidylserine
สฟิงโกลิปิด(Sphingolipids) รวมกันของสฟิงโกชายน์ (Sphingosine) กับกรดไขมันและหมู่ฟอสเฟต ได้แก่ Sphingomyelin , Cerebroside , Ganglioside
เทอร์พีน (Terpene) ประกอบด้วย Isopene 2 หน่วย
สเตียรอยด์ (Steroids) เช่น คลอเรสเตอรอล สเตียรอยด์ฮอร์โมน
ไอโคซานอยด์ (Eicosanoid) ได้แก่ Prostaglandin Thromboxane Leukotriene
Carbohydrates (glycans)
Monosaccharides
น้ำตาลโมเลกุลเล็กสุด มี OH groups หลายหมู่ขึ้นกับจำนวน carbons (3, 4, 5, 6) triose, tetrose, pentose or hexose
Oligosaccharides
a few monosaccharides covalently linked (2-10 molecule)
Disaccharides
2 monosaccharides covalently linked
Disaccharides
สายโซ่ polymers ของ monosaccharide or disaccharide units
Derivative of carbohydate
เกิดจาก reaction of carbohydrate
Sugar alcohol - หมู่ aldehyde or ketone ถูกแทนที่ด้วย OH มีรสหวานเช่น Gycerol Inositol Sorbitol
Sugar acid - หมู่ aldehyde at C1, หรือ OH at C6, ถูก oxidized เป็น carboxylic acid; เช่น gluconic acid, glucuronic acid, ascorbic acid
Amino sugar - หมู่ amino แทนที่หมู่ hydroxyl
Sugar deoxy - ไม่พบ O ของหมู่ -OH ที่พบมากคือ 2-deoxyribose เป็นองค์ประกอบของ DNA
Sugar ester - เกิดจากปฏิกิริยาเอสเทอริฟิเคชั่น ของโมโนแซคคาไรด์