Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Kryptingos baltymų evoliucijos etapai - Coggle Diagram
Kryptingos baltymų evoliucijos etapai
1.
Genų diversifikacija
(mutagenezė)
Orientuota mutagenezė (angl. focused mutagenesis)
Atsitiktinė mutagenezė (angl. random mutagenesis)
In vivo
Necheminiai agentai
Cheminiai ir fiziniai agentai
UV
Etilo metansulfonatas (EMS)
Azoto rūgštis
Baziniai analogai, tokie kaip 2-aminopurinas
In vitro
Klaidingas PGR (angl. error-prone PCR)
Naudojama polimerazė mutacijoms sukurti, klaidingai įterpiant nukleotidus DNR replikacijos metu
Sekos prisotinimo mutagenezė (SeSaM) (an
gl. Sequence Saturation Mutagenesis). Sukuria daugybę atsitiktinių pavienių nukleotidų mutacijų tam tikroje genų sekoje
Diversifikacija rekombinacijos būdu (angl. Diversification by recombination)
DNR maišymas
(angl. DNR shuffling)
Random Chimeragenesis on Transient Templates (RACHITT)
Pakopinis pratęsimo protokolas (StEP)
(angl. Staggered Extension Protocol)
Surinkimo PGR arba sintetinis maišymas
(angl. Assembly PCR or synthetic shuffling)
Pavienis sutrumpinimas hibridinių fermentų kūrimui (ITCHY)
(angl. Incremental Truncation for the Creation of Hybrid Enzymes)
Nehomologinė atsitiktinė rekombinacija (NRR)
(angl. Non-homologous random recombination)
sekos homologija - nepriklausoma baltymo rekombinacija (SHIPREC)
(angl. sequence homology- independent protein recombination)
Atranka
(angl. screening)
Erdviškai atskirtų klonų atranka
(angl.Screens of spatially separated variants)
Fluorescenciniai ir kolorimetriniai indikatoriai matuojami automatiniais mikrotitrinių plokštelių skaitytuvais
Branduolinis magnetinis rezonansas (BMR)
Didelio efektyvumo skysčių chromatografija (HPLC)
Dujinė chromatografija
Masių spektrometrija
Didelio pralaidumo atranka naudojant srauto citometriją
Fluorescenciniu būdu aktyvuotų ląstelių rūšiavimas (FACS)
(angl. Fluorescence-activated cell sorting)
Yeast display metodas
Dirbtinių kompartmenų atranka
(angl.screening artificial cell-like compartments)
Vandens ir aliejaus kompartmentai
Shell-like kompartmentai
3. Tinkamą požymį turinčių baltymų atranka
(antrinė, pakartotina atranka ir tinkamų požymių pasirinkimas tolimesniem tyrimam)
Giminingu prisijungimu paremta atranka
(angl. selections for binding affinity)
Ląstelių paviršiaus žymenimis paremta atranka
(angl. cell surface display)
Phage display (fagų atranka paremtas) metodas
Ribosomomis paremtas atrankos metodas
(angl.ribosome display)
iRNR paremtas atrankos metodas
Atranka, paremta organizmo išgyvenamumu
Atsparumu antibiotikams paremtas metodas
Auksotrofijos komplementacija paremtas metodas
Atranka
in vitro
kompartmentuose
Compartmentalized self-replication (CSR
)
Compartmentalized partnered replication (CPR)