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ACIDI NUCLEICI - Coggle Diagram

- - - - Base
        
        Pirimidine(C,T,U) 1
        
        Purine (A,G) 2
      - Zucchero (desossi/ribosio)
    - - legami covalenti fosfodiesterici
- - - - 2x T-A
      - 3x C-G
  - - - Solco maggiore
      - Solco minore
- - - - GUANINA
      - URACILE
  - - - CITOSINA
      - ADEININA
      - TIMINA
- - - - attratte da DNA
    - - NUCLEOSOMA
        
        unità strutturale cromatinica
        
        avvolge intono a Rocchetto istonico
        
        8 molecole di istoni
        
        l'H1 si trova esternamente, collega DNA e altri istoni
      - SPIRALIZZAZIONE
        
        strutture viavia più complesse
        
        spire superavvolte (4 ordini
        di avvolgimento) della cromatina
        
        cromosoma (5 ordine)
        
        visibile solo durante la riproduzione cellulare.
- - - - zona di unione
      - prevalentemente istoni
- - - - Autosomi (coppie 1-22)
      - C. Sessuali (coppia 23)
- - - - circolare
      - 1 molecola Dna
      - libro in zona citoplasma
        
        Nucleoide
  - - - nel NUCLEO
      - sequenze ripetute
      - parti non codificanti
- - - - frammenti genetici
    - - sequenze ripetute
- - - - un solo filamento (T. I)
      - entrambi i filamenti (T. II)
    - - studio per inibizione replicazione cellule tumorali
  - - - sintetizzato in continuità
      - 1 innesco (Primer)
        
        necessari
        
        DNA-Polimerasi
        
        Catalizzatori replicazione
        
        possono solo aggiungere nucleotidi a filamento preesistente
        
        solitamente RNA
        
        xkè RNA polimerasi non serve innesco
        
        sintetizzate da Primasi (specifiche RNA polimerasi)
        
        si legano a filamenti stampo
        
        si legano a DNA in direzione 5'->3'
        
        discontinuo sul filamento rin ritardo
        
        degradati da Polimerasi I o RNAasi H specializzate
    - - Bolla Replicativa
    - - sintetizzato in direzione opposta
        
        frammenti Okazaki
        
        inizia vicino alla forca replicativa
        
        vari inneschi (Primers)
        
        Enzima: DNA polimerasi III
      - iniziamene diversi filamenti
  - - - Scinde il filamento
    - - impediscono la riunione tra i due filamenti
  - - - rimane costante grazie allla telomerasi
- - - - Polipeptidi
- - - - DNA->citoplasme
    - - pre-mRNA o trascritto primario
      - RNA maturo
    - - Fasi
        
        fattore sigma riconosce il promotore e si lega con RNA polimerasi svolge il DNA (complesso aperto)
        
        via sigma, RNA p. legge DNA(3'->5') produce mRNA con ribonucleotidi
        
        sito di terminazione= si stacca
      - nel nucleo
    - - nel citoplasma
  - - - luogo di sintesi delle proteine
      - struttura
        
        Sub-unità Minore
        
        sito per l'mRNA
        
        Sub-unità Maggiore
        
        tre siti DCA per mRNA-tRNA interation
  - - - dove si Carica di un AMMINOACIDO
        
        enzima: Aminoacil-tRNA-sintetasi
    - - associa al mRNA
- - - - variano solito ultima base azotata
  - - - sito A riconoscimento codone
      - arrivo anticodone tRNA
      - legame peptidico fra i due AA
      - scorrimento, 1* tRNA in sito D=rilascio
    - - Codone di stop in sito A
      - fattore di rilascio si lega
      - stacca polipeptide da ultimo tRNA
      - si separa tutto
    - - subunità minore lega con mRNA(sito di legame)
      - Codone d'inizio
        
        tRNA con metionina si lega
      - SUbunità maggiore con trna nel sito C
- - - - singolo gene
      - variazione sequenza DNA (pochi nucleotidi)
        
        errori nella duplicazione
        
        proteine funzionalità alterata
      - tipi
        
        Silente
        
        stessi AA risultanti
        
        Non Senso
        
        risulta solo un AA non proteina
        
        di Senso
        
        diversa proteina perché c'è un diverso AA
        
        per Scorrimento della finestra di lettura
        
        aggiunta di una base non poresente
        
        dopo punto dell'inserzione AA modificati
    - - intero genoma, cambiamento numero dei cromosomi
    - - interi cromosomi
      - errori durante mitosi o meiosi
      - tipi
        
