Peipsi järv pakub elukohta ka loomaliikidele, poolveelistele imetajatele, kes on seotud kaldaga. Sellisteks on kobras, saarmas, ondatra, vesimutt, mügri. Kahepaiksed on Peipsi rannikul esindatud üheksa liigiga: tähnik- ja harivesilik, mudakonn, rohekärn - konn, kärnkonn, rohukonn, rabakonn, tiigikonn ja veekonn. Roomajad on esindatud 5 liigiga: kivi- ja arusisalik, vaskuss, nastik ja rästik.