        Delezione
        
        assenza di un tratto = perdita materiale genetico
        
        Duplicazione
        
        raddoppiamento di un tratto
        
        frammento cromosoma si lega all'omologo
        
        Inversione
        
        rottura filamento cromosomico in 2 punti
        
        reincorporato con orientamento inverso
        
        Traslocazione
        
        scambio di parti tra cromosomi non omologhi
- - - - segmento di DNA
      - interruttore di regolazione di uno o più geni
    - - prodotto di un gene regolatore separato
      - attivo o inattivo
    - - coopera con repressore
      - attivare operone spento
    - - tratto DNA regola espressione genica
      - comprende
        
        1 o+ Geni Strutturali
        
        Promotore
        
        Operatore
        
        a cui si lega Repressore
      - tipi
        
        Reprimibile
        
        solitamente attivo
        
        vie anaboliche, represso quando tanto prodotto finale
        
        Inducibile
        
        solitamente spento
        
        induttore inattiva il repressore
        
        vie cataboliche, indotto da segnale chimico
  - - - S. moderatamente ripetitive
        
        codificare istoni o rRna
      - DNA microsatellite
        
        s. molto corte
        
        disposte in tandem
      - s. altamente ripetitive
        
        +lunghe e 40%del genoma
    - - el. genetici capaci di spostarsi nel genoma
    - - sequenze codificanti
    - - sequenze non codificanti
      - eliminate nel mRNA maturo
      - Anse
    - - prima della trascrizione
        
        regioni compatte non trascritte
        
        metilazione
        
        causare inattivazione
        
        erdità epigenetica (non s. nucleotidi)
        
        acetilazione
        
        lega gruppi acetili a code degli stoni
        
        struttura più lassa
        
        rimodellamento cromatina
        
        nucleosomi si disgregano
      - nel nucleo o nel citoplasma
      - durante la Trascrizione
        
        Trascrizione differenziale
        
        regolazione avvio trascrizione
        
        enzimi influiscono parte DNA più o meno in
        grado di legare il complesso della trascrizione
        
        tipi sequenze
        
        Silenziatore
        
        legare i repressori
        
        impedisce legame con RNA polimerasi
        
        Esaltatori(Enhancers)
        
        stimolo alla trascrizione
        
        Isolatore(Insulator)
        
        blocca interazioni esaltatori-promotori
        
        dal Pre-mRNA all'mRNA maturo
        
        Capping
        
        cappuccio di guanosina a estremità 5'
        
        Easy adesione ribosoma e uscita nucleo
        
        Coda di Poli-A
        
        catena poliadenilica in 3'
        
        favorisce stabilità e inizio traduzione
        
        SPLICING
        
        eliminazione introni e unione esoni
        
        fasi
        
        interazione 2 snRNP=
        
        Spliceosoma
        
        1 more item...
        
        Particelle di ribonucleoproteine snRNP si legano estremità introni
        
        Taglio fra esone 5' e introne
        
        OH libero nell'estremità tagliata 3' reagisce con estremità 5' dell'esone 3'
        
        esone 3' tagliato e riunito al 5'
        
        introne viene degradato nel nucleo
        
        S. ALTERNATIVO
        
        in eucarioti da un singolo gene mRNA diversi
        
        fattori di trascrizione
        
        determinano se e quando RNA polimerasi agisce
        
        attraverso il ripiegamento del DNA proteine attivatrici legate a sequenza amplificante distanti dal promotore prendono contatto con il complesso di trascrizione
        
        necessari per iniziare trascrizione
        
        elementi di comando prossimali
        
        1 more item...
        
        elementi di comando distali(esaltatori)
        
        1 more item...
        
        attivatore si lega ad esaltatori e attiva trascrizione
        
        diverso tessuto diverso splicing, esoni mancanti
        
        Coordinazione fra geni
        
        Segnale ambientale induce sintesi di una proteina regolatrice
        
        Amplificazione Genica
        
        più copie stesso gene
        
        prodotto di un gene richiesto in grandi quantità
      - prima della traduzione
        
        fattori di inziazione (miRNA siRNA) impediscono tarduzione specifici mRNA
        
        miRNA (micro)
        
        piccole molecole endogene di RNA inglobati complesso silenziamento
        
        siRNA(small interfering)
        
        inibizione espressione singoli geni
        
        demolizione proteine segnate da Ubiquitina